| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5743392 = | 23 (0.930) | 7 (0.310) | 7/238 | 1.7 | 24.2% | intergenic (‑169/+78) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
| ? | NC_002947 | 5743446 = | 23 (1.030) | intergenic (‑223/+24) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase | |||||
GGGGGATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCC > NC_002947/5743244‑5743540 | gggggATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑G > 2:327330‑M1/1‑150 (MQ=255) acacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCcaca < 1:342751‑M1/10‑1 (MQ=255) caccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGt < 1:180942‑M1/13‑1 (MQ=255) aGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCaa > 2:400149/1‑150 (MQ=255) gTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGc < 2:280518/150‑1 (MQ=255) gaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGacac > 2:78563‑M1/107‑149 (MQ=255) gaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGacac < 1:78563‑M1/43‑1 (MQ=255) gCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgt < 2:410625‑M2/150‑7 (MQ=255) gAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgt < 2:91726‑M1/148‑35 (MQ=255) gAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgt > 1:91726‑M1/1‑114 (MQ=255) gTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtggga < 2:611094‑M1/150‑39 (MQ=255) gTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtggga > 1:23697‑M2/1‑140 (MQ=255) atgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGc > 1:508956‑M1/94‑150 (MQ=255) cGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGcc > 1:28225/1‑150 (MQ=255) gttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCtgt > 1:167218‑M1/86‑132 (MQ=255) gttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCtgt < 2:167218‑M1/47‑1 (MQ=255) tctcAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACgg > 2:180942/1‑150 (MQ=255) tcAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcc < 1:400149/150‑1 (MQ=255) ggCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcctcacct > 1:334077/1‑150 (MQ=255) ttcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGt > 2:518827‑M1/66‑78 (MQ=255) ttcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGt < 1:518827‑M1/13‑1 (MQ=255) ggTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAAt < 2:334077/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTTTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGTAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATg > 1:605231/1‑150 (MQ=255) tAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGAAAGCTGTGGGAGCGTGGGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTc < 1:327330/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGt < 2:386595/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtggga > 2:361599‑M2/1‑83 (MQ=255) ccAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtggga < 1:361599‑M2/93‑11 (MQ=255) gaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTgg < 2:8740‑M1/49‑1 (MQ=255) gaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTgg > 1:8740‑M1/41‑89 (MQ=255) gtggtCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTgg > 2:213043/1‑141 (MQ=255) gtggtCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTgg < 1:213043/141‑1 (MQ=255) gccTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGaa < 1:283027/148‑1 (MQ=255) tCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGaa > 2:268706/1‑149 (MQ=255) tCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGaa < 1:268706/149‑1 (MQ=255) ggTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGTTGGCTCCTACAGGTACAGCGGAAGCCTTGAAGCTTGCGAGAGACTTGTGGGAGGGGGCGTGCCGGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGaa < 2:216997/150‑1 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTg > 1:509348/1‑150 (MQ=255) gtgtCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTc < 2:120280/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgacga > 2:614028/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAg > 1:455081/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAg < 2:509348/150‑1 (MQ=255) tc‑‑‑‑gctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATcc > 2:396687/1‑150 (MQ=255) tc‑‑‑‑gctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATcc < 1:410625/150‑1 (MQ=255) | GGGGGATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTC‑‑‑‑GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCC > NC_002947/5743244‑5743540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |