| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,316,298:1 | +C | 6.8% | coding (59/1548 nt) | PP_2038 → | long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,316,298 | 1 | . | C | 6.8% | 287.9 / 15.0 | 73 | coding (59/1548 nt) | PP_2038 | long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (37/31); new base C (2/3); total (39/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.47e-01 | |||||||||||
GTTATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAGGTGG > NC_002947/2316149‑2316447 | gTTATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGt < 1:344278/150‑1 (MQ=255) ttATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑g > 2:1085807/1‑150 (MQ=255) ttATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑g > 1:583094/1‑150 (MQ=255) tATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCTATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑Ga < 1:498030/150‑1 (MQ=255) tATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑Ga < 1:916642/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GAt < 1:1491634/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCGTCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCCTGGCGCCCTAGCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATc < 1:988148/150‑1 (MQ=255) gCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGa > 1:775037/1‑150 (MQ=255) gTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGAcc > 2:752601/1‑150 (MQ=255) tccGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCcac > 2:176616/3‑150 (MQ=255) aCGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCcaca > 2:1497448/1‑150 (MQ=255) cGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGTCGATC‑ACCGCCagac < 1:645692/150‑1 (MQ=255) gCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACAcc > 2:1854508/1‑150 (MQ=255) aaCTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCg > 1:1125003/1‑150 (MQ=255) tGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCt > 1:944484/1‑150 (MQ=255) tACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCtt < 1:808185/150‑1 (MQ=255) ttGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGc > 2:1467058/1‑150 (MQ=255) ttGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGc > 1:1098638/1‑150 (MQ=255) gCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTc < 2:33063/150‑1 (MQ=255) ccGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGc > 1:1007013/1‑150 (MQ=255) ttCACGCTGTTTAGCATCGATCGGTTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCtt < 2:545385/137‑1 (MQ=255) ttCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCtt > 1:545385/1‑137 (MQ=255) cGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCAGCTGACCTTCGCTCAGCTCGaacaac > 2:145446/1‑150 (MQ=255) tGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACggg < 2:775037/150‑1 (MQ=255) gCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCCCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGAGCCAAcc > 2:830422/1‑150 (MQ=255) cgatcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCt < 2:1098638/150‑1 (MQ=255) cgatcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCt < 1:259819/150‑1 (MQ=255) gatcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTg < 1:1083198/150‑1 (MQ=255) gatcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTg > 2:812647/1‑150 (MQ=255) tcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGc > 1:884806/1‑138 (MQ=255) tcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGc < 2:884806/138‑1 (MQ=255) gggTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGTCGATC‑ACCGCcagac > 2:693500/1‑100 (MQ=255) gggTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGTCGATC‑ACCGCCagac < 1:693500/103‑1 (MQ=255) gTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAGCCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCg < 2:1121351/150‑1 (MQ=255) gTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCg > 1:1527760/1‑150 (MQ=255) aaCCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAACTGGCCTCGGCCtt < 2:1922767/150‑1 (MQ=255) cGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTAGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCt < 2:1082954/150‑1 (MQ=255) agaACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAgg < 2:1007013/150‑1 (MQ=255) aacaacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGc > 1:831481/1‑150 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATc > 2:966787/1‑150 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATc < 2:1527760/150‑1 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATc < 1:1497448/150‑1 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTAACCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGCCCTTGGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATc < 2:1206156/150‑1 (MQ=255) gTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACg > 2:803631/1‑150 (MQ=255) ccTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGa < 1:1338243/150‑1 (MQ=255) ccTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGa < 2:1125003/150‑1 (MQ=255) ttGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGc > 2:1245310/1‑150 (MQ=255) tGGAACCCTTTCCAGTGGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GCTCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCa < 2:109996/150‑1 (MQ=255) aaCCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGAc > 2:91744/1‑72 (MQ=255) aaCCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGAc < 1:91744/72‑1 (MQ=255) aaCCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGt > 2:1714648/1‑150 (MQ=255) aCCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTc < 1:1085807/150‑1 (MQ=255) cccTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCg > 1:1136705/1‑150 (MQ=255) cTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGcc > 1:1652139/1‑150 (MQ=255) tCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTgg > 2:1693053/1‑115 (MQ=255) tCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTgg < 1:1693053/115‑1 (MQ=255) ccAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGAGCGATCATGTCGCCAGCCATGCTCCCAAcc > 2:1361077/1‑150 (MQ=255) gATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACcgcg > 2:222418/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGa > 2:1266017/1‑150 (MQ=255) tGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGaa > 2:852131/1‑150 (MQ=255) ccTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACAACCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACtg < 2:992432/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACtggtgg > 1:198094/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAg < 1:1266017/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAg > 2:1510652/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCAAAGGGCGAGCATCTCTTGATCCTTGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAg > 1:1866812/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCGTGCTGGCACAGGGCATCGCAACAGGAGAAAAAGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAg > 1:1866960/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTCGATC‑ACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCt < 2:360403/79‑1 (MQ=255) tGGCGGTCGATC‑ACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCt > 1:360403/1‑79 (MQ=255) tGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCag < 2:573651/150‑1 (MQ=255) tGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCag > 1:523230/1‑150 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACcgcg < 1:1485390/130‑1 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCagag > 2:1769242/1‑150 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGCGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACcgcg > 2:1485390/1‑130 (MQ=255) cGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAgg < 1:1361077/150‑1 (MQ=255) ggT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCTCGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAGGt < 2:831481/150‑1 (MQ=255) ggT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAGGt > 2:955202/1‑150 (MQ=255) t‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTCCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGCGGTgg > 2:1350738/1‑150 (MQ=255) | GTTATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAGGTGG > NC_002947/2316149‑2316447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |