| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 838,006 | Δ1 bp | 7.7% | intergenic (‑39/+41) | pth ← / ← rplY | peptidyl‑tRNA hydrolase/50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 838,006 | 0 | G | . | 7.7% | 231.4 / 14.2 | 78 | intergenic (‑39/+41) | pth/rplY | peptidyl‑tRNA hydrolase/50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/37); new base . (2/4); total (37/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 | |||||||||||
GCTGGGCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTT > NC_002947/837859‑838147 | gCTGGGCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGTTAACATGGATGTCGGTCACGTCAGGTGCTCTTCCTTGAAGTTGGTGGGTTATATTgcgcc > 2:911721/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGTGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTgcgcgc < 1:680956/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGcgcgcg > 2:574852/1‑150 (MQ=255) cgcTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCAc < 2:12506/150‑1 (MQ=255) gcTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACt < 1:813779/150‑1 (MQ=255) cTGTCAAGGCGTTCAACGCAACGACCCCCAGCGTTACGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGCTCACCTGGATGGCGGTCACGCCAGGGGCCCCTCCTTGGAGTTGGCGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCCCTg > 2:360076/1‑150 (MQ=255) tGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCACCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGt > 1:209689/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTTGATGGCGGTCACGTCGGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTaa < 2:1267474/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTaa < 2:1265036/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTCAACGAAAAGAGGCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAAccc > 1:300786/1‑150 (MQ=255) gCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGa < 2:401735/150‑1 (MQ=255) gCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGa > 1:168388/1‑150 (MQ=255) cGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTAAcccacc < 1:255494/150‑4 (MQ=255) aCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGTCGGTCACGTCAGTTTCTCTTCCTTTTAGTTGGTTTTTTACGTGGCTTGCG‑GCACTTTAACCCGATGAACGc > 2:1841534/1‑150 (MQ=255) aCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGc > 2:246814/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCgg > 1:883471/1‑150 (MQ=255) cccTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAg > 2:511590/1‑150 (MQ=255) ccTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGt < 1:715582/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGt > 1:1726865/1‑150 (MQ=255) gCGTTATGCCGGTTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGa < 1:1273725/150‑1 (MQ=255) gCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGa < 2:1784131/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTc < 1:1576326/150‑1 (MQ=255) gtgTCGGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAGCCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCa < 2:679368/148‑1 (MQ=255) gTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTgg > 2:290027/1‑133 (MQ=255) gTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTgg < 1:290027/133‑1 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTACCCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCa < 1:230243/143‑1 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCa > 2:230243/1‑143 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCctt > 1:1505509/1‑150 (MQ=255) tCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttc < 1:1303833/150‑1 (MQ=255) tCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttc < 1:1306004/150‑1 (MQ=255) gTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCCACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGCGGGTTACAGTgcgcgc < 2:986708/93‑1 (MQ=255) gTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTc > 1:1008814/1‑136 (MQ=255) gTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTc < 2:1008814/136‑1 (MQ=255) gTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGCGGGTTACAGTgcgcgc > 1:986708/1‑93 (MQ=255) tATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGa < 1:455924/129‑1 (MQ=255) tATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGa > 2:455924/1‑129 (MQ=255) ggggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGTGCTCTTCCTTGTAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttctg > 1:1525046/1‑150 (MQ=255) ggggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCa > 2:117328/1‑91 (MQ=255) ggggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCa < 1:117328/91‑1 (MQ=255) ggggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttctg < 2:1256279/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGCTTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGa < 1:1402407/150‑1 (MQ=255) gggTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTgg > 1:397824/1‑116 (MQ=255) gggTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAAAGCCGGCGTGCGAGTgg < 2:397824/116‑1 (MQ=255) ggTTACCCAGGCCAACGATCGACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAAcg > 1:1056238/1‑150 (MQ=255) ggTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAAcg > 2:1765751/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCATCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAGCCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGAAACGCGTGGa < 1:407981/150‑1 (MQ=255) cAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAg > 2:940465/1‑150 (MQ=255) aGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGc < 1:911721/150‑1 (MQ=255) aaCGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTTGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGaa < 1:1259585/150‑1 (MQ=255) aaCGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGAt > 2:990688/1‑82 (MQ=255) aaCGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGAt < 1:990688/82‑1 (MQ=255) aaCGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGaa > 1:927523/1‑150 (MQ=255) aCGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAAc < 2:1106229/150‑1 (MQ=255) aCGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCCGCAGCGCCTGCTGCTTCAGGAGCAACGCGTGGAGAGCGaaa > 2:1259585/1‑149 (MQ=255) tCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTg < 1:1391223/150‑1 (MQ=255) tCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTg < 1:1765751/150‑1 (MQ=255) cTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGAAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCaa < 2:168388/150‑1 (MQ=255) tGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAAc < 1:246814/150‑1 (MQ=255) gCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCttt < 1:629429/150‑1 (MQ=255) gCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCttt < 2:1303258/150‑1 (MQ=255) gCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCttt < 1:242489/150‑1 (MQ=255) gCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGACAGAGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCttt > 2:815580/1‑150 (MQ=255) gCGGTCACGTCAGGCGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGAAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCttt < 1:360076/150‑1 (MQ=255) 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gTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTg < 1:515769/124‑1 (MQ=255) gTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTg > 2:515769/1‑124 (MQ=255) gTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGAAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCAc > 1:1481403/1‑150 (MQ=255) ggggCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTg > 1:1846609/1‑150 (MQ=255) gggCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTgg < 2:1505509/150‑1 (MQ=255) gggCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGGGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTgg < 1:511590/150‑1 (MQ=255) cTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGcg > 1:1502970/1‑150 (MQ=255) tGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGGGcgac < 1:415369/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAAc > 1:1602720/1‑150 (MQ=255) ggTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTAACCCGATCAACGCGGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGc > 2:907903/1‑150 (MQ=255) ggTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGaa > 1:717966/1‑99 (MQ=39) ggTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGaa < 2:717966/99‑1 (MQ=39) tACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAACGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCAGTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACCAACTCTACGCCtt > 2:420250/1‑150 (MQ=255) tGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTg < 2:1366526/82‑1 (MQ=255) tGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTg > 1:1366526/1‑82 (MQ=255) | GCTGGGCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTT > NC_002947/837859‑838147 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |