| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,141,094:1 | +A | 7.2% | coding (787/2214 nt) | PP_1897 → | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,141,094 | 1 | . | A | 7.2% | 370.2 / 21.9 | 97 | coding (787/2214 nt) | PP_1897 | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (50/40); new base A (4/3); total (54/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.02e-01 | |||||||||||
TTGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTCCGTTGCTGGTTGCACTGGTC > NC_002947/2140947‑2141243 | ttGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑Tg < 1:1247904/150‑1 (MQ=255)ttGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑Tg < 1:1807594/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGc < 1:1655071/150‑1 (MQ=255) aGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCa > 1:741983/1‑150 (MQ=255) aGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCa > 1:1241813/1‑150 (MQ=255) aGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCa > 1:408858/1‑150 (MQ=255) ggCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCAt < 1:568057/150‑1 (MQ=255) ccACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCCATGGCCagg > 1:1014332/1‑148 (MQ=255) cGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGc > 2:1896556/1‑150 (MQ=255) gCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCCATGGCCA‑GGCCGCAg < 2:1014332/150‑1 (MQ=255) ggTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCGACGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCt < 2:731874/150‑1 (MQ=255) gTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTg < 1:770953/150‑1 (MQ=255) ccTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGcc < 1:186464/130‑1 (MQ=255) ccTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGcc > 2:186464/1‑130 (MQ=255) cTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTAc > 1:131461/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGATGTCGCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATAGCCGCAGCGCTGGCCTAc > 2:1006251/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGGCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGTCGGCAAGGCTACCGGGGTTACCCTGGGCCTTCGGCC‑TGGCCATGGCCGCTGGGCGGGGCTACg > 2:638977/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACg > 2:456369/1‑150 (MQ=255) ttGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACggg > 2:773335/1‑150 (MQ=255) ttacGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGtggctggc > 2:336868/4‑150 (MQ=255) ttCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCCATGGCCA‑GGCCGCAg > 1:1061628/1‑128 (MQ=255) ttCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCCATGGCCA‑GGCCGCAg < 2:1061628/128‑1 (MQ=255) cGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGtggctggctgg < 1:1838015/150‑1 (MQ=255) gCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCg < 2:1370162/150‑1 (MQ=255) aGCACATCGGCCTGGACGCCGGTTTGCGCTATGGCGTGGTCGCCGGGCTTGCGCGGGGGGGGGTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTg > 2:1365843/1‑150 (MQ=255) gCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTgg < 2:1661900/150‑1 (MQ=255) gCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTgg > 2:1678780/1‑150 (MQ=255) gCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTgg < 2:661017/150‑1 (MQ=255) cacaTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTggg < 2:1556449/150‑1 (MQ=255) cacaTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTggg < 1:803604/150‑1 (MQ=255) cacaTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTggg < 1:1896556/150‑1 (MQ=255) ccaTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTgggg < 1:638977/149‑1 (MQ=255) caTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGt < 2:1455945/150‑1 (MQ=255) caTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGt < 1:810882/150‑1 (MQ=255) caTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGt < 2:1241813/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGTCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTAc < 1:824784/126‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGTCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTAc > 2:824784/1‑126 (MQ=255) tCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑Tg < 2:895661/101‑1 (MQ=255) tCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑Tg > 1:895661/1‑101 (MQ=255) gCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCt < 1:755421/115‑1 (MQ=255) gCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCt > 2:755421/1‑115 (MQ=255) gCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAg > 1:771878/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGCGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAg > 2:265052/1‑150 (MQ=255) gTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAg > 1:866424/1‑150 (MQ=255) gCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCCATGGcc < 1:445476/94‑1 (MQ=255) gCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCCATGGcc > 2:445476/1‑94 (MQ=255) tttGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGgcctg > 1:466643/1‑150 (MQ=255) ttgtgctATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGgcctgc < 2:514/145‑1 (MQ=255) ttGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGgcctgc < 1:773335/150‑1 (MQ=255) ttGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGgcctgc < 1:5909/150‑1 (MQ=255) tGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGgcctgcc < 1:195404/150‑1 (MQ=255) cgctATGGCGTGGGCGCCTTGCTGGCGCGGTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGcctgcctg > 2:967427/3‑150 (MQ=255) ctATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCAGGCGAGGCTAGAAGGGGTAGCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGAt > 2:1005982/1‑150 (MQ=255) aTGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGTCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGc < 1:763636/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGc > 2:555470/1‑79 (MQ=255) aTGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGc < 1:555470/79‑1 (MQ=255) gCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTgg > 1:590637/1‑150 (MQ=255) 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tGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGACGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGc < 1:1859562/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCtttt > 2:1565234/1‑150 (MQ=255) gTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCtttttt < 1:1365843/150‑1 (MQ=255) ggTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTc < 1:1678780/150‑1 (MQ=255) ttACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTCCg > 2:343934/1‑150 (MQ=255) 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gCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTCTTCCGTTGCTGGtt > 1:565761/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGAt > 1:1686899/1‑82 (MQ=255) ccTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGAt < 2:1686899/82‑1 (MQ=255) ccTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTCCGTTGCTGGTTg > 1:965550/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTCCGTTGCTGGTTg > 1:1175479/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCATGGCCA‑GGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTCCGTTGCTGGTTGCa > 1:1616291/1‑150 (MQ=255) 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TTGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTCCGTTGCTGGTTGCACTGGTC > NC_002947/2140947‑2141243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |