New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1899249 = | 29 (0.980) | 5 (0.180) | 4/226 | NT | 14.4% | intergenic (+277/‑243) | PP_t18/PP_1703 | tRNA‑Asp/assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
? | NC_002947 | 1899331 = | 33 (1.220) | intergenic (+359/‑161) | PP_t18/PP_1703 | tRNA‑Asp/assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
ATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTTGCGTTTTCCACA > NC_002947/1899182‑1899480 | aTTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCACATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa < 2:120059/150‑1 (MQ=255) ttGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAg < 1:72942/150‑1 (MQ=255) ccccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGCGGGAGCGGGCATTCCCGCGAAAGGGc > 2:184120/1‑150 (MQ=255) cccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGcc < 2:721535/150‑1 (MQ=255) cAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCgg < 1:172398/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGGAAGCATGAGGTTGCCCCCGCATGGCGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAg < 1:38933/150‑1 (MQ=255) gcCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCACGCACCTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTgg < 1:48162/150‑1 (MQ=255) gCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCAGCCCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATaaa > 2:390940/1‑150 (MQ=255) cATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAAt > 2:3855/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa < 1:101687/122‑1 (MQ=255) gAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa > 2:101687/1‑122 (MQ=255) aGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCt < 1:668554/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCg > 2:213449/1‑126 (MQ=255) ggTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCg < 1:213449/126‑1 (MQ=255) gTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGa > 2:225515/1‑150 (MQ=255) aatGCAACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCTCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCTGTATAGCTGGCCCATAAATTCCTGa > 2:198457/3‑150 (MQ=255) cACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGc < 2:182098/131‑1 (MQ=255) cACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGc > 1:182098/1‑131 (MQ=255) aCCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTAcc < 1:156425/150‑1 (MQ=255) gcgCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCg > 2:166633/3‑150 (MQ=255) gCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCggg > 2:583701/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACa < 1:3855/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACa > 2:706523/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGc > 2:448064/1‑113 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGc < 1:448064/113‑1 (MQ=255) CGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTca > 1:166633‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTcac > 1:706523‑M1/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACg > 1:694089/1‑150 (MQ=255) ccgctcccacagggatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCt < 1:664157‑M2/30‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCt > 2:664157‑M2/70‑99 (MQ=255) ccacagggatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTAcc < 1:153049‑M2/38‑1 (MQ=255) ccacagggatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTAcc > 2:153049‑M2/64‑101 (MQ=255) ccacagggatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACATCATCCCGGGCTGTCAACGTAAACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAgg > 2:7221‑M2/64‑150 (MQ=255) aCTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCg > 1:742402/1‑101 (MQ=255) aCTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCg < 2:742402/101‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGc > 1:75424/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGc > 2:389694/1‑150 (MQ=255) cAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACaaa > 2:715148/1‑127 (MQ=255) cAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACaaa < 1:715148/127‑1 (MQ=255) gATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGGCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGcc > 1:706722/1‑150 (MQ=255) atatCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATTAGCATGCCg < 1:390940/150‑1 (MQ=255) tatCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGa > 2:86582/1‑91 (MQ=255) tatCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGa < 1:86582/91‑1 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCGACGTTGACAg > 2:412756/1‑89 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATAGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAg > 1:696681/1‑150 (MQ=255) gcccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTTGCg < 2:364278‑M2/141‑1 (MQ=255) ccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGc > 2:146214‑M2/8‑124 (MQ=255) ccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGc < 1:146214‑M2/117‑1 (MQ=255) ccgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTTGCGtt > 1:790921‑M2/8‑150 (MQ=255) cgcgaaAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTTGCGttt < 1:583701‑M2/144‑1 (MQ=255) cgaaAGGTCCCGTATAGCTGTCCCATAAATTGCTGACATACCACATCCCGGGCTGGCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCCCGCCAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTTGCGTTTTc < 1:7221‑M2/146‑1 (MQ=255) aGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTTGCGTTTTCcaca < 2:694089/150‑1 (MQ=255) | ATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTTGCGTTTTCCACA > NC_002947/1899182‑1899480 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |