| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,989,571 | Δ1 bp | 5.6% | coding (1952/2169 nt) | vgrG‑I ← | type VI secretion system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,989,571 | 0 | C | . | 5.6% | 216.0 / 6.0 | 71 | coding (1952/2169 nt) | vgrG‑I | type VI secretion system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/37); new base . (2/2); total (31/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACAGGCGCTCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGGTGTGGTGATTGGCGGCGAT > NC_002947/2989422‑2989719 | acaGGCGCTCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGccac > 1:455038/1‑150 (MQ=255) ggCGCTCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAg > 2:339934/1‑150 (MQ=255) gcgcTCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCGGCGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAgg > 1:495715/1‑150 (MQ=255) cgcTCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAggg < 2:647534/150‑1 (MQ=255) gcTCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGc < 2:330001/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCA‑CGGGGCCtt > 2:1879515/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCA‑CAGGGCCtt > 2:1882660/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCtt < 2:760050/150‑1 (MQ=255) aGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGGTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTgg > 1:443734/1‑150 (MQ=255) gCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGa < 1:339934/150‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGa < 2:1378235/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGAcc > 2:883584/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCAc < 1:785904/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCAc < 1:774227/150‑1 (MQ=255) aGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGc < 1:39499/150‑1 (MQ=255) aGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGc < 1:344235/150‑1 (MQ=255) gtTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCAATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTc < 1:1795822/150‑1 (MQ=255) tgctgATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGaa < 2:1925224/150‑1 (MQ=255) ctgATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGt > 1:1887977/1‑150 (MQ=255) tgATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAg < 2:244949/148‑1 (MQ=255) tgATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAg > 1:244949/1‑148 (MQ=255) tgATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGtt > 2:1838092/1‑150 (MQ=255) tGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCAt < 2:12212/150‑1 (MQ=255) ggAAAAGGGGATTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATGTTGCCGGTGATGCGAACAGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATa > 2:746585/1‑150 (MQ=255) gAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATaa < 1:827034/150‑1 (MQ=255) gAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATaa > 1:1165292/1‑150 (MQ=255) gAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATaa > 1:194524/1‑150 (MQ=255) gAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATaa < 1:1819095/150‑1 (MQ=255) aaaaGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAAc > 1:670152/1‑150 (MQ=255) aaaGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACg > 1:197918/1‑150 (MQ=255) gggCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGa < 2:509476/150‑1 (MQ=255) gggCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGa < 2:1165292/150‑1 (MQ=255) ttGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTAc < 2:194524/150‑1 (MQ=255) gTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTg > 1:1511656/1‑150 (MQ=255) ttCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGCATAGTCGGGCTGTCCAGTGTGCTAGAAGTTTCGTCCGGTCGAGTGGAGCCACTAGGGCCTGTGATGTCCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGc > 2:687983/1‑150 (MQ=255) ttCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGCTTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTgg > 1:820755/1‑149 (MQ=255) ttCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTc < 1:1262002/130‑1 (MQ=255) ttCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTc > 2:1262002/1‑130 (MQ=255) ttCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGACGACTCGAAGGTAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGc > 2:913787/1‑150 (MQ=255) gttggCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGat < 1:56376/146‑1 (MQ=255) aTTTGCCGACTTCAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCTTCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGat < 2:637812/150‑1 (MQ=255) aTTNGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGat > 2:1199375/1‑150 (MQ=255) tttGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCtt > 2:796224/1‑94 (MQ=255) tttGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCtt < 1:796224/94‑1 (MQ=255) tGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATc < 2:1511656/150‑1 (MQ=255) ttGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGAt > 1:1554375/1‑89 (MQ=255) ttGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGAt < 2:1554375/89‑1 (MQ=255) gCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCA‑CAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTc < 1:1879515/150‑1 (MQ=255) gCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCA‑CAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTc < 1:1882660/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCa > 1:1235002/1‑150 (MQ=255) ccGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCg < 2:1887977/150‑1 (MQ=255) tGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCAt > 2:1589328/1‑150 (MQ=255) gATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTAGTCGATTCGGATGGCGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATg < 2:1159767/150‑1 (MQ=255) aTGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGc < 2:670152/150‑1 (MQ=255) gAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCtt > 2:1312748/1‑150 (MQ=255) aaTCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACTGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTc < 2:666439/150‑1 (MQ=255) tcgGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGAccc < 1:468191/150‑1 (MQ=255) ggCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGaa > 1:1219168/1‑81 (MQ=255) ggCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGaa < 2:1219168/81‑1 (MQ=255) ggCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGtt > 2:966428/1‑150 (MQ=255) cTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATGTCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGc < 2:542083/150‑1 (MQ=255) cAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGaa > 1:937552/1‑150 (MQ=255) tgtgATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGtt < 1:1589328/150‑1 (MQ=255) gtcgATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGgt > 1:220650/1‑150 (MQ=255) gtcgATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGgt < 1:1838092/150‑1 (MQ=255) tcgATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGgtg < 1:883584/150‑1 (MQ=255) gATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGGtgtg < 1:1136491/150‑1 (MQ=255) aTTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGGTgtgg < 2:127796/150‑1 (MQ=255) ttCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGGTgtggt < 2:70266/150‑1 (MQ=255) aaTGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGACGTTCATAACGGCGAGTGCGTCTGCGGATATTCCCCCGGGCTTCCCGCTCGGCATGCCCTTCGCCCGGTTGCTCGGAGTTGTCACCCATACGGGTGTGGTGAtt > 1:599470/1‑150 (MQ=255) gCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGa > 1:769435/1‑55 (MQ=255) gCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGa < 2:769435/55‑1 (MQ=255) caccaGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGGTGTGGTGATTGGCGGCGa < 2:1235002/150‑1 (MQ=255) accaGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGGTGTGGTGATTGGCGGCGAt < 1:1707052/150‑1 (MQ=255) | ACAGGCGCTCCAGCGGCTTGCCAGTGTTCGGTGCACTGCTGATGGAAAAGGGGCTTGTCGTTCCATTTGCCGACTTGAGCATCTGGCCGGTGATGCGAATCGTCGGGCTGTCCAGTGTGATGCCTGTTTCGTCGATTCGAATGGAGCCACCAGGGCCTTGGATGACCACGGCTTCCGATGCTCGAAGTTCATAACGGCGAGTACGTCTGCGGATATCCCCACGGGCTTCCAGCTCGGCATGCCCTTCGACCCGTTGCTCGAAGTTGCCACCGATACGGGTGTGGTGATTGGCGGCGAT > NC_002947/2989422‑2989719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |