New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1805898 = | 25 (0.850) | 5 (0.180) | 4/236 | NT | 17.0% | coding (1090/1284 nt) | tilS | tRNA lysidine(34) synthetase TilS |
? | NC_002947 | 1805928 = | 25 (0.880) | coding (1120/1284 nt) | tilS | tRNA lysidine(34) synthetase TilS |
CCCTGATGGGCCGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGCCAACTGCACTGGCAGTTACCGACGAA > NC_002947/1805792‑1806073 | cccTGATGGGCCGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCaa < 1:113052/150‑1 (MQ=255) ccTGATGGGCCGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAAc > 2:155650/1‑150 (MQ=255) ccTGATGGGCCGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAAc > 1:526637/1‑150 (MQ=255) tGATGGGCCGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGa > 1:499399/1‑150 (MQ=255) gATGGGCCGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGaa < 1:352784/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAAcagcag < 2:562591/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAAcagcag > 1:562591/1‑150 (MQ=255) gttggccaccgccagcaggcattcgccgtgatacagcaacggcaggcgcgagcgcaggaaatgcggcacctgctgttcgttgagcaggcgcttGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAgc > 2:659137‑M1/94‑127 (MQ=255) gttggccaccgccagcaggcattcgccgtgatacagcaacggcaggcgcgagcgcaggaaatgcggcacctgctgttcgttgagcaggcgcttGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAgc < 1:659137‑M1/34‑1 (MQ=255) caccgccagcaggcattcgccgtgatacagcaacggcaggcgcgagcgcaggaaatgcggcacctgctgttcgttgagcaggcgcttGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAgc > 2:714131‑M1/88‑121 (MQ=255) caccgccagcaggcattcgccgtgatacagcaacggcaggcgcgagcgcaggaaatgcggcacctgctgttcgttgagcaggcgcttGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAgc < 1:714131‑M1/34‑1 (MQ=255) ccGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAGGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTc > 2:702313/1‑150 (MQ=255) gCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTgc > 1:184523/1‑150 (MQ=255) cAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAAc > 1:509881/1‑124 (MQ=255) cAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAAc < 2:509881/124‑1 (MQ=255) gtgcgtCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTg > 2:705931/1‑150 (MQ=255) ttgttgGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAGGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGc < 1:702313/150‑1 (MQ=255) aGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACgg < 1:777520/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGc > 1:343081/1‑150 (MQ=255) tGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCTGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCgg < 1:635147/150‑1 (MQ=255) gcATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTgg < 2:526637/150‑1 (MQ=255) ccTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAAcc > 2:474942/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGc < 2:616095/150‑1 (MQ=255) gcttgaggtcccgccgaccacggccgggaacctcAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTg > 2:714131‑M2/35‑121 (MQ=255) gcttgaggtcccgccgaccacggccgggaacctcAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTg < 1:714131‑M2/87‑1 (MQ=255) gcttgaggtcccgccgaccacggccgggaacctcAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAAc < 1:659137‑M2/93‑1 (MQ=255) gcttgaggtcccgccgaccacggccgggaacctcAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAAc > 2:659137‑M2/35‑127 (MQ=255) tGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGAtt < 1:705931/150‑1 (MQ=255) GAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGc < 2:721610‑M1/150‑1 (MQ=255) ggtcccgccgaccacggccgggaaccttAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCACTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGTACAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGCCa > 2:662252‑M2/29‑150 (MQ=255) GTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGCCaa < 1:426495‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAAcc > 2:284605/1‑118 (MQ=255) cccGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAAcc < 1:284605/118‑1 (MQ=255) cGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGCCAACTGCa < 1:474942/150‑1 (MQ=255) cGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGCCAACTGCACTgg < 2:770389/150‑1 (MQ=255) cggcggGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGCCAACTGCACTGGCAGTTa < 1:644061/150‑1 (MQ=255) cctcAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGCCAACTGCACTGGCAGTTACCGACGaa < 2:184523‑M2/146‑1 (MQ=255) | CCCTGATGGGCCGTTGCGGTTGCCGGGCAATGGTTGCGTGCGTCTTGTTGGCGCAGCCGTGCCGAGCGGGTTGCGCATTGCCTACCGTCAGGGGGGTGAAATGCTGGAGGTTCCCGGCCGTGGTCGGCGGGACCTCAAGCGCCTGCTCAACGAACAGCAGGTGCCGCATTTCCTGCGCTCGCGCCTGCCGTTGCTGTATCACGGCGAATGCCTGCTGGCGGTGGCCAACCTGCCCGGGCTGGTGCAGGCGGATTGCCAACTGCACTGGCAGTTACCGACGAA > NC_002947/1805792‑1806073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |