Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,470,656 | Δ1 bp | 6.1% | coding (178/1182 nt) | PP_2165 → | two‑component system response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,470,656 | 0 | C | . | 6.1% | 260.9 / 10.9 | 82 | coding (178/1182 nt) | PP_2165 | two‑component system response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/38); new base . (3/2); total (42/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.96e-01 |
ATCGATGACGACGACGTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGCCGCTGGAA > NC_002947/2470509‑2470805 | atcGATGACGACGACGTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCg > 1:420246/1‑150 (MQ=255) gATGACGACGACGTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAg > 2:819480/1‑150 (MQ=255) acgacgacgTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATgg < 1:1341741/150‑1 (MQ=255) acgacgacgTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATgg < 2:1820287/150‑1 (MQ=255) gacgacgTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGggc < 2:247332/150‑1 (MQ=255) acgacgTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGggcg < 2:1383747/150‑1 (MQ=255) gTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTc > 2:1759555/1‑150 (MQ=255) gTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGaa < 2:420246/150‑1 (MQ=255) tCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAAc > 1:470606/1‑150 (MQ=255) cGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTg > 2:1395221/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTTGGTTTCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgt > 1:1152524/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgt > 1:384022/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgtc > 1:1778147/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgtca < 2:1278544/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGAGCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgtca > 1:536873/1‑150 (MQ=255) ccgccTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAAACCCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgtcaggtca > 1:1060135/1‑150 (MQ=255) aTCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCagcgagc < 1:208059/150‑1 (MQ=255) tCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGggcggc < 1:1418038/121‑1 (MQ=255) tCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGggcggc > 2:1418038/1‑121 (MQ=255) tCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgtcaggtcag > 2:1276537/1‑144 (MQ=255) tCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgtcaggtcag < 1:1276537/144‑1 (MQ=255) aaGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTgcgc < 1:1395221/150‑1 (MQ=255) aCAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGcgccgc > 1:584065/1‑150 (MQ=255) aCAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGcgccgc > 1:700972/1‑150 (MQ=255) aGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAg < 1:1626529/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGc > 1:1704912/1‑150 (MQ=255) tttCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGcc > 1:579865/1‑150 (MQ=255) tCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCgg < 1:1349819/150‑1 (MQ=255) ctccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtg < 1:223185/150‑1 (MQ=255) tccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGATCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtgg > 2:1081797/1‑150 (MQ=255) tccAGGCCGGTAATGCCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCGCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGGGATCgtgg > 2:1714913/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtggt < 2:718519/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtggt < 1:737473/150‑1 (MQ=255) aGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGggcgg < 2:1371983/91‑1 (MQ=255) aGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGggcgg > 1:1371983/1‑91 (MQ=255) aGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGATCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGgtgt < 1:1081797/150‑1 (MQ=255) gTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTg < 2:384022/150‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTgaga > 1:408187/1‑147 (MQ=255) tGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCgg < 1:819480/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGc > 2:1576222/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGaa > 2:981522/1‑86 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ttCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATc > 1:124741/1‑119 (MQ=255) ttCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATc < 2:124741/119‑1 (MQ=255) ttCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATg < 1:368959/150‑1 (MQ=255) ggTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGt < 2:700972/150‑1 (MQ=255) ttCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCTGGTGTCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGaa > 1:397525/1‑150 (MQ=255) ttCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGaa > 1:733913/1‑150 (MQ=255) tCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtg > 1:1311924/1‑113 (MQ=255) tCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtg < 2:1311924/113‑1 (MQ=255) tCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAg > 2:1777846/1‑150 (MQ=255) ccGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAg < 2:429636/149‑1 (MQ=255) gaagaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTg > 2:1407509/1‑144 (MQ=255) gaagaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTg < 1:1407509/144‑1 (MQ=255) gaagaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCg > 2:692749/1‑150 (MQ=255) aagaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTTCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCgg > 1:386814/1‑149 (MQ=255) aaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTgc < 2:584065/150‑1 (MQ=255) cacCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTgcgc < 1:1576222/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTg > 2:450452/1‑150 (MQ=255) cAGACCGACCGCGTGATTTGTCATCTGC‑GCATGCCTCAGATGGCCGGCCTCGATCTCCTCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCTCAGTTGCTGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGCCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTg < 2:420601/150‑1 (MQ=255) aGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTAAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTgg < 1:1759555/150‑1 (MQ=255) cccGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGgc < 2:1420835/150‑1 (MQ=255) gACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGcgcc > 1:1919480/1‑150 (MQ=255) aCCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGcgccg > 2:1733698/1‑150 (MQ=255) gTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGAc < 2:733913/150‑1 (MQ=255) tgcgatctgc‑gCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGGGGGAGCGTTGCGCCTGGACGCCGCCGACTACCta > 2:481732/1‑149 (MQ=255) tgcgatctgc‑gCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTAGTGCGGTGGAAGGGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtc > 1:1563556/1‑150 (MQ=255) ccatctgcgGCATG‑CGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtcat > 1:1364646/3‑150 (MQ=255) ccatctgcgGCATG‑CGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtcat > 2:1820614/3‑150 (MQ=255) ccatctgcgGCATG‑CGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtcat > 1:1364622/3‑150 (MQ=255) gatctgc‑gCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtcatc < 2:1575799/150‑1 (MQ=255) catctgcgGCATG‑CGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtcatc < 2:1364622/149‑1 (MQ=255) catctgcgGCATG‑CGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtcatc < 2:1364646/149‑1 (MQ=255) tctgc‑gCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCaa < 1:1733698/150‑1 (MQ=255) tgc‑gCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGc < 1:910994/150‑1 (MQ=255) aTGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCACCGACTACCTCATCAAGCCGCTg < 1:444024/150‑1 (MQ=255) ccGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGCCTACCTCATCAAGCCGCTGGaa < 2:356676/150‑1 (MQ=255) ccGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGCCCCTGTaa < 2:470606/150‑1 (MQ=255) | ATCGATGACGACGACGTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGCCGCTGGAA > NC_002947/2470509‑2470805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |