New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4586100 | 77 (0.850) | 15 (0.230) | 13/200 | 5.1 | 21.5% | intergenic (+139/+78) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
? | NC_002947 | = 4586128 | 54 (0.820) | intergenic (+167/+50) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
GAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAA > NC_002947/4585984‑4586277 | gAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTg < 1:165296/150‑1 (MQ=255) cAGCTGATCTGCGCTGCTCTATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTTAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTa < 2:898455/150‑1 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGccc < 1:397074/141‑1 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGccc > 2:397074/1‑141 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGa < 1:378378/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:904983/150‑1 (MQ=255) cTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCggg < 1:724045/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGt < 1:700215/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGtt < 1:919055/150‑1 (MQ=255) cgcTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGttt < 1:1056482/150‑1 (MQ=255) tCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCG‑GCACGGTCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:667417/150‑1 (MQ=14) tCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg > 2:1435431/1‑140 (MQ=255) tCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:1435431/140‑1 (MQ=255) aTTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:1287091/1‑150 (MQ=255) tGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGATGTTTTTTCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGAAGACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:1194797/150‑1 (MQ=38) tGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:1287091/150‑1 (MQ=255) aaaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg > 1:1100991/1‑150 (MQ=255) aaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggc < 2:1100991/150‑1 (MQ=255) aGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGG‑CCTGCACGGTCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:83441/1‑137 (MQ=11) aGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggcc < 1:191276/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAg > 1:913474/1‑124 (MQ=255) ggTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAg < 2:913474/124‑1 (MQ=255) gCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggcc > 1:1575158/1‑126 (MQ=255) gCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggcc < 2:1575158/126‑1 (MQ=255) gTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGATCGTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTCCCCCTGGCACGAGCGGGTTTCCACGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATGAACCCGCAGacc > 2:321365/1‑148 (MQ=38) ttGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:1116599/1‑106 (MQ=255) ttGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:1116599/106‑1 (MQ=255) gggCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCcaca > 1:305743/1‑150 (MQ=255) ggccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCacac > 2:2004880/1‑150 (MQ=255) cggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCa > 1:991800/1‑122 (MQ=255) cggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCa < 2:991800/122‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAtct > 1:1301010/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAg < 2:1785959/125‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAg > 1:1785959/1‑125 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAg > 1:1786118/1‑125 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAg < 2:1786118/125‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAtctc > 1:2011336/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACg > 1:1744721/1‑150 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCa > 2:251955/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGca > 2:510944/1‑100 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGca < 1:510944/100‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGc > 1:785895/1‑120 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGc < 2:785895/120‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCAt > 2:2185139/1‑148 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCAt < 1:2185139/148‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCAGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGAAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCgg > 2:1112740/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCG‑GCACGGTCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGa > 1:831718/1‑150 (MQ=14) cccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACtt > 2:1887180/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACtt > 2:1430190/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:1095030/58‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg > 2:1095030/1‑58 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc > 1:1880469/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAt > 1:1456062/1‑131 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAt < 2:1456062/131‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCg > 1:1649942/1‑143 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCg < 2:1649942/143‑1 (MQ=255) gCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCGATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCt < 1:408577/149‑1 (MQ=255) gCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCGATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCt > 2:408577/1‑149 (MQ=255) gCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTg < 2:305743/150‑1 (MQ=255) ccTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAc < 1:1887180/150‑1 (MQ=255) cTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAcc > 2:1957642/1‑150 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg > 2:1669174/1‑51 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:1669174/51‑1 (MQ=255) aCCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCtt > 2:1103397/1‑150 (MQ=255) cANGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGc > 1:1738583/1‑150 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGc > 1:1890605/1‑150 (MQ=255) aGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGcc > 1:150807/1‑150 (MQ=255) aGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGcc > 1:1908039/1‑150 (MQ=255) aGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCAGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGcc > 1:487228/1‑150 (MQ=255) gggACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:507741/1‑59 (MQ=255) gggACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:507741/59‑1 (MQ=255) gACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggt > 1:1979723/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtcacg < 2:1738583/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtcacgg < 2:1744721/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtcacggtc < 2:1979723/150‑1 (MQ=255) gCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATc < 2:2011336/150‑1 (MQ=255) ccTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCg > 1:1131550/1‑150 (MQ=255) cTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCgg > 2:365871/1‑150 (MQ=255) cTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCgg < 1:1112740/150‑1 (MQ=255) g‑cg‑gcgCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAt < 2:1680937/98‑1 (MQ=255) g‑cg‑gcgCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAt > 1:1680937/1‑98 (MQ=255) cg‑gcgCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgt < 2:1890605/150‑1 (MQ=255) cg‑gcgCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGACCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAGCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgt > 2:637618/1‑150 (MQ=255) g‑gcgCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAc < 1:1525170/62‑1 (MQ=255) g‑gcgCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAc > 2:1525170/1‑62 (MQ=255) ccccTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCAGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACaaaa < 2:487228/150‑1 (MQ=255) | GAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CG‑GCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAA > NC_002947/4585984‑4586277 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |