| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,552,442:1 | +G | 6.2% | coding (56/978 nt) | PP_3137 → | group 2 family glycosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,552,442 | 1 | . | G | 6.2% | 328.9 / 14.6 | 81 | coding (56/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (39/37); new base G (2/3); total (41/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
TGGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCC > NC_002947/3552293‑3552590 | tGGTAGATGTGCCTGACCATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGCGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGa < 2:1734944/150‑1 (MQ=255) tAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑gcg > 1:1747827/1‑150 (MQ=255) tAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGG‑CAGCG‑CTCGA‑ggcgc > 1:566053/1‑146 (MQ=255) gATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGTGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCt > 1:530467/1‑150 (MQ=255) gtgCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGG‑CAGCG‑CTCGAGGCGCTggcc < 2:566053/150‑4 (MQ=255) cTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGt > 2:1720074/1‑150 (MQ=255) tGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGtt > 2:1468032/1‑150 (MQ=255) tGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCG‑CTCGAGGCGCTggc > 2:1699458/1‑143 (MQ=255) tGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCG‑CTCGAGGCGCTggc < 1:1699458/145‑3 (MQ=255) aCAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTc < 2:467361/150‑1 (MQ=255) aaTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGcc < 1:1151961/141‑1 (MQ=255) aaTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGca > 2:1151961/1‑140 (MQ=255) aaTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGttt < 2:1874376/147‑1 (MQ=255) aaTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGttt > 1:1874376/1‑147 (MQ=255) aaTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGc > 2:629005/1‑150 (MQ=255) aTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCCTCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTNGCt < 2:1187018/150‑1 (MQ=255) aTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCGTCAAGGCCCGGTATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCt < 2:419790/150‑1 (MQ=255) aTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCt > 1:472029/1‑150 (MQ=255) ttCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTg < 1:787413/150‑1 (MQ=255) cACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGgc > 1:1741156/1‑150 (MQ=255) cACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGgc < 1:1791625/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCG‑CTCGAGGCGCTgg > 2:1173447/1‑130 (MQ=255) gCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCG‑CTCGAGGCGCTgg < 1:1173447/131‑2 (MQ=255) gCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGACGACaaa < 2:472029/150‑1 (MQ=255) ccGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACaaa > 2:1044145/1‑149 (MQ=255) ccGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACaaa > 2:1045349/1‑149 (MQ=255) ccGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACaaa < 1:1044145/149‑1 (MQ=255) ccGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACaaa < 1:1045349/149‑1 (MQ=255) ggCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTc > 2:1767022/1‑150 (MQ=255) ggCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTc < 1:550713/150‑1 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATg > 1:1029582/1‑150 (MQ=255) atcatcAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGt < 1:1824157/150‑1 (MQ=255) atcatcAAGGCCCGGCAGCCGGGCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGt < 2:140785/150‑1 (MQ=255) tcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGt > 2:261645/1‑150 (MQ=255) atgatggccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGt < 1:844979/143‑1 (MQ=255) ggCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGAc < 1:629005/150‑1 (MQ=255) cccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTc > 1:307233/1‑145 (MQ=255) cccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTc < 2:307233/145‑1 (MQ=255) ccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCg > 2:1332593/1‑150 (MQ=255) cGGCCGCCGTGGCTTCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc < 2:1029582/150‑1 (MQ=255) cGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc > 2:1570125/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAcc < 2:1741156/150‑1 (MQ=255) gccgccGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGt > 1:1283013/1‑97 (MQ=255) gccgccGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGt < 2:1283013/97‑1 (MQ=255) cATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCt < 2:1687335/150‑1 (MQ=255) aTCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTg > 2:1380747/1‑150 (MQ=255) tCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGtt > 2:1527746/1‑150 (MQ=255) tCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGtt < 1:1332593/150‑1 (MQ=255) gTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTc > 2:1586719/1‑105 (MQ=255) gTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTc < 1:1586719/105‑1 (MQ=255) gTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgcc > 2:1557077/1‑150 (MQ=255) gTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTCGCGGTTCTTGGCCTCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGATGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTAGCTGCAGTTGgcc < 2:1096737/150‑1 (MQ=255) tGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGttccccc > 1:1131156/1‑145 (MQ=255) aGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgg > 1:175294/1‑118 (MQ=255) aGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgg < 2:175294/118‑1 (MQ=255) gCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCaa < 1:1527746/150‑1 (MQ=255) ggCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTgg < 2:1869282/150‑1 (MQ=255) gCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGc < 2:1156022/150‑1 (MQ=255) cAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCg > 1:1188802/1‑150 (MQ=255) aaCGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGt > 2:1069891/1‑150 (MQ=255) aaCGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTGACACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGt > 1:679809/1‑150 (MQ=255) ggTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCgtggcgtggc > 1:1732553/1‑150 (MQ=255) ggggTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTg < 2:1292698/150‑1 (MQ=255) ggtggtggtAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGgc < 2:1330192/150‑1 (MQ=255) ggtggtAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCt < 1:217931/150‑1 (MQ=255) ggtAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTAGCTGGAGCCAGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGa > 1:706891/1‑150 (MQ=255) 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ccGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTAt > 1:112650/1‑150 (MQ=255) cAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATccc > 2:609844/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGtt > 1:1899401/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTc < 1:1069891/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTc > 2:775045/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGc > 1:294761/1‑88 (MQ=255) ggCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGc < 2:294761/88‑1 (MQ=255) cAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccgcc > 2:800705/1‑150 (MQ=255) gcgcCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACcgccgc > 2:707673/1‑150 (MQ=255) cTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 1:488443/127‑1 (MQ=255) cTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa > 2:488443/1‑127 (MQ=255) gA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGcc > 2:766295/1‑150 (MQ=255) | TGGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCC > NC_002947/3552293‑3552590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |