| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4861197 | 32 (1.080) | 9 (0.380) | 5/196 | NT | 23.2% | intergenic (‑103/+134) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| ? | NC_002947 | = 4861238 | 34 (1.450) | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA | |||||
TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGT > NC_002947/4861048‑4861345 | tGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 2:495682‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGc‑cc > 1:397009/1‑150 (MQ=255) cGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTa < 1:288218/150‑1 (MQ=255) gAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAg > 1:593816/1‑150 (MQ=255) tACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTACACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCgg < 1:646328/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCggag > 1:352558/1‑148 (MQ=255) aTGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggag < 2:62725‑M2/150‑5 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagc < 1:282890‑M2/150‑6 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagc > 1:284188‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagc < 2:3390‑M2/150‑6 (MQ=255) gggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcg > 2:593816‑M2/1‑144 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGGGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAATCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgg > 1:338322‑M2/1‑143 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg < 1:130390‑M1/150‑49 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgg > 1:62725‑M2/1‑143 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgg > 2:146186‑M2/1‑143 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagccg > 2:397009‑M2/1‑143 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggt < 2:193699‑M1/150‑51 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGCGCCCCCCTGTTCGCGGGTAAACCCTCTGCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggt < 1:495682‑M1/150‑51 (MQ=255) tttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCTAGCATCTGCCCTGGTAAAACCACCTCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtt < 2:585921‑M2/150‑11 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacc < 2:694940‑M2/150‑15 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacc > 1:774376‑M1/1‑93 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacc < 2:774376‑M1/148‑56 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCcacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg < 1:713127‑M1/132‑49 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCcacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg > 2:713127‑M1/1‑84 (MQ=255) agcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 1:726023/1‑150 (MQ=255) gcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAggg > 2:373956/1‑106 (MQ=255) gcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAggg < 1:373956/106‑1 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAg < 2:625591/84‑1 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAg > 1:625591/1‑84 (MQ=255) gTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgc < 1:59692‑M2/109‑18 (MQ=255) gTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgc > 2:59692‑M2/1‑92 (MQ=255) gTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCa > 1:315417/1‑150 (MQ=255) aGGTGTCTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg < 1:351517‑M1/94‑49 (MQ=255) aGGTGTCTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg > 2:351517‑M1/1‑46 (MQ=255) tCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTc > 1:239421/1‑150 (MQ=255) gTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAgg > 2:417648/1‑150 (MQ=255) aCTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctgc > 2:668545/1‑150 (MQ=255) tgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCtt < 1:3390/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCt > 2:104086/1‑137 (MQ=255) gCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCt < 1:104086/137‑1 (MQ=255) cctgtctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGA‑CCGAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 1:249767/145‑1 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 1:668545/150‑1 (MQ=255) tccTCTTCTCGGGTATCCCCGCCCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTc < 1:393970/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCt < 1:417648/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCACCAAGCGCCTCCCGTGCTCGTTGCACTGGGA‑GGGCGGGTAGGAGCGTTTGTACCCTCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTg > 2:690084/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCCCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTgg > 2:237950/1‑150 (MQ=255) ctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGa < 2:354873/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGc > 2:160647/1‑117 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGc > 2:589073/1‑117 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGc < 1:589073/117‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGc < 1:160647/117‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaac > 2:59692‑M1/1‑17 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaac < 1:59692‑M1/109‑93 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGt < 1:694940/150‑1 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaaga < 2:694940‑M1/150‑137 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaa < 2:774376‑M2/148‑94 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaa > 1:774376‑M2/1‑55 (MQ=255) aaCCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtggaggtggttttaccagggcagatgctagcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaa < 2:585921‑M1/150‑141 (MQ=255) aaCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcgc < 2:756129/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaat < 2:193699‑M2/150‑101 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAgcagagggtttacccgcgaacaggggggcgcagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaat < 1:495682‑M2/150‑101 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAGCCGCACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTATCAgcgcct > 2:159500/1‑148 (MQ=255) cggctCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcc > 2:397009‑M1/3‑7 (MQ=255) ccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcc > 1:62725‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcc > 2:146186‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggattacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgcccttttgctttgcaagagaagacaaatcc > 1:338322‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTGggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttt > 2:713127‑M2/1‑48 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTGggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttt < 1:713127‑M2/132‑85 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcc < 1:130390‑M2/150‑103 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaacagacacct > 2:351517‑M2/1‑48 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaacagacacct < 1:351517‑M2/94‑47 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:691617/1‑150 (MQ=255) cGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatccc > 2:593816‑M1/1‑6 (MQ=255) gCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatccca < 2:3390‑M1/150‑146 (MQ=255) gCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatccca > 1:284188‑M1/1‑5 (MQ=255) gCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatccca < 1:282890‑M1/150‑146 (MQ=255) cTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccat < 2:62725‑M1/150‑147 (MQ=255) cccACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGt > 1:626638/1‑150 (MQ=255) | TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGC‑CCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGT > NC_002947/4861048‑4861345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |