New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1451862 = | 61 (0.820) | 4 (0.060) | 3/246 | NT | 5.4% | coding (17/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
? | NC_002947 | 1451918 = | 82 (1.140) | coding (73/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
CCGCATCGATCCGTGATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAACCAAGATTTCCCTGG > NC_002947/1451714‑1452008 | ccGCATCGATCCGTGATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGgcg > 1:1459342/1‑150 (MQ=255) gCATCGATCCGTGATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGcc > 2:1338896/1‑150 (MQ=255) cGATCCGTGATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCctct < 1:1281596/150‑1 (MQ=255) aTCCGTGATTCAGGCATTGATTGCGTCTGACGCAATACAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCTCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTgc < 2:326169/150‑1 (MQ=255) aTCCGTGATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTgc > 1:1371760/1‑150 (MQ=255) tCCGTGATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTgcg > 1:1912060/1‑150 (MQ=255) gATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCt < 1:130146/150‑1 (MQ=255) gATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCt < 1:1073769/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGTCCAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTg > 1:1391167/1‑150 (MQ=255) ggATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGAAAAGTTAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCACCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCTCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCAGCAGCAc > 2:1704843/1‑150 (MQ=255) cGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCcgc > 2:337199/1‑150 (MQ=255) gCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCcgcg > 1:1126435/1‑150 (MQ=255) aaTATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCgcc < 1:1267568/141‑1 (MQ=255) aaTATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCgcc > 2:1267568/1‑141 (MQ=255) aaTATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGcc > 2:1732559/1‑150 (MQ=255) tttggccagggaagtcttggttaccgactcgttgaggccggcgcacagcacagccagcaacacaccgaacagcgcgaccaccacctgcaggccaaaCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGAGCCTGCGCAGACgg > 2:318941‑M1/97‑150 (MQ=255) atcggccagggaaatcttggttaccgactcgttgaggccggcgcacagcacagccagcaacacaccgaacagcccgaccaccacctgcaggccaaaCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACgg > 1:607126‑M1/97‑150 (MQ=255) gACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGt < 2:1282770/150‑1 (MQ=255) aCAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCACTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGtt > 2:623403/1‑150 (MQ=255) gTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGc < 1:409840/150‑1 (MQ=255) tCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTAATTAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGcc > 1:990383/1‑150 (MQ=255) tCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCCTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGcc > 2:950906/1‑150 (MQ=255) aGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTg > 2:767034/1‑150 (MQ=255) ttttCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCa > 2:52686/1‑150 (MQ=255) gTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTCGCCTGCAggtgg < 2:1459342/150‑1 (MQ=255) aGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAggtggtgg < 1:52686/150‑1 (MQ=255) aTTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCg > 1:1258668/1‑150 (MQ=255) cGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGCCTCCCCTGACGGCGCGTTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACTCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCgggg > 2:833310/1‑149 (MQ=255) aCCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAggtggtg > 2:806088/1‑141 (MQ=255) aCCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAggtggtg < 1:806088/141‑1 (MQ=255) ccTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGt > 1:823431/1‑150 (MQ=255) cttcttAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGtt > 1:672669/1‑150 (MQ=255) ttcttAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTc < 2:672669/150‑1 (MQ=255) ttAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGgt > 1:445288/1‑150 (MQ=255) ttGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTg > 2:1030574/1‑150 (MQ=255) ccTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGgctgtgc < 1:1251907/150‑1 (MQ=255) gAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGgctgtgctgt < 1:422210/150‑1 (MQ=255) gAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGgctgtgctgt > 2:1744120/1‑150 (MQ=255) gttgCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCg < 1:1732559/150‑1 (MQ=255) acaccgaacagcccgaccaccacctgcaggccaaaCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGa > 1:789910‑M1/36‑86 (MQ=255) acaccgaacagcccgaccaccacctgcaggccaaaCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGa < 2:789910‑M1/51‑1 (MQ=255) tgCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGc < 2:823431/150‑1 (MQ=255) cTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCt < 2:261182/150‑1 (MQ=255) cTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCt > 1:278605/1‑150 (MQ=255) gagaTGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCaa < 1:337199/150‑1 (MQ=255) gagaTGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCaa < 1:1338896/150‑1 (MQ=255) gTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGt > 1:1757468/1‑150 (MQ=255) tATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTc > 2:172629/1‑150 (MQ=255) tcATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTgctggct > 1:1802956/1‑119 (MQ=255) tcATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTgctggct < 2:1802956/119‑1 (MQ=255) tcATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTaa > 2:171771/1‑150 (MQ=255) tcATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTaa > 1:1234770/1‑150 (MQ=255) cATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAAc > 1:317837/1‑150 (MQ=255) aTGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAAcc > 2:38528/1‑150 (MQ=255) aTGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAAcc > 2:768193/1‑150 (MQ=255) gACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCg < 1:473338/101‑1 (MQ=255) gACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCg > 2:473338/1‑101 (MQ=255) aCTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGgctgtg < 2:1393391/117‑1 (MQ=255) aCTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGgctgtg > 1:1393391/1‑117 (MQ=255) aCTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAACCAAg < 1:866837/150‑1 (MQ=255) aCTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCAGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGgctgtg < 2:441278/117‑1 (MQ=255) aCTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCAGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGgctgtg > 1:441278/1‑117 (MQ=255) cTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAACCAAGATTTcc < 1:950906/150‑1 (MQ=255) cTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAACCAAGATTTcc > 1:220128/1‑150 (MQ=255) tGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCgcgc > 2:1035288/1‑39 (MQ=255) tGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCgcgc < 1:1035288/39‑1 (MQ=255) tGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTTACCAATATTTccc < 2:1912060/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAACCAAGATTTCCCTgg > 1:1407904/1‑150 (MQ=255) ggCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTgctgg > 2:269740/1‑101 (MQ=255) ggCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTgctgg < 1:269740/101‑1 (MQ=255) gcgcCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTgctgg < 2:1040041/100‑1 (MQ=255) gcgcCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTgctgg > 1:1040041/1‑100 (MQ=255) gcgcCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGc < 2:243212/117‑1 (MQ=255) gcgcCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGc > 1:243212/1‑117 (MQ=255) | CCGCATCGATCCGTGATTCAGGCATGGATTGCGTCTGACGCAATATAAAACTACCGACAAGTCAGTTTTCGTCAGCATTCGACCTTCTTAAACTTGCCCCAGCCCTGAAATTGTTGCTGGAGATGTATTCTCATGACTTCCCTGACGGCGCCCTCTGCGGCGCTGGCCGCCGCACCCGCGCCGGCCGCGCCTGCGCAGACGGCGTTTGGCCTGCAGGTGGTGGTCGGGCTGTTCGGTGTGTTGCTGGCTGTGCTGTGCGCCGGCCTCAACGAGTCGGTAACCAAGATTTCCCTGG > NC_002947/1451714‑1452008 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |