| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 337811 | 14 (0.190) | 13 (0.220) | 12/198 | NT | 53.2% | intergenic (‑58/+71) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 337839 | 12 (0.210) | intergenic (‑86/+43) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease | |||||
GTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACC > NC_002947/337666‑337960 | gTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCCGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtag > 2:329154‑M1/1‑146 (MQ=255) tCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAgcgc < 1:419419/150‑1 (MQ=255) cacaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCca < 2:1694112/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTc > 2:1769486/1‑150 (MQ=255) ctgGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAg < 1:1206982/150‑1 (MQ=255) acctggtgatctcgttcatgctggtgcaaggcttcaagctgctggagcgctggttgcgcgtggatgcctgccaaggccgctgagacctcactgactgCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGgcgc > 1:1911131‑M1/98‑150 (MQ=255) gATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAg > 2:119306/1‑141 (MQ=255) gATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAg < 1:119306/141‑1 (MQ=255) gATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCt > 2:805684/1‑150 (MQ=255) tggtgatctcgttcatgctggtgcaaggcttcaagctgctggagcgctggttgcgcgtggatgcctgccaaggccgctgagacctcactgactgCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTac > 2:1917866‑M1/95‑150 (MQ=255) tggtgatctcgttcatgctggtgcaaggcttcaagctgctggagcgctggttgcgcgtggatgcctgccaaggccgctgagacctcactgactgCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTac > 2:760974‑M1/95‑150 (MQ=255) tCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCCAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGTctagcgccccccttgaatgtggcgctct > 1:501345‑M1/1‑122 (MQ=255) tCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTac < 2:1746191/150‑1 (MQ=255) cAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACa > 1:1769486‑M2/1‑149 (MQ=255) cAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACa > 2:422154‑M2/1‑149 (MQ=255) gtgatcttgttcatgttggtgaaacgtttcaagctgcttgagcgctggttgcgcgtggatgcctgccaaggccgctgagacctcactgactgCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTacac > 2:1852716‑M1/93‑150 (MQ=255) gtgatctcgttcatgctggtgcaaggcttcaagctgctggagcgctggttgcgcgtggatgcctgccaaggccgctgagacctcactgactgCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTacac > 1:255428‑M1/93‑150 (MQ=255) aGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGgcgc > 2:530291/1‑145 (MQ=255) aGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGgcgc < 1:530291/145‑1 (MQ=255) gatctcgttcatgctggtgcaaggcttcaagctgctggagcgctggttgcgcgtggatgcctgccaaggccgctgagacctcactgactgCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCt > 2:798020‑M1/91‑150 (MQ=255) aCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgt > 1:1057667‑M2/1‑144 (MQ=255) gtgGTCGAGGGCCGGGAAGGGGGGGCTTAGGTGGGGGCTGGGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCGCACAGGTgtagggccaacctggaatgtggcgctatacctgtg < 2:501345‑M1/149‑36 (MQ=255) cTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtg > 2:53075‑M2/1‑143 (MQ=255) cTGGTCGAGGGCCCGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGTGGCTGTTTATGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGCCGTTTTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtg < 1:329154‑M1/150‑36 (MQ=255) gTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtggga > 1:1208361‑M2/1‑140 (MQ=255) cGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACTCCCGCTACCAACGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagc > 1:805684‑M2/1‑138 (MQ=255) aGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgg > 1:1855747‑M2/1‑136 (MQ=255) aGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTAAacctgtgggcgcgg > 2:1763022‑M2/1‑136 (MQ=255) ggCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGTATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggc > 1:253845‑M2/1‑134 (MQ=255) gAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgccc > 1:1818222‑M2/1‑128 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt > 1:1760404‑M1/1‑89 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt < 2:1760404‑M1/123‑35 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgg < 2:127110‑M2/125‑9 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgg > 1:127110‑M2/1‑117 (MQ=255) gTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatac > 1:1481080‑M1/1‑85 (MQ=255) gTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatac < 2:1481080‑M1/115‑31 (MQ=255) gAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTatagcgccaaccttgaatgtggcgcta > 1:285004‑M1/1‑73 (MQ=255) gAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTatagcgccaaccttgaatgtggcgcta < 2:285004‑M1/100‑28 (MQ=255) gggCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACac > 2:687367‑M2/1‑92 (MQ=255) gggCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACac < 1:687367‑M2/94‑3 (MQ=255) ggCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTa > 2:994754/1‑85 (MQ=255) ggCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTa < 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(MQ=255) tggtggTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctat > 1:380131‑M1/1‑46 (MQ=255) tggtggTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctat < 2:380131‑M1/74‑29 (MQ=255) tcactgactgCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTacac < 2:1066769‑M1/58‑1 (MQ=255) tcactgactgCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTacac > 1:1066769‑M1/11‑68 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGgc > 2:1098488/1‑55 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGgc < 1:1098488/55‑1 (MQ=255) gGGGCACGCCCGCTCGCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTg > 1:192815‑M1/2‑150 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttc > 1:1818222‑M1/1‑22 (MQ=255) ACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCa < 2:1067795‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatacttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggcc > 1:253845‑M1/1‑16 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccct > 1:1855747‑M1/1‑14 (MQ=255) ccGCGCCCACAGGTttagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccct > 2:1763022‑M1/1‑14 (MQ=255) gCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctataccgttggtagcgggagtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcg > 1:805684‑M1/1‑12 (MQ=255) tCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgac > 1:1208361‑M1/1‑10 (MQ=255) TCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAAc < 2:1226273‑M1/150‑1 (MQ=255) ccACAGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaa > 1:127110‑M1/1‑8 (MQ=255) ccACAGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaa < 2:127110‑M1/125‑118 (MQ=255) CCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGT‑GGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCa > 1:807741‑M1/1‑140 (MQ=255) CCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGT‑GGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCa < 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acaGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagt > 1:1057667‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaa > 1:1760404‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaa < 2:1760404‑M2/123‑90 (MQ=255) ACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga < 1:829652‑M1/150‑1 (MQ=255) GGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTTGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTATCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACTCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCa < 2:1654368‑M1/150‑1 (MQ=255) gtgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgccc > 2:687367‑M1/1‑2 (MQ=255) gtgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgccc < 1:687367‑M1/94‑93 (MQ=255) gTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccac > 1:1481080‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccac < 2:1481080‑M2/115‑86 (MQ=255) gTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttg > 1:1195692‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttg < 2:1195692‑M2/86‑57 (MQ=255) tgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcctg > 2:422154‑M1/1‑1 (MQ=255) tgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcctg > 1:1769486‑M1/1‑1 (MQ=255) TATAGCGCCA‑CCTTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTCAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCCGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATGAcc < 2:721155‑M1/150‑1 (MQ=255) | GTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCA‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACC > NC_002947/337666‑337960 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |