| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,844,125 | Δ1 bp | 100% | coding (711/2754 nt) | gacS ← | sensor protein GacS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,844,125 | 0 | G | . | 98.8% | 379.9 / ‑4.7 | 85 | coding (711/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (44/40); minor base T (0/1); total (44/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
ATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCATGCGCA > NC_002947/1843982‑1844270 | aTGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGc < 1:297292/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGt < 1:130608/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGAt < 1:695669/150‑1 (MQ=255) ggCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATg < 1:158398/150‑1 (MQ=255) gCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGc > 1:110349/1‑150 (MQ=255) cTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGGTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCg > 2:1120576/1‑150 (MQ=255) cTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCg > 1:335867/1‑150 (MQ=255) tCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCgccat < 1:109442/136‑5 (MQ=255) tCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCgccat > 2:109442/1‑132 (MQ=255) tCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGt < 1:1112621/150‑1 (MQ=255) aaGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTgg < 1:649950/150‑1 (MQ=255) tGCCTATTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGACGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCACGCGGTTGATGCCGTGGGcc > 2:701706/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCa > 2:1321547/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCa > 1:172008/1‑150 (MQ=255) ctctTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCGATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGt < 2:1285245/150‑1 (MQ=255) ctctTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGt > 1:1081744/1‑150 (MQ=255) ctctTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGt > 1:489625/1‑150 (MQ=255) ctctTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGt > 1:1111469/1‑150 (MQ=255) ctctTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTT‑TGCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGt < 1:1298049/150‑1 (MQ=255) tctTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCCTTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGtt > 1:1783905/1‑150 (MQ=255) tttGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTCCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCGGTGTTGCAGGCGTTCGTGGGCATTCCGGCGGGTTTC‑GCCATGCGGTCGATGCCGTGGGCGAGTTCg > 2:664707/1‑150 (MQ=255) gcgcCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGa < 1:1574534/128‑1 (MQ=255) gcgcCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGa > 2:1574534/1‑128 (MQ=255) gcgcCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAg > 1:215944/1‑150 (MQ=255) cgcCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCTGc < 1:833847/150‑1 (MQ=255) gcCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCt > 2:31173/1‑150 (MQ=255) ccATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGACAAGCTTCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTc > 1:416642/1‑150 (MQ=255) cATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCa > 1:1236952/1‑150 (MQ=255) cATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGCCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCa < 2:1021297/150‑1 (MQ=255) tGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATg < 2:1111469/150‑1 (MQ=255) tCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGATGTGTTGCAGTTCGTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGCTCCTGCCGAGCAGGAGGTCGTCCAGCTGATGGc > 1:1532735/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTg > 2:1562722/1‑150 (MQ=255) gATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATg < 1:1202495/150‑1 (MQ=255) gATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATg > 1:980398/1‑150 (MQ=255) aTGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATgg > 1:1187343/1‑150 (MQ=255) ttCTGGATTTCGATGTTTTTTAGGTTCTGGGGCGCGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCg < 2:586082/150‑1 (MQ=255) ggATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAg > 1:373216/1‑150 (MQ=255) gATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTAATGGCTGCCCATGGTCGGCAgg > 1:97593/1‑150 (MQ=255) acttCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGGCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGTGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGc < 2:544996/148‑1 (MQ=255) aTTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGc < 2:172008/150‑1 (MQ=255) tGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGttcttc < 1:1321547/150‑1 (MQ=255) gTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGa > 1:1503328/1‑150 (MQ=255) gTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTGCGGTGGGCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTGCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGa < 1:1116350/150‑1 (MQ=255) tttCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAg < 2:469850/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTCTGGCGGGCGGCTTCGGTGGCCTGGTCGATGTTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCAGGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTg < 2:392648/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCgg > 1:1265694/1‑84 (MQ=255) cAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCgg < 2:1265694/84‑1 (MQ=255) cAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTgg < 1:1530096/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTgg < 1:31173/150‑1 (MQ=255) ggTTCTGGGGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGcc < 2:1436420/150‑1 (MQ=255) gTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCg > 1:1644394/1‑150 (MQ=255) cgcACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGa < 2:373216/150‑1 (MQ=255) gTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGa < 1:812682/150‑1 (MQ=255) gTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGa < 2:125783/150‑1 (MQ=255) tCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGAATTC‑GCCATGCGGTAGATCCACGGGGCCAGCACGTCGACCATGTAGCTGCGCATGGGCGGCATGCGGGGTTCGAGGTTGCCGTCCTTGACCTGaa > 2:1841136/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTg > 1:1718539/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGt < 1:1120576/150‑1 (MQ=255) gCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGt > 1:1418769/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCCGTTCGTACAGCTCATGGCTGAAAATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCGTTGAGCTATTTAACCGTGTGc > 2:446819/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGc > 2:187716/1‑109 (MQ=255) cTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGc < 1:187716/109‑1 (MQ=255) aTGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGc < 2:1236952/150‑1 (MQ=255) tgtgTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCAt < 2:1180982/87‑1 (MQ=255) tgtgTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCAt > 1:1180982/1‑87 (MQ=255) ttGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATg > 1:1463999/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATggg > 2:1197001/1‑147 (MQ=255) gTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATggg < 1:1197001/147‑1 (MQ=255) tcttcGTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGAAAATGAATCACCATTGTAGGCAGTTGTTCTTTGAGTTGGCCTTTCTTGTTCTGATTGACCTCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGt < 2:215944/150‑1 (MQ=255) gTGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATg > 1:692212/1‑150 (MQ=255) tGGGCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGATCTTCGAGGTGGCGGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATgg > 2:1032780/1‑150 (MQ=255) ggCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTg > 1:1579866/1‑150 (MQ=255) gCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGa > 2:1228851/1‑107 (MQ=255) gCATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGa < 1:1228851/107‑1 (MQ=255) cATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCg > 2:1232396/1‑150 (MQ=255) cATTCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCg < 1:197178/150‑1 (MQ=255) ttCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGc < 2:1081744/150‑1 (MQ=255) ttCTGCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGc < 2:489625/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGCCCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCAt < 2:97593/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCAt > 1:467903/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCCATGGGCACGCTTATGGTGCGGCTCAt > 2:1580390/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGTGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCATg < 2:980398/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCATg > 1:1231979/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCATg > 2:765447/1‑150 (MQ=255) agtgTTTC‑GCCATGCGGGTGATGCCGTGGGCAAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGCTTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCAAGGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCATgc < 1:446819/147‑1 (MQ=255) aGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGt > 1:40635/1‑108 (MQ=255) aGGGTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGt < 2:40635/108‑1 (MQ=255) gTTTC‑GCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCATGCGCa > 2:1151583/1‑150 (MQ=255) | ATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTCGGCAGGCGTTCTTCGAGGTGGCCGTCCTTGAGCTGATTGACCGCGTGCTTGATGCGTTCGATGGGGTCGTTGATGGTGCGGCTCATGCGCA > NC_002947/1843982‑1844270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |