| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,404,283:1 | +A | 6.1% | coding (867/1209 nt) | PP_2106 → | ammonium transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,404,283 | 1 | . | A | 6.1% | 330.8 / 14.3 | 82 | coding (867/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (40/37); new base A (3/2); total (43/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.99e-01 | |||||||||||
ACTCGTTGATGGCCATGGTGGGTGGCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTCGGCCAGGTGGCGTT > NC_002947/2404135‑2404432 | aCTCGTTGATGGCCATGGTGGGTGGCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑g > 1:1767911/1‑150 (MQ=255) gATGGCCATGGTGGGTGGCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCtggt < 1:671232/150‑1 (MQ=255) aTGGCCATGGTGGGTGGCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCtggtg > 2:1675967/1‑150 (MQ=255) ccATGGTGGGTGGCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGAGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑AGGCCGGTGG‑Cga < 2:388567/150‑2 (MQ=255) aTGGTGGGTGGCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑Cgggg > 2:234265/1‑150 (MQ=255) ggtgggtgGCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGgc > 1:677076/1‑150 (MQ=255) gtggCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGt < 2:1433513/150‑1 (MQ=255) gtggCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGt > 1:47287/1‑150 (MQ=255) tggCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTATGCATCAAGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTTTCGATTAGTTCATGGGCCTATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGtt > 2:1161559/1‑150 (MQ=255) gCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTg > 2:1378432/1‑150 (MQ=255) gCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGATCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTg > 1:1303562/1‑150 (MQ=255) cACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCtggtg < 2:768294/133‑1 (MQ=255) cACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCtggtg > 1:768294/1‑133 (MQ=255) cACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGt < 1:234265/150‑1 (MQ=255) cACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGt > 1:1685174/1‑150 (MQ=255) ccccTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTc < 1:1856237/149‑1 (MQ=255) cccTTTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCt > 2:1268940/1‑150 (MQ=255) cccTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGCGGTCTGTTTGTCt < 1:921378/150‑1 (MQ=255) gTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGAc > 2:1240423/1‑150 (MQ=255) tCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGGGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGAcc > 2:279273/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCGGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCGGGTGGCGGTTTGCGCAGGTTCCGATCTGATTCGCCCGGGGGGTGCGCTCGCGACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGGTGTTTGTCTGGaggttaac > 1:185865/1‑143 (MQ=255) cGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCa > 1:847587/1‑150 (MQ=255) gcgcAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTTGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCaaaa < 1:1445262/150‑1 (MQ=255) gcgcAACGACCCAGGCTTTCTCCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCaaaa < 1:883389/150‑1 (MQ=255) aaCGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑Cgg < 1:173305/109‑1 (MQ=255) aaCGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑Cgg > 2:173305/1‑109 (MQ=255) aaCGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGc > 2:203792/1‑150 (MQ=255) aCGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCt < 2:23503/150‑1 (MQ=255) gACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTgg < 2:1923574/150‑1 (MQ=255) ccGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGaaa > 1:29785/1‑150 (MQ=255) cGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCCCCCGCCACCAGGCC‑GGTGG‑Cgag < 1:27929/103‑3 (MQ=38) cGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCCCCCGCCACCAGGCC‑GGTGG‑Cgag > 2:27929/1‑101 (MQ=38) tttCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACCAGGCC‑GGTGG‑Cgag > 1:437521/1‑96 (MQ=255) tttCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATcgac < 1:1240423/150‑1 (MQ=255) tttCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑AGGCCGGTGG‑Cgag < 2:437521/98‑3 (MQ=255) tGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATcgacga > 2:1710045/1‑148 (MQ=255) tGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATcgacga < 1:1710045/148‑1 (MQ=255) tGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGacgacg > 1:519633/1‑150 (MQ=255) tGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGacgacg > 1:1730438/1‑150 (MQ=255) gCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGt > 1:733612/1‑150 (MQ=255) aTAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTcc > 1:1362688/1‑150 (MQ=255) tAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCt < 2:579971/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTg < 2:47287/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTg > 2:146359/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGc < 2:909226/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGc < 1:203792/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTa > 2:1874960/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTa > 1:1132361/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATg < 1:1378432/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCg < 2:677076/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGGTGGCGATCTGCGCACTTTCCTATCTGATGCACCCGGTGGGTGAGCTCGCCTCC‑GGCCTGTTGG‑CGGGCGCCTTGTTTGTCTGCATCTTCATCGCCGCTCAAAATTGCTCGAAAATCCACGAAGTCCTGGGCTTATGGCCGtt < 2:1303562/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCAt < 2:1767911/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCAt < 2:1685174/150‑1 (MQ=255) tggCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCGACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTc > 2:1708554/1‑150 (MQ=255) ggCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAAt < 2:208186/114‑1 (MQ=255) ggCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAAt > 1:208186/1‑114 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cTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATc < 1:403995/150‑1 (MQ=255) tGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATcgac > 1:72017/1‑95 (MQ=255) tGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATcgac < 2:72017/95‑1 (MQ=255) aCCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCtgtg > 2:1826254/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCtgtg > 2:1664722/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCtgtg < 1:1874960/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCtgtg < 1:1675967/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGAGGGGTGGCATCGCCTTTGGc < 2:1168840/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGGTGCGATCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGc < 1:1340851/150‑1 (MQ=255) ggtgCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTc > 2:102645/1‑150 (MQ=255) tgCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTCgg > 1:1028647/1‑150 (MQ=255) gcTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTCGGCCa > 1:1530613/1‑150 (MQ=255) tCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTCGGCCAgg > 2:422776/1‑150 (MQ=255) tCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTCGGCCAgg > 2:1729640/1‑150 (MQ=255) cGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTCGGCCAGGt < 2:1028647/150‑1 (MQ=255) c‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTCGGCCAGGTGGCGtt < 1:1161559/150‑1 (MQ=255) | ACTCGTTGATGGCCATGGTGGGTGGCACCCTGTCAGCGTTGCTGGCCGGGCGCAACGACCCGGGCTTTCTGCATAACGGCCCGCTGGCCGGGCTGGTGGCGATTTGCGCAGGTTCCGATCTGATGCACCCGGTGGGTGCGCTCGCCACC‑GGCCTGGTGG‑CGGGGGCGCTGTTTGTCTGGACCTTCACCGCCGCGCAAAATCGCTGGAAAATCGACGACGTCCTGGGCGTATGGCCGTTGCATGGTCTGTGTGGCGTGTGGGGTGGCATCGCCTGTGGCGTGTTCGGCCAGGTGGCGTT > NC_002947/2404135‑2404432 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |