| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1544501 = | 90 (0.990) | 32 (0.450) | 22/216 | 3.3 | 33.1% | intergenic (+18/+96) | mdfA/ampG | multidrug MFS transporter/muropeptide permease AmpG |
| ? | NC_002947 | 1544577 = | 59 (0.830) | intergenic (+94/+20) | mdfA/ampG | multidrug MFS transporter/muropeptide permease AmpG | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCC > NC_002947/1544352‑1544646 | ctgGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccg < 1:520383/150‑1 (MQ=255) tgGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccgg < 2:595317/150‑1 (MQ=255) tgGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccgg > 1:1555308/1‑150 (MQ=255) ggCGATGATTGGCGCGGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGGGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccggc < 2:1874289/150‑1 (MQ=255) gCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccggcc > 2:1385749/1‑150 (MQ=255) tgatTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCtt > 2:1785826/1‑150 (MQ=255) tgatTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCtt > 2:1978691/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTcgc < 1:196159/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGGTGCCGGCTTGTGGCTTTTGGCCCTGGGGGCGGGGGTGGGGGGGGGGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:485017/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTGGCCCGGGCGGCGGGGGGGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGACCGCTGGGGTTTGTGGGGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:707803/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGGTTCCAGCTGGCTTCTTTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGGGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:213051/150‑1 (MQ=255) gcgggTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCGGGGGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTTGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTa < 2:1580692/147‑1 (MQ=255) ggTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccg > 2:1740473/1‑132 (MQ=255) ggTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccg < 1:1740473/132‑1 (MQ=255) ggTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:1097628/150‑1 (MQ=255) ggTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCGGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:1116621/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt > 1:1227065/1‑150 (MQ=255) aGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:875104/1‑150 (MQ=255) aGCTTGCGGCATTGTGCCCTGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCGGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:920504/150‑1 (MQ=255) gCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGGGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:1604861/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGCTTTTTGCCCGGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCGGTGGCCGCCGTGGGTTGCGGTGGGCGGGCGGCCTGGGGAGGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTTTACCCGcgaag < 2:570608/150‑5 (MQ=255) ttGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 2:893093/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 2:695309/150‑1 (MQ=255) tgctgcATTTTGCCCTGGGGGCGGGGGGGGCGGGGGCGTGGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTac < 1:534052/150‑1 (MQ=255) tgctgcATTTTGCCCGGGGGGGGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTac < 1:1362382/150‑1 (MQ=255) ctgcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacac > 2:2179556/1‑150 (MQ=255) tgcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGTGGGTAAACCCGCTcc > 2:1077820/1‑144 (MQ=255) tgcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:1077820/144‑1 (MQ=255) tgcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacaaa > 1:461135/1‑148 (MQ=255) tgcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca > 1:1912471/1‑150 (MQ=255) tgcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca > 1:944281/1‑150 (MQ=255) tgcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca > 2:632378/1‑150 (MQ=255) ctttttGCCCGGGCGGGGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAgg < 1:1572830/148‑1 (MQ=255) cATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAgg > 2:1159826/1‑150 (MQ=255) tGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgccgg < 1:1978691/150‑2 (MQ=255) cccTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGAGCAGTGGCCGCTGGGGTTTGGGGTGGGGGGGAGGCCTGGGG‑‑GAGGCAATTGGTCGATTCTTTCTAGACGGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACACGCCCCAAGAGAGGgccgcgc > 1:483041/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgccgcgccgc > 1:602932/1‑150 (MQ=255) cggcggGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGNttt < 2:1348986/150‑1 (MQ=255) cggcggGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCttt < 2:752385/150‑1 (MQ=255) ggggggggCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAg < 1:1792226/150‑1 (MQ=255) gggggggggggGTTGGCGCTGTGGCCGTGGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGCGGCGCGGCCCTGTGTAGGAGc < 2:2136876/145‑1 (MQ=17) gTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGGGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGCGGCGCGGCCCTGTGTAGGAGc < 2:313554/150‑1 (MQ=25) gTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑CATCGGTATTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGCGGCGCGGCCCTGTGTAGGAGc < 1:1204666/150‑1 (MQ=18) ggCGGGGGCGTGGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCgg < 1:875104/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGCGTTGTCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGCGGCGCGGCCCTGTGTAGGAGCggg < 2:10093/150‑1 (MQ=25) gCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCggg < 1:64326/150‑1 (MQ=255) gCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCggg < 1:64253/150‑1 (MQ=255) gCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGGGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGCGGCGCGGCCCTGTGTAGGAGCggg < 1:386064/150‑1 (MQ=25) cGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGt < 2:483041/150‑1 (MQ=255) gggggCGTTGGGGCTGTGGCCGCTGTGTTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGCGGCGCGGCCCTGTGTAGGAGCGGGtt < 2:852101/150‑1 (MQ=25) gggggCGTTGGCGCGGTGGCCGCTGCGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGtt < 1:325678/150‑1 (MQ=255) gggCGTTGGCGCTGTGGACGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTa < 2:49685/150‑1 (MQ=255) gCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccggc < 2:1696759/89‑1 (MQ=255) gCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGggccggc > 1:1696759/1‑89 (MQ=255) ttGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGGTTACCcgc > 1:1665684/1‑150 (MQ=255) cgcTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 1:532508/1‑150 (MQ=255) gcTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt > 1:731182/1‑102 (MQ=255) gcTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:731182/102‑1 (MQ=255) cTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGGGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 1:1385749/150‑1 (MQ=255) gtgGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 2:532508/150‑1 (MQ=255) gtgGCCGCTGTGGTTGGTGGGGGGGGGGCGGCCGGGGGACGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 2:1912471/150‑1 (MQ=37) ggcggcGGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCGGGGGCGGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa < 2:944281/150‑1 (MQ=37) gCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTACTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAg > 2:1368834/1‑150 (MQ=255) cGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGca > 1:2012602/1‑150 (MQ=255) gCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGcac > 2:76894/1‑150 (MQ=255) gtgGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAGGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAgg < 2:232530/150‑1 (MQ=255) gtgGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCAGGCCTGTTCGCGGGTAAACCCGCTTCTACCCTGGGCCGCGCCGTTTTGTAGGAGCGGGTGTACTCGCGAAGAGGCCAGCACAgg < 2:240822/150‑1 (MQ=38) gtgGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCGCGAT‑‑CGGCGGTGTTGCCGGGGCCGGCGGCTTCGCGGGTAACCCGGGCCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAgg < 2:238569/150‑1 (MQ=37) gtgGTTGGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTACACCCGCTCCTACACAGGGCCGGGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAgg < 1:578419/150‑1 (MQ=255) tgGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGTGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGc < 1:1785826/150‑1 (MQ=255) gttgggggtgggtgGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCGCGAT‑‑AATCGGTCTTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCaa < 1:668818/144‑1 (MQ=255) gTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCaa < 1:146866/150‑1 (MQ=255) tttGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAAt > 1:1748253/1‑150 (MQ=255) tggtggGGGTGCGGCGAGGGGAAGGGGCTGTAGCTCCAT‑‑AATCGTTATTGCCGGGGCCGGCCTCGTCGTGGGTAGACCCGCTCCTACACGGGGCCGCGCCGGTTTGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGCAGAGGCCAGCACAGGCAATACaa < 2:854440/150‑1 (MQ=37) ggtgggtgGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCgg < 2:935845/114‑1 (MQ=255) ggtgggtgGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCgg > 1:935845/1‑114 (MQ=255) tGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTc > 2:138616/1‑150 (MQ=255) ggggAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTCTCCGCGGGTGTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCa < 2:1227065/150‑1 (MQ=37) gggAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTc > 2:1646352/1‑148 (MQ=255) gggAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTc < 1:1646352/148‑1 (MQ=255) ggAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGc < 1:2179556/150‑1 (MQ=255) gCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAg < 1:632378/150‑1 (MQ=255) gCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATAc < 1:792871/116‑1 (MQ=255) gCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATAc > 2:792871/1‑116 (MQ=255) gCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGgtgg > 1:2066844/1‑148 (MQ=255) ggAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTcc < 2:1642463/149‑1 (MQ=255) aTCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCAc > 1:557890/1‑150 (MQ=255) aTCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCAc > 1:211539/1‑150 (MQ=255) aTCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCAc > 2:32034/1‑150 (MQ=255) tCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCAcc > 1:1821161/1‑150 (MQ=255) gattggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACTGTTCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTCGTGGCCCGAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCcccgcc < 1:891940/146‑1 (MQ=255) ggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCAcc < 1:1413792/115‑1 (MQ=255) ggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCAcc > 2:1413792/1‑115 (MQ=255) | CTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGAT‑‑AATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCC > NC_002947/1544352‑1544646 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |