| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,092,961 | Δ1 bp | 8.7% | coding (709/981 nt) | PP_4482 ← | AraC family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,092,961 | 0 | A | . | 8.7% | 193.5 / 14.2 | 69 | coding (709/981 nt) | PP_4482 | AraC family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/28); new base . (3/3); total (38/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.63e-01 | |||||||||||
GAGAAGCCACAGGACAGCCCGATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCGCCACCCTCGCGGATGC > NC_002947/5092813‑5093110 | gagaAGCCACAGGACAGCCCGATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCAAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGac < 1:1920575/150‑1 (MQ=255) gaAGCCACAGGACAGCCCGATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGacac > 1:851246/1‑150 (MQ=255) gcaacaGCAGAGCCCGGTCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGacacaca < 2:1543945/147‑1 (MQ=255) ccACAGGACAGCCCGATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGacacacac > 2:721648/1‑150 (MQ=255) ggACAGCCCGATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATg < 1:46369/150‑1 (MQ=255) aCAGCCCGATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCGGCAATAGCATCTGCCGCGCCGGGTTCAACCGCAACAGCAGGTAGTAATGGTCGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCCACATACACACAGGCt > 1:1572111/1‑150 (MQ=255) cGATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGa < 2:194656/150‑1 (MQ=255) gATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACCCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCTACTGCCGAGGCGACACACACACGTGCTGGGCGAt < 2:639248/150‑1 (MQ=255) gATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGACTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGAt > 2:309437/1‑150 (MQ=255) gttgttCGACTTGCTGGTCTGCATCATCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTtcgtc < 2:951714/145‑1 (MQ=255) tgatCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGTACTCGGTTAAGGTACTGCTAGAGGATACCCTCCAGCTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCgg > 1:1377456/1‑150 (MQ=255) tCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCggtgg > 1:1328477/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGc > 2:1578783/1‑150 (MQ=255) cAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCACCTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCCATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGtt < 2:1071498/150‑1 (MQ=255) gCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTgg < 1:389528/150‑1 (MQ=255) tCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCTGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCtt < 1:1665244/150‑1 (MQ=255) tCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCtt > 2:1677185/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACACGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCa < 2:1572111/150‑1 (MQ=255) cgcCTTGTTCAACCGCAGCTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACGCATGCTGGGCGATTTCGTCGGTCGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAg < 2:1070700/150‑1 (MQ=255) cTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCaa > 1:338577/1‑150 (MQ=255) gTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGCTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACGGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAacac > 2:595293/1‑150 (MQ=255) ttCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGAt > 1:1891542/1‑128 (MQ=255) ttCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGAt < 2:1891542/128‑1 (MQ=255) ttCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACg > 1:771325/1‑150 (MQ=255) ttCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGAAacagg > 1:868492/1‑148 (MQ=255) ttCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCG‑‑ACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTc > 1:1092515/1‑123 (MQ=255) ttCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCG‑‑ACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTc < 2:1092515/123‑1 (MQ=255) cAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGc < 2:505992/96‑1 (MQ=255) cAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGc > 1:505992/1‑96 (MQ=255) aaCCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGcc > 2:1137373/1‑150 (MQ=255) aCCGCAACTGCAGGTAGGACTGGCTGGGCACTCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATTCGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCt < 2:861939/150‑1 (MQ=255) aCCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTCCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCt < 2:851246/150‑1 (MQ=255) ccGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTg < 2:1377456/150‑1 (MQ=255) cGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGa < 1:721648/150‑1 (MQ=255) gccaCTCCAGGTAATGCTGGCTGGGCATGCGGGGCAAGTACTGCATGAAGATACGCCCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAg > 2:695995/4‑150 (MQ=255) gCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCG‑‑ACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCggtg > 1:1289109/1‑102 (MQ=255) gCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCG‑‑ACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCggtg < 2:1289109/102‑1 (MQ=255) gCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCG‑‑ACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCggtg < 2:1289048/102‑1 (MQ=255) gCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCG‑‑ACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCggtg > 1:1289048/1‑102 (MQ=255) tagtaCTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTgggg < 1:1677185/150‑1 (MQ=255) tggctggGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTc < 1:663909/150‑1 (MQ=255) gctggGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGtt > 1:1047651/1‑105 (MQ=255) gctggGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGtt < 2:1047651/105‑1 (MQ=255) gctggGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGa < 1:170988/150‑1 (MQ=255) tggGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGc > 1:1431940/1‑150 (MQ=255) gggCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGcg < 2:1328477/150‑2 (MQ=255) gcgGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCg > 1:30920/1‑150 (MQ=255) gTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGtt < 1:541501/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGtt < 2:1431940/150‑1 (MQ=255) ttCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCTACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTc > 1:981755/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGCTTGAAGATACGCCCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGc > 1:1492575/1‑150 (MQ=255) ggTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCa > 1:866165/1‑150 (MQ=255) gTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAg > 2:1293587/1‑150 (MQ=255) tACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGc > 2:1322756/1‑150 (MQ=255) tACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGc < 1:309437/150‑1 (MQ=255) tACTGCTCGAAGTCACGCTCCAACTGCCGGCGCGACACACACTCATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGc < 2:389058/150‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTCGGTTGCCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGa > 1:960272/1‑150 (MQ=255) ttGNAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATa > 2:1194827/1‑150 (MQ=255) ttGAAGATACGCTCCACCTGCCGCCGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATa > 2:695191/1‑150 (MQ=255) ttGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATa > 2:1898639/1‑150 (MQ=255) ttGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATa > 1:1339611/1‑150 (MQ=255) gATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCA‑GCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTgg > 2:1351635/1‑150 (MQ=255) aCGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAacac < 1:1414677/90‑1 (MQ=255) aCGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAacac > 2:1414677/1‑90 (MQ=255) aCGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGgcg > 1:360508/1‑150 (MQ=255) gCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCAGCAGCTATACGGCCTGAGTCAGCTTGCGGTGAGGCGATCCCAGGCGGTTCTGCAGCTGAATACGCTGgcgca > 2:1842612/1‑149 (MQ=255) tCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCg > 1:1777979/1‑150 (MQ=255) tCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTAGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCg > 1:1776493/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCGccc > 1:747480/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCGCCa < 2:338577/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCGCCAc < 2:1339611/150‑1 (MQ=255) cgACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCGCCACCCTCGCGGAt < 2:771325/150‑1 (MQ=255) gACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCGCCACCCTCGCGGATg > 1:817558/1‑150 (MQ=255) acacacacacATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCGCCACCCTCGCGGATgc < 1:695995/150‑1 (MQ=255) | GAGAAGCCACAGGACAGCCCGATCTGGATGATCGACTTGCTGGTCTGCATCAGCATCTGCCGCGCCTTGTTCAACCGCAACTCCAGGTAGTACTGGCTGGGCACGCGGTTCAGGTACTGCTTGAAGATACGCTCCAACTGCCGACGCGACACACACACATGCTGGGCGATTTCGTCGGTGGTCAGCGGCTCTTCGATGTTGGCTTCCATCAGCAACACGGCCTGAGTCAGCTTGGGGTGACTCGAGCCCAGGCGGTTCTGCAGCGGAATACGCTGGCGCTCGCCACCCTCGCGGATGC > NC_002947/5092813‑5093110 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |