Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,984,780 | Δ1 bp | 5.6% | intergenic (‑33/+20) | cheR ← / ← PP_4393 | chemotaxis protein methyltransferase/chemotaxis protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,984,780 | 0 | A | . | 5.6% | 211.8 / 6.8 | 72 | intergenic (‑33/+20) | cheR/PP_4393 | chemotaxis protein methyltransferase/chemotaxis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/37); new base . (2/2); total (33/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.90e-01 |
ATCAGCTTGTTGAGACGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGAACACCCCGGAAAGCGAAGTAT > NC_002947/4984632‑4984927 | aTCAGCTTGTTGAGACGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAg > 2:996825/1‑150 (MQ=255) aTCAGCTTGTTGAGACGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAg < 1:948273/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTTGAGACGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAgg < 2:1839398/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTTGAGACGGCTCGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAgg < 1:6585/150‑1 (MQ=255) cTTGTTGAGACGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTTCCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCAt < 1:800065/150‑1 (MQ=255) cTTGTTGAGACGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGCCACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCAt > 2:724863/1‑150 (MQ=255) actgCTGGAAACCAGGTACCGCTCATCCTCGTTTAGTAGGATGCCACAGGCTTGCAACAGAACGACCAGGACCTGTTCGAGATCCAAATGACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGG‑GGGCATGCCCTCCGgc < 2:1348764/147‑1 (MQ=255) aCGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGgc > 1:1410241/1‑150 (MQ=255) aCGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGG‑GGGCATGCCCTCCGgc > 1:801590/1‑150 (MQ=255) tGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCtt < 2:1869313/150‑1 (MQ=255) ggAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTc < 2:1497500/150‑1 (MQ=255) gAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCa > 2:568569/1‑150 (MQ=255) cAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATgcg > 2:1481328/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATgcgc < 2:779091/150‑1 (MQ=255) cTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCt < 1:997031/150‑1 (MQ=255) cTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGG‑GGGCATGCCCTCCGgca > 2:1500843/1‑132 (MQ=255) cTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGG‑GGGCATGCCCTCCGgca < 1:1500843/133‑2 (MQ=255) tatccgcGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACGGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATc < 2:1178314/144‑1 (MQ=255) ctcGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCCATCCCAGTTTCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGt < 1:1572986/150‑1 (MQ=255) cGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTc < 2:222027/149‑1 (MQ=255) cGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTc > 1:222027/1‑149 (MQ=255) aTGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATG‑CC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTgg > 1:1198993/1‑150 (MQ=255) tGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTgg < 1:1481328/150‑1 (MQ=255) acaGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCa > 2:715936/1‑150 (MQ=255) caGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAg < 2:1105688/150‑1 (MQ=255) caGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAg < 1:1887937/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGc < 1:625433/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGc > 1:1857572/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATGCAACTTACCGGTAGGCACT‑CT‑ACGCTTCGTACCGCAATCACTGGCTCCTGAGGGCATGACC‑CAGGCTGCTTCAATGGGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCGTCCGGCt > 1:514020/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCt < 1:996825/150‑1 (MQ=255) aCCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTgg < 1:607785/127‑1 (MQ=255) aCCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTgg > 2:607785/1‑127 (MQ=255) ccGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTgg > 1:1312469/1‑150 (MQ=255) ccGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTgg > 1:171979/1‑150 (MQ=255) aaCTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAg < 1:715936/150‑1 (MQ=255) aCTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAgg > 2:508666/1‑150 (MQ=255) tGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGaa < 1:1865251/150‑1 (MQ=255) ttCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGt > 2:454278/1‑150 (MQ=255) gAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGAt < 2:475124/94‑1 (MQ=255) gAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGAt > 1:475124/1‑94 (MQ=255) aaaTCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAgtcgtc > 1:1508160/1‑150 (MQ=255) ccAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGCAGTCATCGGcc > 1:717042/1‑149 (MQ=255) ttACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAAGGTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGAc > 1:292588/1‑150 (MQ=255) ccGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACcttc < 2:1742414/150‑1 (MQ=255) ccGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACcttc < 1:213393/150‑1 (MQ=255) ccGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCGGTGCTGGGTCATCCGGCTGGAGCTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACcttc > 2:990750/1‑150 (MQ=255) cGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACcttct > 2:855209/1‑150 (MQ=255) gACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGc < 2:982395/120‑1 (MQ=255) gACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGc > 1:982395/1‑120 (MQ=255) gACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAAGCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTTATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAGCTTGCCAAGGAAGTTATCGGTACCGACCTTCTTGAc > 1:822255/1‑150 (MQ=255) tactGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACctt < 2:1009771/139‑1 (MQ=255) tactGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACctt > 1:1009771/1‑139 (MQ=255) ccgncTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTgg > 2:1197351/1‑150 (MQ=255) cgccTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGt < 2:1312469/150‑1 (MQ=255) gccTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGtt < 1:38310/150‑1 (MQ=255) gccTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGtt < 2:292588/150‑1 (MQ=255) gccTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATCCTGTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGtt > 1:1078454/1‑150 (MQ=255) ccTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCAtt < 2:388238/141‑1 (MQ=255) ccTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCAtt > 1:388238/1‑141 (MQ=255) ccTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTg > 2:1702154/1‑150 (MQ=255) tctT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGaa < 1:1702154/150‑1 (MQ=255) tctT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGaa < 1:1197351/150‑1 (MQ=255) tt‑‑ttCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAg > 2:243652/1‑82 (MQ=255) tt‑‑ttCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAg < 1:243652/82‑1 (MQ=255) aCTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGAt > 1:651422/1‑49 (MQ=255) aCTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGAt < 2:651422/49‑1 (MQ=255) tgttGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTGAAGCCCCTTCCTTGATTCTGGCGTCTATCCGCTGGGCCAGCTCATCCGTCTTTAGCTTGGCCAGGAATTCATCCTGACCTGCCTTCTTATCCATTGCCTTTTAGTACACCGCGGAAAGc < 2:822255/147‑1 (MQ=255) gTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGAACACCCCGGAAAGCGa < 1:724863/150‑1 (MQ=255) tGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGAACACCCCGGAAAGCGaa < 1:846288/150‑1 (MQ=255) tGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGAACACCCCGGAAAGCGaa < 1:508666/150‑1 (MQ=255) gCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAAGACCCCCGGCGTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGAACACCCCGGAAAGCGAAg < 2:1894639/150‑1 (MQ=255) ggAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGGACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGAACACCCCGGAAAGCGAAGTAt > 2:1503957/1‑150 (MQ=255) | ATCAGCTTGTTGAGACGGCTGGAAACCAGGTACTGCTTATTCTCGCCCAGCAGGATGCCACAGGCTTTCTCCAGGAAGACCCGGAACTGTTCGAAATCCAAATTACCCGTAGACACTACTGCCGCCTCTT‑‑TTCAATCACTGGTGCCGGAGGGCATGCCC‑CCGGCTGCTTCAATGCGCTGCCTTGATCCGGTCGACCACCCGCTGGGCCAGGTCATCCGGCTTGAACTTGGCCAGGAAGTCATCGGCACCGACCTTCTTGACCATTGCCTGGTTGAACACCCCGGAAAGCGAAGTAT > NC_002947/4984632‑4984927 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |