| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6013865 = | 39 (1.020) | 6 (0.190) | 7/224 | 2.9 | 20.9% | intergenic (+14/+96) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| ? | NC_002947 | 6013947 = | 14 (0.450) | intergenic (+96/+14) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein | |||||
GGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTT > NC_002947/6013722‑6014010 | gcgttggatggaccggggccggaggggtatgaaagccacctggggcggatgcagttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCgg > 2:108062‑M1/144‑150 (MQ=255) cgttggatgcaccggggccggaggggtatgaaagccacctggggcggatgcagttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGcggt > 2:626545‑M1/143‑149 (MQ=255) gttggatgcaccggggccggaggggtangaaagccacctgnggcggatgcagttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGc < 1:790400‑M1/9‑1 (MQ=255) gCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGc > 2:679365/1‑150 (MQ=255) ggTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGcc > 2:591385/1‑150 (MQ=255) gTATCGTGGTCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGGGCCGAACTGGACAGCCAGGGTAACCGCGTTGAATCGCTAGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGGGAGCGGCTGCAGCGAATAAACGAGACACCTGCTTCGCGGGCACcccc > 2:62033/1‑150 (MQ=255) gTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCttc > 1:765212/1‑148 (MQ=255) gTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGATTCCTCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCGTGCCCGcgaa < 1:20733/150‑4 (MQ=255) gATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca < 2:436169/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAg < 1:591385/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑Gt > 2:474724/1‑150 (MQ=255) aaagccacctggggcggatgcagttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCgg < 1:545747‑M1/7‑1 (MQ=255) aaagccacctggggcggatgcagttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCgg > 2:545747‑M1/113‑119 (MQ=255) ggcCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGa‑a < 2:577992/150‑1 (MQ=255) gTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGCTGCATCACAG‑GTCTCGA‑ACGCt < 2:765212/150‑1 (MQ=255) gCCTAACTGGACAGCCCGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGATTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCtgt < 1:62033/150‑1 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac < 1:835146/122‑1 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac > 2:835146/1‑122 (MQ=255) cGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGc > 1:784351/1‑150 (MQ=255) cTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTa < 2:303215/150‑1 (MQ=255) agttggggcagccgcaggggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCt > 1:164994‑M1/92‑150 (MQ=255) aGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCtgtg < 2:175073/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTcc > 1:497451/1‑106 (MQ=255) ccAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTcc < 2:497451/106‑1 (MQ=255) ccAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCACGGGGCCGCCCGCTCCCACAGGGGCAGCCCAG‑GTCGCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTggg > 1:469338/1‑150 (MQ=255) gTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCgg < 2:500087/150‑1 (MQ=18) gggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTa > 2:235092‑M1/75‑130 (MQ=255) gggcttaaagaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTa < 1:235092‑M1/56‑1 (MQ=255) gaagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGa < 1:189423‑M1/65‑1 (MQ=255) cTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGc > 1:580118/1‑150 (MQ=255) aagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCtgtg < 2:422413‑M1/62‑1 (MQ=255) aagaactttaccagcgcttgttgttggcggggctggcggcaaccagataaaagggttgcggccaTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCtgtg > 1:422413‑M1/65‑126 (MQ=255) tGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc > 2:474845/1‑150 (MQ=255) tGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt < 2:580118/150‑1 (MQ=255) tGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt > 1:124588/1‑150 (MQ=255) aaGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtttt < 1:474724/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGc > 2:543644/1‑102 (MQ=255) gTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGc < 1:543644/102‑1 (MQ=255) tGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGAATCG‑GAAGCGA‑TCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGt > 1:57035/1‑150 (MQ=38) gAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTg > 1:203071/1‑150 (MQ=255) aTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGc < 2:845611/92‑1 (MQ=255) aTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGc > 1:845611/1‑92 (MQ=255) aTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcgc > 2:269814/1‑150 (MQ=255) aCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAg < 2:462667/49‑1 (MQ=255) aCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAg > 1:462667/1‑49 (MQ=255) acCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACACCAAGCGCt < 2:837225/140‑1 (MQ=255) acCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCt > 1:837225/1‑140 (MQ=255) cTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttctt < 2:124588/150‑1 (MQ=255) tGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCtg > 2:644586/1‑52 (MQ=255) tGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCtg < 1:644586/52‑1 (MQ=255) | GGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTT > NC_002947/6013722‑6014010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |