New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2508934 | 68 (0.910) | 8 (0.110) | 6/248 | NT | 10.6% | coding (224/429 nt) | PP_2203 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2508963 | 68 (0.930) | coding (195/429 nt) | PP_2203 | hypothetical protein |
GGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGA > NC_002947/2508786‑2509081 | ggCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGgt < 2:1082606/150‑1 (MQ=255) gCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGgtg > 1:585901/1‑150 (MQ=255) cATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGgtgt < 2:585901/150‑1 (MQ=255) aTCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGtgtg > 1:602946/1‑150 (MQ=255) ttGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCTCACCGGGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCac < 1:1058080/150‑1 (MQ=255) ttGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCac < 1:265655/150‑1 (MQ=255) gtgGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCacga < 1:1073557/150‑1 (MQ=255) cACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTAGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCaa < 2:1071099/150‑1 (MQ=255) aCCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAg > 2:337168/1‑150 (MQ=255) aCCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAg > 1:1094147/1‑150 (MQ=255) ccATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGGCATTACGCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGc > 1:1059554/1‑150 (MQ=255) tcCATGCCGGGCGAGCCGATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGgc < 2:1284911/150‑1 (MQ=255) cATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGgcgc < 1:259881/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCCCCCCGGtgtg < 2:27123/128‑1 (MQ=255) aTGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGtgtg > 1:27123/1‑128 (MQ=255) cGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGcgtggcgccacgccttgcgtcgtgcc > 2:970754‑M1/1‑120 (MQ=255) cGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGcgtggcgccacgccttgcgtcgtgcc < 1:970754‑M1/146‑27 (MQ=255) ggcatgcccatGGGCTCGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGccg < 1:1786581‑M2/145‑4 (MQ=255) ggCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCTCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGtgtgccacgccttgcgtcgtgccacaccgggg < 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ggccgagcagGTGCGCCTGCTGGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGtt > 2:1290523/6‑105 (MQ=255) gccgagcagGTGCGCCTGCT‑GGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTgg > 2:1505635/5‑125 (MQ=255) gccgagcagGTGCGCCTGCT‑GGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTgg < 1:1505635/121‑1 (MQ=255) gccgagcagGTGCGCCTGCT‑GGCCGGCACGGGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGGACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTaaaa > 1:816182/5‑150 (MQ=255) gCCAGCGGGCCCACCTGCTCGGCCGGGACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTaaaa < 2:303282/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGTCTTCGACGAACTTCCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTaaaa < 1:1366150/150‑1 (MQ=255) 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ccccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGC‑‑‑ACAccggggtgatcggcggcaagttcgtcgaaggccacgtgccggccgagcaggtgcgcctgctggccaaacgcaacgacctcaagggcctggaggtgccgggcatgcccatgggctcgcc < 2:1010208‑M2/150‑119 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGccggggtgatcggcggcaagttcgtcgaaggccacgtgccggccgagcaggtgcgcctgctg < 2:491917‑M2/96‑63 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGccggggtgatcggcggcaagttcgtcgaaggccacgtgccggccgagcaggtgcgcctgctg > 1:491917‑M2/1‑34 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGccggggtgatcggcggcaagttcgtcgaaggccacgtgccggccgag > 1:1034233‑M2/1‑34 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGccggggtgatcggcggcaagttcgtcgaaggccacgtgccggccgag < 2:1034233‑M2/81‑48 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATc > 1:104349/1‑115 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATc < 2:104349/115‑1 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCGGCCGCAGTTGGGGCCGCGGTa > 2:957426/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCCAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCTGCCGCAGTCGGGGTCGCGGTa > 2:957292/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAg < 2:1106075/150‑1 (MQ=255) cGGcgtggcgccacgccttgcgtcgtgccacaccggggtgatcggcggcaagttcgtcgaaggccacgtgccggccgagcaggtgcgcctgctggccaaacgcaacgacctcaagggcctggcggtgccgggcgagcccatgggcatgcc < 1:1786581‑M1/150‑148 (MQ=255) | GGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGA > NC_002947/2508786‑2509081 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |