New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5594170 | 24 (0.320) | 4 (0.070) | 3/198 | NT | 13.9% | intergenic (‑66/+79) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
? | NC_002947 | = 5594207 | 31 (0.530) | intergenic (‑103/+42) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
ATCAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5593995‑5594170 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accctgtgggagcgggcttgcccgcgaaGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTCCCGACCATCCAATCCCC < NC_002947/5594207‑5594063 ATCAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCAC > 2:335207/1‑150 AGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCT > 1:1065122/1‑150 GCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGT < 1:1556976/150‑1 CCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGTTTATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTG < 1:1179827/150‑1 CGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGG > 2:332537/1‑150 CGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGG < 2:294920/150‑1 CGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGG < 1:1391775/150‑1 CGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGG < 1:385833/150‑1 GAGGGAAAACCACAGTGATAACATGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGTTAGTTGTGTTAGAATTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGG < 1:1059191/150‑1 GAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGG > 2:570971/1‑150 GGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTT > 1:1122765/1‑150 CCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGC < 1:1735384/150‑1 CACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCG > 2:1181983/1‑150 CACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCG > 1:1691870/1‑150 CAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAA < 1:570971/150‑1 GCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGG > 1:1436528/1‑105 GCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGG < 2:1436528/105‑1 GGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 2:1691870/150‑1 GAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCGGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGG < 2:1353411/150‑1 CGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG > 1:308766/1‑101 CGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 2:308766/101‑1 CCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTT < 1:486471/150‑1 CTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCT < 1:176196/150‑1 TGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTC < 1:1741887/150‑1 TGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTC < 1:787737/150‑1 GGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTCC > 1:332537/1‑150 gGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTCTCGCGGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTCCCGA < 1:1367181/149‑1 AGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGC > 2:1782541/1‑111 AGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGC < 1:1782541/111‑1 GCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTCGCCACCATC > 2:335800/1‑150 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTCCCGACCATCCAATCC > 1:853918/1‑150 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTC > 1:451284/1‑135 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTC < 2:451284/135‑1 CGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCCGTTCTCTCCCGACCATCCAATCCa > 1:967369/1‑149 CGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCAC < 2:208485/119‑1 CGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCAC > 1:208485/1‑119 GCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTCCCGACCATCCAATCCCC < 2:270076/150‑1 ATCAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5593995‑5594170 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accctgtgggagcgggcttgcccgcgaaGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGGTGTATGCCACTTAACATCACTCCTGCGGACATGACCATGACATCACCCAGCCAGTTCTCTCCCGACCATCCAATCCCC < NC_002947/5594207‑5594063 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |