New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2276019 = | 47 (1.080) | 10 (0.240) | 10/250 | 3.2 | 17.7% | coding (1346/1644 nt) | PP_2006 | membrane protein |
? | NC_002947 | 2276062 = | 49 (1.200) | coding (1303/1644 nt) | PP_2006 | membrane protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGAT > NC_002947/2275914‑2276206 | ttgGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAAtt > 1:651340/1‑150 (MQ=255) gTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGCCGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcg > 1:519906/1‑150 (MQ=255) ccccACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCa < 1:653239/150‑1 (MQ=255) aCCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGAGGCTGACAACGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCCTCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGAt < 2:417140/150‑1 (MQ=255) cccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATg < 1:118431/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGtgat < 2:519906/150‑1 (MQ=255) tCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACTGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGacc > 2:199692/1‑150 (MQ=255) gatgatCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGaccac > 1:142592/1‑150 (MQ=255) gatgatCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGaccac > 1:855705/1‑150 (MQ=255) ggATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTgg < 2:874382/147‑1 (MQ=255) ggATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTgg > 1:874382/1‑147 (MQ=255) gATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAt < 1:668674/150‑1 (MQ=255) gATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATACCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAt < 2:307335/150‑1 (MQ=255) tGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgt < 2:142592/150‑1 (MQ=255) gACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGaccac > 1:112604/1‑135 (MQ=255) gACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGaccac < 2:112604/135‑1 (MQ=255) aCGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtct < 1:660636/150‑1 (MQ=255) gATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgt > 1:378518/1‑150 (MQ=255) aTGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAtgtctgtc < 1:409743/150‑1 (MQ=255) cAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGtttt < 2:913586/150‑1 (MQ=255) cAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGtttt < 2:651340/150‑1 (MQ=255) cAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGtttt < 2:368768/150‑1 (MQ=255) tGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGa < 1:828173/150‑1 (MQ=255) ggCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTg > 2:911754/1‑147 (MQ=255) ggCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTg < 1:911754/147‑1 (MQ=255) caccaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATc > 1:410423/1‑150 (MQ=255) ccaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCg > 2:481165/1‑150 (MQ=255) caACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGtc > 2:726900/1‑150 (MQ=255) aCGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGtctc < 2:871279/150‑1 (MQ=255) tGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGAc > 2:984848/1‑150 (MQ=255) gatgatGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCAt < 2:410423/150‑1 (MQ=255) gatgCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGc < 1:136179/150‑1 (MQ=255) tgCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGAGGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCat < 1:398325/150‑1 (MQ=255) acgaTCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATAcc > 2:139064/1‑150 (MQ=255) cgaTCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCa < 1:726900/150‑1 (MQ=255) cAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCAc < 2:378518/150‑1 (MQ=255) cATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGATGTGTTGCACCCAGGTGTCGAGGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTc < 1:944095/150‑1 (MQ=255) tCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGc > 2:712957/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCAt > 2:491370/1‑123 (MQ=255) cTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCAt < 1:491370/123‑1 (MQ=255) cccACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTg > 1:181808/1‑150 (MQ=255) ccACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATTACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGa < 2:686728/150‑1 (MQ=255) cGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTg < 2:181808/150‑1 (MQ=255) ccACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGAAGACCAGCTGCa < 2:855705/150‑1 (MQ=255) ggcggTGGCCACTGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGt < 1:199692/150‑1 (MQ=255) ccACGGCGGCAATTGCGCGCAGGATGGCGTGGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCAGACCATGGCATATACCAGCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTTGCGCCCAGTTGTAGCGTCTGCTTgg < 2:347380/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGCAATTGCGCCGAGGATGGCTTCGGAGATAACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTg > 1:1020433/1‑150 (MQ=255) aCGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTg > 1:812032/1‑150 (MQ=255) cggcggCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGa < 2:332710/150‑1 (MQ=255) ggcAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGAt > 2:272245/1‑150 (MQ=255) ggcAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGAt > 2:972462/1‑150 (MQ=255) ggcAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGAt > 2:272178/1‑150 (MQ=255) | TTGGTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGTGGCGATGTCTGTCGTGTTTTGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGAT > NC_002947/2275914‑2276206 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |