New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3793404 = | 82 (1.100) | 5 (0.070) | 5/242 | NT | 6.3% | coding (1162/1191 nt) | PP_3355 | beta‑ketothiolase |
? | NC_002947 | 3793444 = | 71 (1.000) | coding (1122/1191 nt) | PP_3355 | beta‑ketothiolase |
GAGGTCGACGTCGGCATATGCCGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGCGCCGCCATGGAC > NC_002947/3793256‑3793551 | gaggtcgaCGTCGGCATATGCCGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATcagc < 1:1640297/150‑1 (MQ=255) aggtcgaCGTCGGCATATGCCGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATcagca < 1:1650603/150‑1 (MQ=255) aggtcgaCGTCGGCATATGCCGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGGCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATcagca > 2:675246/1‑150 (MQ=255) gtcgaCGTCGGCATATGCCGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCagcagc < 1:711894/150‑1 (MQ=255) ggcccaggcgctcgaactcgatgtggacaagctcaatgtccatggcggcgctatcgcccttggtcacccattggccgctacaggtctgcgcctggtccacaccttggcccgtcaattgcgcgacggcaacttgcgctatggcatcGCAgc > 2:447459‑M1/146‑150 (MQ=255) cgttgacATATCCCGATAATTCCGCCCACGCCGGATCGACCCGCAGCCAGGGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGTAGGGGCGCCCTCCAGGTCCTCGGCTACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCACCGCCAt < 2:949463/144‑1 (MQ=255) ggCATATGCCGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCNGGGTNGCAGGACGAACTGCCTGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCCCCGGGTCAGGCCACGAAAGGAGGGTTTTCGATCATCAGCGCCATGctt > 1:311652/1‑148 (MQ=255) ccGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCAcc > 2:1496963/1‑150 (MQ=255) ccGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCAcc > 2:891208/1‑150 (MQ=255) aaTTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGa < 2:418931/150‑1 (MQ=255) aaTTGCGCCCAGGCCTGAGCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGGCGCGCAGGGTCGCCTTCCAGGTCATGGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCTATGCCTTGTCCACCGCCGa < 2:746190/150‑1 (MQ=255) aTTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGat > 2:757939/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGatg > 2:164842/1‑150 (MQ=255) 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gCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTCGCCGTCGCGCAATAGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGACAATGGGTGACCa > 2:1034972/1‑150 (MQ=255) cAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGAGTAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCaa < 1:1296742/150‑1 (MQ=255) aTGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCTACGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGAt < 1:19670/150‑1 (MQ=255) aTGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGAt < 2:1636491/150‑1 (MQ=255) aGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGt > 1:928902/1‑134 (MQ=255) aGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGt < 2:928902/134‑1 (MQ=255) gTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGcgcc < 1:1211901/150‑1 (MQ=255) ttttCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTcgcg < 2:897484/77‑1 (MQ=255) ttttCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTcgcg > 1:897484/1‑77 (MQ=255) ttttCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATgg < 1:1345668/128‑1 (MQ=255) ttttCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATgg > 2:1345668/1‑128 (MQ=255) tatggcatcGCAGCGGCATGCATCGGCGGTGGCCAAGGCATGGCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGcgccgc < 2:1405090‑M1/141‑1 (MQ=255) gATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGCGCCGCCATg < 1:130904/150‑1 (MQ=255) gATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGCGCCGCCATg < 2:1256588/150‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGCGCCGCCATgg < 1:443481/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGCGCCGCCATGGa > 1:1796244/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGCGCCGCCATGGa > 1:1067540/1‑150 (MQ=255) cagcagCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGCGCCGCCATGGAc < 2:112501/150‑1 (MQ=255) | GAGGTCGACGTCGGCATATGCCGGTAATTGCGCCCAGGCCTGATCGGCCCGCAGCCAGTGTTGCAGGACGAACTGCATGTCGCGCAGGGGCGCCTTCCAGGTCATCGGATACCTCCGGGTCAGGCAACGAAATGAGGGTTTTCGATCAGCAGCGCCATGCCTTGGCCACCGCCGATGCATGCCGCTGCGATGCCATAGCGCAAGTTGCCGTCGCGCAATTGACGGGCCAAGGTGTGGACCAGGCGCAGACCTGTAGCGGCCAATGGGTGACCAAGGGCGATAGCGCCGCCATGGAC > NC_002947/3793256‑3793551 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |