New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3857518 = | 74 (0.990) | 8 (0.110) | 7/248 | NT | 10.8% | coding (52/231 nt) | PP_3407 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3857549 = | 60 (0.820) | coding (83/231 nt) | PP_3407 | hypothetical protein |
CAGCGATCGGCTTCTACCAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCC > NC_002947/3857370‑3857665 | taccgttgcgggggcagcaccggcattgtccggccctgctgaagggcctgggacgcaccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgagtcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcGa > 1:1351417‑M1/149‑150 (MQ=255) gATCGGCTTCTACCAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCt > 1:1751410/1‑150 (MQ=255) gATCGGCTTCTACCAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGGTACTGCACTTCTACCTATTGGAAGAAGGCTGCGTGGCTGAGCCt > 2:576002/1‑150 (MQ=255) ttCTACCAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGc < 2:793112/141‑1 (MQ=255) ttCTACCAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGc > 1:793112/1‑141 (MQ=255) ccAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTAcc > 1:90328/1‑146 (MQ=255) ccAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTAcc < 2:90328/146‑1 (MQ=255) cAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACctgctg > 1:931289/1‑150 (MQ=255) aaaCTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCCGGCCTGAGCTTGTCGTACCTGCTGTT‑c < 1:913791/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑c < 2:1508689/150‑1 (MQ=255) aCTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGa < 1:777292/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGAc < 1:993350/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCCACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGAc < 1:1365257/150‑1 (MQ=255) tGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACa < 1:1703032/150‑1 (MQ=255) tGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCATGGGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACa < 1:1202718/150‑1 (MQ=255) gggCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGcc < 1:622327/150‑1 (MQ=255) gggCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGcc < 1:1670888/150‑1 (MQ=255) tccggccctgctgaagggcctgggacgcaccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGcc > 2:468408‑M1/121‑149 (MQ=255) 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cgcAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCt < 2:116118/150‑1 (MQ=255) cgcAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCGGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCt < 1:1314603/150‑1 (MQ=255) gcAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGc > 2:1857447/1‑115 (MQ=255) gcAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGc < 1:1857447/115‑1 (MQ=255) ctgaagggcctgggacgcaccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcGa > 1:175231‑M1/111‑112 (MQ=255) ctgaagggcctgggacgcaccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcGa < 2:175231‑M1/2‑1 (MQ=255) cAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGt < 2:652405/150‑1 (MQ=255) ggATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAGGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTAt > 1:1275624/1‑150 (MQ=255) gAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACa < 1:1430579/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGCAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCGGTATGACATTGAc > 2:1032020/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGAc > 1:44860/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) ggAAGAAGACTTCAGGGCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCa < 2:95046/150‑1 (MQ=255) ggAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCAAACCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCa > 1:1060707/1‑150 (MQ=255) gaagaaGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAg > 2:646765/1‑150 (MQ=255) aagaagACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAgg < 2:1449970/150‑1 (MQ=255) gaagaCTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGt > 2:64146/1‑138 (MQ=255) gaagaCTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGt < 1:64146/138‑1 (MQ=255) gaagaCTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGcc > 2:1101957/1‑150 (MQ=255) tacagcgtgcGAGGCTGTCGAACA‑GCAGGTACGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGt > 2:172632‑M1/11‑133 (MQ=255) tacagcgtgcGAGGCTGTCGAACA‑GCAGGTACGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGt < 1:172632‑M1/123‑1 (MQ=255) cTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGTTTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTCca < 1:1040276/150‑1 (MQ=255) ggCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAgg < 2:44860/150‑1 (MQ=255) cTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGcc > 1:900062/1‑150 (MQ=255) | CAGCGATCGGCTTCTACCAGAAACTGGGGGCCGAGGCGCAGGATGAGTGGGTGCGCTACCGGCTGGATGGCGACAAGCTGGCGGCATTCGCCCGCGGGTGATCGCCCGGTTTCTGCACTTCTGCCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTT‑CGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCC > NC_002947/3857370‑3857665 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |