New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2429928 = | 101 (1.740) | 16 (0.370) | 12/196 | 3.1 | 18.2% | intergenic (+15/+98) | PP_2129/PP_2130 | hypothetical protein/lytic transglycosylase |
? | NC_002947 | 2430009 = | 68 (1.570) | intergenic (+96/+17) | PP_2129/PP_2130 | hypothetical protein/lytic transglycosylase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTTCGTCGAACGGGATCGACTC > NC_002947/2429863‑2430157 | gacggCAGTCGGTGTCTGGAGGTTCGGATGTAAGTAGAAATCCTGGAATATGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTCCGCAGGTGAGCCCGCTCCTACAACGACCGCCCAAACCCTTATAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACa < 2:152596/147‑1 (MQ=37) gATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACa > 2:483829/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAg < 1:261198/150‑1 (MQ=255) aGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCa > 1:1130892/1‑150 (MQ=255) tggggggCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGACTAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAAc < 1:846990/150‑1 (MQ=255) ggtggCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAg > 1:12757/1‑150 (MQ=255) tggCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCa > 1:206562/1‑150 (MQ=255) ggCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCaa > 1:197962/1‑150 (MQ=255) gAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATcaca < 1:985470/150‑1 (MQ=255) gAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAAGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAAt > 2:1100332/1‑150 (MQ=255) gTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCg < 2:1364193/143‑1 (MQ=255) gTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCg > 1:1364193/1‑143 (MQ=255) gTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATAcc > 2:973146/1‑150 (MQ=255) gTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATAcc > 1:444359/1‑150 (MQ=255) tAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCg > 2:727529/1‑150 (MQ=255) gAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGtt < 1:30487/150‑1 (MQ=255) gAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGtt < 1:1100332/150‑1 (MQ=255) aaTCTTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTGCGCGGTTGAACCCGCTCATACAACGTCCGCTCAATCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCa < 1:82992/150‑1 (MQ=38) ccTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAGATACCGTTCATGc < 2:1130892/150‑1 (MQ=255) tGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATcac > 2:673270/1‑124 (MQ=255) tGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATcac < 1:673270/124‑1 (MQ=255) aGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAg > 2:1118244/1‑111 (MQ=255) aGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAg < 1:1118244/111‑1 (MQ=255) aGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATccac < 2:848160/150‑1 (MQ=255) aGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATccac < 1:331008/150‑1 (MQ=255) gtgtgtTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTc > 1:901819/1‑121 (MQ=255) gtgtgtTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTc < 2:901819/121‑1 (MQ=255) gtgtTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAAt < 1:727529/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGc < 1:617103/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGc < 1:873370/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGc > 1:110005/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGGCAATCCACCAATGGCTGCg > 2:981883/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCgg > 1:1281669/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCgg > 2:542371/1‑150 (MQ=255) gtgCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGt < 2:1281669/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTGCTGGGGTGATCCCTCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGaa < 2:732635/150‑1 (MQ=39) cGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATAcc > 2:815367/1‑117 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATAcc < 1:815367/117‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGc < 1:101659/85‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGc > 2:101659/1‑85 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCa < 2:12757/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATATCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCa < 1:1383291/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAg > 2:886430/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAg > 1:232579/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGc > 1:520768/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTGCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGc < 2:444359/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAg < 2:251393/78‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAg > 1:251393/1‑78 (MQ=255) ttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCtt < 1:1252809/150‑1 (MQ=255) ggTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGccc < 2:110005/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATc > 1:805730/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATc > 2:567176/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCa > 1:812644/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCAc > 2:1331170/1‑150 (MQ=255) cTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGc > 1:862107/1‑64 (MQ=255) cTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGc < 2:862107/64‑1 (MQ=18) cTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCCTGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGaa < 1:483829/150‑1 (MQ=255) aaCGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGATATCGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACg > 1:763325/1‑150 (MQ=255) aCGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGa < 2:520768/150‑1 (MQ=255) tCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACa > 1:522276/1‑144 (MQ=255) tCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACa < 2:522276/144‑1 (MQ=255) aaCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCt < 1:973146/150‑1 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCg < 1:175698/73‑1 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCg > 2:175698/1‑73 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCAcc < 2:86821/128‑1 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCAcc > 1:86821/1‑128 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTa > 1:1271022/1‑150 (MQ=255) cTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTAc < 2:206562/150‑1 (MQ=255) ttcgCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATAc < 1:114697/124‑1 (MQ=255) cGGGTTCACCCGCGAAGAGTCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTCAGTGCCGATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGgcgc < 1:1216097/150‑1 (MQ=255) cGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGgcgc < 2:232579/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGtt > 1:736787/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTGATGCCAATGCACCAATGGCTGCGGTGAATGCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATAGGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTtcgt > 1:512303/1‑150 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTtcgtc > 2:380942/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAAt > 1:1291925/1‑85 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAAt < 2:1291925/85‑1 (MQ=255) cgAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTTCGTCGAAc < 2:1271022/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGCCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACGTACTGGCGCGTTTCGTCGAACGGGATc < 1:540524/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTACAGGCTAAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTTCGTCGAACGGGATc < 1:306741/150‑1 (MQ=255) gCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATgg > 1:1341439/1‑64 (MQ=255) gCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATgg < 2:1341439/64‑1 (MQ=255) gCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCAc < 1:399583/97‑1 (MQ=255) gCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCAc > 2:399583/1‑97 (MQ=255) gCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTc < 1:1364000/116‑1 (MQ=255) gCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTc > 2:1364000/1‑116 (MQ=255) gCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTTCGTCGAACGGGATCg > 1:1258829/1‑150 (MQ=255) cGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTTCGTCGAACGGGATCGAc < 1:542371/150‑1 (MQ=255) gTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCCATACCCACATGGCTGCGGTGAATTCAGCGTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTTCGTCGAACGGGATCGACTc > 1:929061/1‑150 (MQ=255) | GATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTACATACTGGCGCGTTTCGTCGAACGGGATCGACTC > NC_002947/2429863‑2430157 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |