New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1553726 = | 60 (0.800) | 4 (0.060) | 4/244 | NT | 6.3% | coding (287/474 nt) | PP_1364 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1553748 = | 61 (0.850) | coding (309/474 nt) | PP_1364 | hypothetical protein |
CGTCATCAACTACCTTGTGTCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCGAGTACGATGATTTCGTACGTTCGTTGCGCG > NC_002947/1553578‑1553875 | cggggcggaaactgaaatagtcgcgcaacgaacgtacgaaatcatcgtactcgcgcggagactgcagcaacataaagcccgaatcgtagtgcccaggcgtctggtcctcgcggcaccacaggcaactggccgtgaggttgacgaactggt > 1:1565438‑M1/150‑150 (MQ=255) gggcggaaactgaaatagtcgcgcaacgaacgtacgaaatcatcgtactcgcgcggagactgcagcagcataaagcccgaatcgtagtgcccaggcgtctggtcctcgcggcaccacaggcaactggccgtgaggttgacgaactggTGc > 1:766553‑M1/148‑150 (MQ=255) gggcggaaactgaaatagtcgcgcaacgaacgtacgaaatcatcgtactcgcgcggagactgcagcagcataaagcccgaatcgtagtgcccaggcgtctggtcctcgcggcaccacaggcaactggccgtgaggttgacgaactggTGc > 1:767128‑M1/148‑150 (MQ=255) ggcggaaactgaaatagtcgcgcaacgaacgtacgaaatcatcgtactcgcgcggagactgcagcagcataaagcccgaatcgtagtgcccaggcgtctggtcctcgcggcaccacaggcaactggccgtgaggttgacgaactggTGcc < 2:127566‑M1/4‑1 (MQ=255) catcaACTACCTTGTGTCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGccc < 1:685013/150‑1 (MQ=255) tcaACTACCTTGTGTCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCc‑ct < 1:1361130/150‑1 (MQ=255) ggaaactgaaatagtcgcgcaacgaacgtacgaaatcatcgtactcgcgcggagactgcagcagcataaagcccgaatcgtagtgcacaggcgtctcggcatagcggcaccacaggcaactggccgtgagggtgacgaactggtgcacgc < 2:1754548‑M1/7‑5 (MQ=255) cTACCTTGTGTCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCc‑ctgcct > 1:998044/1‑150 (MQ=255) aCCTTGTGTCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTgg < 2:1427439/150‑1 (MQ=255) cTTGTGTCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTggcg > 2:1095540/1‑150 (MQ=255) gtCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTggcggc > 2:1298699/1‑147 (MQ=255) gtCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTggcggc < 1:1298699/147‑1 (MQ=255) tCCNCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGc > 2:1191288/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCAc > 1:870345/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCAcc > 1:1754480/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGA‑TACGTAGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCAcc > 1:1754548/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGGCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCa < 2:118284/150‑1 (MQ=255) gtgtTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGcc > 2:1122272/1‑125 (MQ=255) gtgtTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGcc < 1:1122272/125‑1 (MQ=255) gtgtTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTAGCGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTc < 2:168192/150‑1 (MQ=255) gtTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGt < 1:1024207/150‑1 (MQ=255) aagcGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATGAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAAc > 2:1765308/4‑150 (MQ=255) aaCCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAAc < 1:4230/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAAc > 2:1369344/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTTACCGGTAAAGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAAcc > 2:78811/1‑150 (MQ=255) ttACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACgg < 2:38070/150‑1 (MQ=255) cAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGc > 1:620286/1‑150 (MQ=255) cAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGc < 2:870345/150‑1 (MQ=255) gagaTCGGCCAGCTAGGCAATGCGTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGTCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCtg > 2:952989/1‑150 (MQ=255) agaTCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCtgt < 2:1725701/150‑1 (MQ=255) gaTCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGTGGGCACCAGTTCGTc > 1:440798/1‑127 (MQ=255) gaTCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGTGGGCACCAGTTCGTc < 2:440798/127‑1 (MQ=255) gaTCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCtgtg < 2:420720/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTgtgg > 2:1862622/1‑150 (MQ=255) aGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGTTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCcgcg > 1:127566/1‑150 (MQ=255) aGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATGAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGa < 1:1765308/150‑1 (MQ=255) ggCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGAc < 1:1369344/150‑1 (MQ=255) aaTGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAg > 1:143777/1‑150 (MQ=255) ccTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGc < 2:786609/150‑1 (MQ=255) tctGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGa < 1:1546806/145‑1 (MQ=255) tctGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGa > 2:1546806/1‑145 (MQ=255) tctGAAAATGGGTTGATGGTCATAAGCCAGCTGCCCGTGTTGGACAGGCAAGATGACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCt > 1:1572975/1‑150 (MQ=255) ctGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTg < 1:645211/150‑1 (MQ=255) gAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTggg < 1:78811/150‑1 (MQ=255) tGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTa < 2:96029/150‑1 (MQ=255) tGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGCTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTa < 2:985432/150‑1 (MQ=255) gTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCACGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGa > 2:951323/1‑150 (MQ=255) aTGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCg > 1:1193979/1‑150 (MQ=255) ggTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCggg > 1:146583/1‑150 (MQ=255) tcatcaGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCt > 2:1820925/1‑150 (MQ=255) catcaGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCtt < 2:143777/150‑1 (MQ=255) atcaGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCttt > 2:720874/1‑150 (MQ=255) atcaGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCttt > 1:242251/1‑150 (MQ=255) tcaGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCAc > 2:1070036/1‑74 (MQ=255) tcaGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCAc < 1:1070036/74‑1 (MQ=255) tcaGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTa > 1:1000746/1‑150 (MQ=255) tctagcGGCCCGTGGTGGTCCGGCCCGATTACG‑TGGCGCAAATTGGGAAGGCC‑CTGCCTGGCCGGCGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTAtgc < 1:907531/147‑1 (MQ=255) ccagcTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTAtgct > 2:1477489/1‑150 (MQ=255) gcTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTAtgctgct > 1:360380/1‑150 (MQ=255) gcTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTAtgctgct < 1:1191288/150‑1 (MQ=255) gcTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGACCCAGTCGGCCAACCCCACGGCCAGTGGCCTGGGTGGCCGCGGGGACCAGCCCCCTGGCCCCTACGTTTGGGGCTTTAtcctaga > 2:907531/1‑147 (MQ=255) tcgcggcaccacaggcaactggccgtgaggttgacgaactggTGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCAc > 2:1845657‑M1/43‑65 (MQ=255) tcgcggcaccacaggcaactggccgtgaggttgacgaactggTGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCAc < 1:1845657‑M1/23‑1 (MQ=255) gCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAAGTGCGTATGCCC‑CTGCCTAGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACTGGCAGGTGCCTGTGGTGTCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCa < 2:214570/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCCCTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCcgcgc < 1:1095540/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCcgcgc < 2:242251/150‑1 (MQ=255) gCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCGAGTa < 2:1000746/150‑1 (MQ=255) gCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCGAGTACGATGATTTCGt < 1:1820925/150‑1 (MQ=255) aaCTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCGAGTACGATGATTTCGTAcgtt > 2:1538793/1‑150 (MQ=255) cgaactggTGCCCGCCGCCAGGCAG‑GGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGc < 1:849274‑M1/75‑1 (MQ=255) cgaactggTGCCCGCCGCCAGGCAG‑GGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGc > 2:849274‑M1/9‑83 (MQ=255) tGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGATCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCGAGTACGATGATTTCGTAcgttcgt > 2:1070982/1‑150 (MQ=255) gCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCGAGTACGATGATTTCGTAcgttcgtt < 2:638096/150‑1 (MQ=255) gCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCGAGTACGATGATTTCGTAcgttcgtt < 1:720874/150‑1 (MQ=255) aTGCCC‑CTGCCTGGCGTCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCTAGTACGATGATTTCGTACGTTCGTTgcgc < 1:952989/150‑1 (MQ=255) aTGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACg < 1:1924505/42‑1 (MQ=255) aTGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACg > 2:1924505/1‑42 (MQ=255) TGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCCTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCCCGAGTACGATGATTTCGTACGTTCGTTGcgcg < 2:842473‑M1/150‑1 (MQ=255) | CGTCATCAACTACCTTGTGTCCTCAAGGTGTTCAACCGCTTTACCGGTCAGGAGATCGGCCAGCTAGGCAATGCCTCTGAAAATGGGTTGATGGTCATCAGCCAGCTGCCCGTGTTGGTCGGGCCTGATTACG‑AGCTGCAACTGCGTATGCCC‑CTGCCTGGCGGCGGGCACCAGTTCGTCAACCTCACGGCCAGTTGCCTGTGGTGCCGCGAGGACCAGACGCCTGGGCACTACGATTCGGGCTTTATGCTGCTGCAGTCTCCGCGCGAGTACGATGATTTCGTACGTTCGTTGCGCG > NC_002947/1553578‑1553875 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |