| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 6013891 | 21 (0.710) | 4 (0.170) | 4/192 | NT | 20.3% | intergenic (+40/+70) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| ? | NC_002947 | = 6013919 | 15 (0.650) | intergenic (+68/+42) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein | |||||
GTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6013749‑6014039 | gTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGcac > 1:111434/1‑150 (MQ=255)cagcgtgggCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGcac > 2:717924/7‑150 (MQ=255) ccGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCACGAGTACGCCCCCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACg > 1:81947/1‑150 (MQ=255) tGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGtctc > 2:449237/1‑142 (MQ=255) tGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGtctc < 1:449237/142‑1 (MQ=255) gCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCtgt < 1:398621/150‑1 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTac > 1:218729‑M2/1‑148 (MQ=255) ccAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAAc > 2:388328/1‑131 (MQ=255) ccAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAAc < 1:388328/131‑1 (MQ=255) tACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggc > 1:76402‑M2/1‑134 (MQ=255) ccGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcagca > 2:240009/1‑110 (MQ=255) ccGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcagca < 1:240009/110‑1 (MQ=255) gcgTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTCGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCCAGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgc > 1:470968‑M2/1‑130 (MQ=255) tCGCTGGAGGGGGGGGGGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACAGCTGCTTCGCGGGCCCGCCCGCTGCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGTTGTGCCGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCGGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATc < 2:81947/150‑1 (MQ=37) tggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgt < 2:732883‑M2/94‑7 (MQ=255) tggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgt > 1:732883‑M2/1‑88 (MQ=255) tCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGTGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATgg < 1:692713/115‑1 (MQ=255) tCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATgg > 2:692713/1‑115 (MQ=255) gCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCACGCcaa < 2:111434/150‑1 (MQ=255) cTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCCCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaac > 2:573620/1‑150 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgg > 1:533501‑M1/1‑48 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgg < 2:533501‑M1/84‑37 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTg < 2:170893/128‑1 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTg > 1:170893/1‑128 (MQ=255) aaTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgt < 1:659655‑M1/79‑35 (MQ=255) aaTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgt > 2:659655‑M1/1‑45 (MQ=255) aaCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTgg < 2:458433/150‑1 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgctggcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacacgaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgc > 1:470968‑M1/1‑20 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggta > 1:76402‑M1/1‑16 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctg < 1:150446‑M1/49‑34 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctg > 2:150446‑M1/1‑16 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGc > 2:690028/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga < 2:533501‑M2/84‑49 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga > 1:533501‑M2/1‑36 (MQ=255) acaGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgacca > 1:732883‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgacca < 2:732883‑M1/94‑89 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttatt > 2:659655‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttatt < 1:659655‑M2/79‑46 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTgg > 1:172839/1‑115 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTgg < 2:172839/115‑1 (MQ=255) caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggc > 2:150446‑M2/1‑33 (MQ=255) caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggc < 1:150446‑M2/49‑17 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca > 1:218729‑M1/1‑2 (MQ=255) | GTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6013749‑6014039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |