Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,571,720:1 | +G | 8.5% | coding (706/867 nt) | yneJ → | LysR family DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,571,720 | 1 | . | G | 8.5% | 269.9 / 19.0 | 71 | coding (706/867 nt) | yneJ | LysR family DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (33/32); new base G (3/3); total (36/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
CGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAA > NC_002947/3571572‑3571866 | cGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCcgc‑g > 1:1762454/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCgc‑gc > 1:898248/1‑150 (MQ=255) ccTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTAGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑gca < 2:1065647/150‑1 (MQ=255) tCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑gcagca < 2:360666/150‑1 (MQ=255) gcgcCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTG‑CGCGGCAGCATgg < 2:224079/150‑2 (MQ=255) gcCAACTGTTCATACCGCCACCTCTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTc < 1:574362/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGAc > 2:1175649/1‑150 (MQ=255) aaCTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGAc > 1:1291263/1‑150 (MQ=255) aCTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACa > 2:237195/1‑150 (MQ=255) tGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCt > 1:1241851/1‑143 (MQ=255) tGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCt < 2:1241851/143‑1 (MQ=255) tACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGccc > 2:1733588/1‑150 (MQ=255) tACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGccc > 2:1899662/1‑150 (MQ=255) aCCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCg > 2:358156/1‑150 (MQ=255) gCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGt < 1:1175649/150‑1 (MQ=255) aTCTCTTCGAAAACTGGTTCGTCTAGGACCTGGCGGTACCGGGCAAAATTCGCGAAATGGGGTCGTACCACGGCCTGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTTCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTTGACAATATGCCCGGGTgcc < 2:893379/150‑2 (MQ=255) ttCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGTCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTgcagagat > 1:893379/1‑146 (MQ=255) ttCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTG‑CGCGGCAGCATg < 2:901524/123‑1 (MQ=255) ttCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTG‑CGCGGCAGCATg > 1:901524/1‑123 (MQ=255) gAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTc > 2:333366/1‑150 (MQ=255) aaaCTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAg < 1:195891/150‑1 (MQ=255) cTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAgcgc < 1:358156/150‑1 (MQ=255) cTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAgcgc > 2:58230/1‑150 (MQ=255) tGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGcc > 2:1633349/1‑150 (MQ=255) ttCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTgg < 1:58230/150‑1 (MQ=255) tGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATg > 1:213888/1‑107 (MQ=255) tGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATg < 2:213888/107‑1 (MQ=255) gACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGGAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCg < 2:1087402/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga < 1:237195/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCggag > 2:1330983/1‑150 (MQ=255) ggCGGTACCAGGCAAGATTCACGAAAGGGGGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGCCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTCCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCggagga < 2:186652/150‑1 (MQ=255) gCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGAc > 2:798666/1‑150 (MQ=255) gCGGTACCGGGCAAAATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGGCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGAc > 2:71126/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCg > 1:835403/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGc > 2:1294131/1‑150 (MQ=255) ccGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTgca > 1:213270/1‑112 (MQ=255) ccGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTgca < 2:213270/112‑1 (MQ=255) ccGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACAGCGCTTTGTCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGc < 1:98122/150‑1 (MQ=255) gggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGATGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTa > 2:838188/1‑150 (MQ=255) ggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCTGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCg < 1:1067248/135‑1 (MQ=255) ggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCg > 2:1067248/1‑135 (MQ=255) cAAGATTCCCTAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCt < 1:1516807/150‑1 (MQ=255) cAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCt < 1:1516766/150‑1 (MQ=255) aCGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACct < 2:1560729/150‑1 (MQ=255) cGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGTCCATGCTGCCGC‑GCTGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACctg > 1:1382114/1‑150 (MQ=255) gAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACctgg < 1:1294131/150‑1 (MQ=255) gAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACctgg < 1:1633349/150‑1 (MQ=255) aaTGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCGTGCTCGACAATATGCCCGGGGGCGGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTGGCCTATCTGA‑AAACctggct > 1:1038741/1‑150 (MQ=255) gAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTa < 2:835403/150‑1 (MQ=255) aGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTAt < 1:1109158/150‑1 (MQ=255) gTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGcg > 1:1840372/1‑150 (MQ=255) aCCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGcgac > 1:1838736/1‑150 (MQ=255) ccACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCAGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGTTCAGGcgaca < 2:470941/150‑2 (MQ=255) ggCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATTTGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGt > 2:417905/1‑150 (MQ=255) aTGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACg < 1:1733588/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGtctc < 1:1330983/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTcg > 2:75461/1‑150 (MQ=255) cTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGACAAACCT‑GCTTATATGGCGACGAGGTACGGTCTcgcg < 1:1483240/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGa > 2:125165/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCGAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGt > 2:1000376/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGaa < 2:1838736/150‑1 (MQ=255) tcgagcATGCTGCGCG‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTAGTATGGCGACGAGGTACGGTCTAGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAg > 2:806550/6‑150 (MQ=255) cTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGCCTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTAGGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGGGAAg > 2:245561/1‑150 (MQ=255) tGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTg < 2:409531/134‑1 (MQ=255) tGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTg > 1:409531/1‑134 (MQ=255) gagcATGCTG‑CGCGGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga < 1:1521920/69‑1 (MQ=37) gagcATGCTG‑CGCGGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga > 2:1521920/4‑72 (MQ=37) gagcATGCTG‑CGCGGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGGGGAGTTTAAACAGCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGAACGGAATCGCGCAGGTTGAGCATGTTCGTGAAGtt > 1:512339/4‑150 (MQ=255) gCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTg > 1:1896882/1‑150 (MQ=255) cATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCt < 1:71126/150‑1 (MQ=255) cATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCCACACTATGCCCGGTTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCATTGTCGAATACCACCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCt < 1:798666/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCtt < 1:125165/150‑1 (MQ=255) tgcCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACctggc > 1:149071/1‑90 (MQ=255) tgcCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACctggc < 2:149071/90‑1 (MQ=255) ccGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTgaagaa < 1:758385/150‑1 (MQ=255) | CGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGA‑AAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAA > NC_002947/3571572‑3571866 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |