| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,489,826:1 | +C | 9.1% | coding (260/597 nt) | PP_4825 → | MarC family membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,489,826 | 1 | . | C | 9.1% | 237.3 / 19.2 | 66 | coding (260/597 nt) | PP_4825 | MarC family membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (26/34); new base C (2/4); total (28/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.99e-01 | |||||||||||
CAAGCAACTGGCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGAGCCAGCCGCACTGGGATGAA > NC_002947/5489677‑5489971 | caagcaaCTGGCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTggg < 2:1042084/150‑1 (MQ=255) gcaaCTGGCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGTTCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGAATGGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CAt < 1:1590164/150‑1 (MQ=255) gcaaCTGGCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCAATCTCCGTAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CAt < 1:1177198/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATgg < 1:1035392/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTTACTTTAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGccc > 1:576543/1‑150 (MQ=255) tGGCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGccc > 1:963623/1‑150 (MQ=255) gCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAg < 1:1134417/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CCATGCCCAggg < 1:1605700/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CCATGCCCAggg < 1:1605339/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAggg > 1:568814/1‑150 (MQ=255) tGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTATTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGGCCAT‑GCCCAGGGc < 1:591867/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTATTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGGCCAT‑GCCCAGGGcc < 2:992018/150‑2 (MQ=255) aGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGGCCAT‑GCCCAGGGccgaa < 1:323416/150‑5 (MQ=255) aGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CCATGCCCAGGGccgaa < 1:323062/150‑5 (MQ=255) gcgTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCCAGCcggcg > 2:1041071/1‑150 (MQ=255) gcgTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTACGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCcggcg > 2:1833002/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGc < 2:704875/150‑1 (MQ=255) ccTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAg < 2:1831411/150‑1 (MQ=255) ccTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAg < 2:1831947/150‑1 (MQ=255) cTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGa > 1:1861942/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGTGAGCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCATATTTCTTGCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACaa < 1:329285/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTATTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACaa < 2:963623/150‑1 (MQ=255) cGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTcagca < 1:666746/150‑1 (MQ=255) gCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGAtgt < 1:662342/150‑1 (MQ=255) tGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGa < 2:568814/150‑1 (MQ=255) tGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGa > 1:788437/1‑150 (MQ=255) tACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGAcc > 2:507327/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGGCCAT‑GCCCAGGGccg < 1:271714/104‑3 (MQ=255) ttCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGGCCAT‑GCCCAGGGccg > 2:271714/1‑102 (MQ=255) gggcgATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGa > 1:1321183/1‑135 (MQ=255) gggcgATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGa < 2:1321183/135‑1 (MQ=255) gggcgATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGa < 2:607127/150‑1 (MQ=255) gcgATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGAcc > 1:935720/1‑150 (MQ=255) gATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCAt > 1:560012/1‑150 (MQ=255) aTCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCAtt > 2:184115/1‑150 (MQ=255) tCTTCGGAATTTTCGGCATAACCGCCGATGCGTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTc < 2:576543/150‑1 (MQ=255) tttCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCAGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGt < 1:1310449/150‑1 (MQ=255) tCGGCATCACCGCCGAGGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATTGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTg < 1:493337/150‑1 (MQ=255) tCGGCACCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTg < 2:1847881/150‑1 (MQ=255) ggCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGc > 2:140826/1‑150 (MQ=255) gCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGcc > 1:762069/1‑150 (MQ=255) cctCACCGCCGATGCCTTCCGATTTGGTGCTGGTCGCGTCCTGTTTTGTTCTGCCTTGGG‑CATGCCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTCCATCAGGATGTGACCCTCGTACCGCTGAGGATTGCGCTGACCGGTGGccc < 2:500412/148‑1 (MQ=255) cACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCTGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGa < 2:731751/105‑1 (MQ=255) cACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGa > 1:731751/1‑105 (MQ=255) aCCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGc > 2:436238/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGc > 2:221738/1‑150 (MQ=255) ccgccgATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGAGATCACACG‑TCTCAACTTTCAGCAGGATGTTACCACCGCACCGCTGAGCATTCGGCTGACCGTTGGCCCCGGCa > 1:34537/1‑150 (MQ=255) cgccgATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAgg < 2:132496/83‑1 (MQ=255) cgccgATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAgg > 1:132496/1‑83 (MQ=255) cTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGc > 1:1105829/1‑150 (MQ=255) ttCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGcc > 2:1405642/1‑150 (MQ=255) aTCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACGATCGGTGCCctgctg > 2:612737/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTgg < 1:184115/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATg < 1:1405642/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGTGTTGTTGGTTTCGGCCCGGGG‑CATGGCCAAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATCCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCAACATCGGTGCCCTGCTGGTGATgg < 2:431615/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATggg < 2:305526/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATgggg < 2:935720/150‑1 (MQ=255) cAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGt < 2:1105829/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTGTTCCTTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGa < 1:1833002/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCACGGCCAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGa < 1:1041071/150‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGagc < 2:34537/150‑1 (MQ=255) gCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGagcca < 2:1861942/150‑1 (MQ=255) ttCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGAGCCAGCCg > 1:1330791/1‑150 (MQ=255) aTTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGAGCCAGCCGCAc > 2:1768635/1‑150 (MQ=255) cccTGGGCCAT‑GCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGAGTGAGCCAGCCGCACTGGGATg > 2:459564/1‑150 (MQ=255) ccTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGAGCCAGCCGCACTGGGATGa > 1:925816/1‑150 (MQ=255) cTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGAGCCAGCCGCACTGGGATGaa > 2:1846922/1‑150 (MQ=255) | CAAGCAACTGGCCTGGAAGGTCGCGTTCGCAGCCTTGGTCGCCAGCGTGTTGCTGTACCTGTTCGGGCGGGCGATCTTCGGAATTTTCGGCATCACCGCCGATGCCTTCCGCATCGGTGCTGGCAGCGTGCTGTTCATTTCGGCCCTGGG‑CATGGCCCAGGGCAAGCCGGCGGT‑ACAGGCAGACAACGTTCAGCAGGATGTGACCATCGTACCGCTGACCATTCCGCTGACCGTTGGCCCCGGCACCATCGGTGCCCTGCTGGTGATGGGGGTGAGCCAGCCGCACTGGGATGAA > NC_002947/5489677‑5489971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |