New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4075786 | NA (NA) | 87 (0.920) | 56/248 | 0.8 | 100% | intergenic (‑328/+113) | PP_3586/tpx | transposase/2‑Cys peroxiredoxin |
? | NC_002947 | = 4957611 | 0 (0.000) | intergenic (‑49/+114) | fliH/fliG | flagellar assembly protein FliH/flagellar motor switch protein |
CCCTAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTAGTTCGG > NC_002947/4075650‑4075934 | cccTAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGAt < 2:2443567/150‑1 (MQ=32) cccTAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGAt < 2:1437246/150‑1 (MQ=32) cccTAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGAt < 1:1586770/150‑1 (MQ=32) ccTAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATg < 2:137066/150‑1 (MQ=32) aCAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTcac > 2:2053052/1‑150 (MQ=35) cAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTcaca > 2:9802/1‑150 (MQ=37) aaaGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAg < 2:253077/150‑1 (MQ=38) aGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑aa > 1:1512755/1‑150 (MQ=255) gcggcTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑aaaa < 1:1280974/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCtt > 2:385431/1‑139 (MQ=255) tGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCtt < 1:385431/139‑1 (MQ=255) ggCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGc < 2:1436007/150‑1 (MQ=255) cTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTTCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGcc > 2:400084/1‑149 (MQ=255) aCCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACg > 1:1147013/1‑150 (MQ=255) cGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAACATGTCAGCGTTGCTGGGGAACTGAAGCCGTACCCCTCATGTTTGCTGCGCGATAGCGCATCCTGGAAGGGTTGGTTTATCTCCTACGGGGATGATACCCCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGtg > 2:2148332/1‑149 (MQ=14) cGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCGCGtt < 2:1355072/150‑1 (MQ=255) gggCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTg > 1:1987359/1‑150 (MQ=255) ggCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACtgt > 1:978169/1‑138 (MQ=255) ggCCAAACGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACtgt < 2:978169/138‑1 (MQ=255) aaCCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGa > 2:349268/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACTTGGATTTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAg > 2:178457/1‑150 (MQ=18) aCCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAg > 2:574602/1‑150 (MQ=255) gCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCgg < 2:2418998/150‑1 (MQ=255) gCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGACGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCgg < 2:1859289/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCggg > 2:363501/1‑150 (MQ=255) ccTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCggg < 2:793821/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCggg < 1:2053052/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCggg < 1:574602/150‑1 (MQ=255) ttttcttttTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGtt < 1:363501/150‑1 (MQ=255) tttttCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 1:2148055/1‑150 (MQ=255) tttttCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:2105277/1‑150 (MQ=255) ttttCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCcg < 1:1351659/150‑1 (MQ=255) tttCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:2105277/150‑1 (MQ=255) aaaaTGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 1:401882/1‑150 (MQ=255) aaaTGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:1459666/150‑1 (MQ=255) aaTGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 2:1512755/150‑1 (MQ=255) aaTGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 1:9802/150‑1 (MQ=255) tGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:178457/150‑1 (MQ=255) tCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa < 1:859053/150‑1 (MQ=255) tCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa < 2:1147013/150‑1 (MQ=255) aGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGc > 2:1610811/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAg < 1:349268/150‑1 (MQ=255) gCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTAc < 1:586664/150‑1 (MQ=255) cGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCtt > 2:2538058/1‑88 (MQ=255) cGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCtt < 1:2538058/88‑1 (MQ=255) 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gTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTg > 2:1959020/1‑150 (MQ=255) tACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGTATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGc < 2:2309339/150‑1 (MQ=255) tACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGc < 2:651626/150‑1 (MQ=255) tACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGc < 1:1388835/150‑1 (MQ=255) acCTCCTGGTTGCTGGGCGACAGCGCAGCCGGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGcccc < 1:2194608/150‑1 (MQ=38) 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tcgcgcAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTa < 2:264692/148‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTAcag < 1:2148332/150‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTAcagc > 1:2269031/1‑150 (MQ=255) aGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTAcagcca > 1:684675/1‑150 (MQ=255) cccGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCggg < 2:1750701/74‑1 (MQ=255) cccGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCggg > 1:1750701/1‑74 (MQ=255) cccGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTAcagccagc > 2:1032079/1‑150 (MQ=255) ccGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACtgtg < 2:1588564/53‑1 (MQ=255) ccGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACtgtg > 1:1588564/1‑53 (MQ=255) gggCTGGGTGATCTCGTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGGACAGCCAGCGCCGCCt < 2:989824/150‑1 (MQ=255) gggCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCa < 1:2050335/132‑1 (MQ=255) gggCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTAATTCa > 2:2050335/1‑132 (MQ=255) gCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCTCAGGCTACACTCGCCCGCCCTGCCCCACACAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCg < 2:803109/150‑1 (MQ=39) tGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCAGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCt < 1:679559/121‑1 (MQ=255) tGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCAGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCt > 2:679559/1‑121 (MQ=255) tGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTAc < 2:333954/89‑1 (MQ=255) tGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTAc > 1:333954/1‑89 (MQ=255) tGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGcc < 2:641226/105‑1 (MQ=255) tGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGcc > 1:641226/1‑105 (MQ=255) gATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAAt < 2:1170596/113‑1 (MQ=255) gATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAAt > 1:1170596/1‑113 (MQ=255) aTCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTAGTTCgg < 1:1032079/150‑1 (MQ=255) | CCCTAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTG‑AAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTAGTTCGG > NC_002947/4075650‑4075934 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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