| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2832716 = | 69 (0.930) | 7 (0.100) | 6/240 | NT | 9.9% | intergenic (‑21/+46) | PP_2485/PP_2486 | hypothetical protein/Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 2832764 = | 62 (0.880) | coding (1123/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase | |||||
AGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCG > NC_002947/2832568‑2832864 | aGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCaa > 1:250634/1‑150 (MQ=255) tcttGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGACGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCaaa < 1:1069118/147‑1 (MQ=255) acctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcctgctcatatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaa > 1:592488‑M1/148‑150 (MQ=255) cctgaccgcttggggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAAc > 1:1569085‑M1/147‑150 (MQ=255) cATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAAc < 2:1806505/150‑1 (MQ=255) gCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGCAAAGAACAGCCCAAGCCTTAGATGCCCCTGCCGGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGACCGTGCTCGGTGGGTACATGCTTAACTTCCCCGGTCAGCAAAcaga > 2:1069118/1‑147 (MQ=255) tCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCATAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGa > 1:1835797/1‑150 (MQ=255) cGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑g < 1:1923583/150‑1 (MQ=255) gtgtATCACCTTTGAAATCCTCTAGGGGAAAGAACAGCACATAGTTTATATGGAGAAGTAATACGTTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑Gcc > 2:1005462/1‑150 (MQ=255) cACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGccc > 2:1307484/1‑150 (MQ=255) cACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGccc > 2:1306730/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGcccc > 2:1365006/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGcccc > 2:1579126/1‑150 (MQ=255) ccTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCt > 2:1505108/1‑150 (MQ=255) ttCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGa < 2:1835797/150‑1 (MQ=255) aGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATg < 1:1579126/150‑1 (MQ=255) gaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGt > 1:445718‑M1/117‑150 (MQ=255) aGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTg < 2:196450/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |