New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4003395 | 100 (1.340) | 6 (0.090) | 5/240 | NT | 6.4% | intergenic (+9/+74) | PP_3531/PP_3532 | hypothetical protein/AsnC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4003419 | 82 (1.160) | intergenic (+33/+50) | PP_3531/PP_3532 | hypothetical protein/AsnC family transcriptional regulator |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CCGGGTGACCGAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCGTTCA > NC_002947/4003248‑4003542 | ccgggtgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAg < 1:1448877/150‑1 (MQ=255) ggtgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCt > 1:1328737/1‑150 (MQ=255) tgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTg < 2:1466034/149‑1 (MQ=255) gAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGAcc < 1:893258/150‑1 (MQ=255) gAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGAcc < 2:1181545/150‑1 (MQ=255) gACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTg < 2:734012/150‑1 (MQ=255) aCCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGATGCTTTCCCTGGGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCTAAACTTATTGAGCCGTCAT‑TCTGCAGACCGACTgc > 1:35190/1‑150 (MQ=255) ccTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTgca < 2:1525922/150‑1 (MQ=255) ccTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCCGGCCAACACGTTTTTGTTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGTGAGCTCTTTCGAAACTTCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTgca < 1:976220/150‑1 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTgcag > 2:1563125/1‑150 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTgcag > 1:918462/1‑150 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTgcag > 1:121711/1‑150 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCGGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTgcag > 1:1679410/1‑150 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGACTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACt > 1:169019/1‑146 (MQ=255) cTACCAGGTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTgcag > 2:1763422/1‑150 (MQ=255) tACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTgcagc < 1:1563125/150‑1 (MQ=255) ccAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGaggctgcagtcggtctgcagccg < 2:1644553‑M1/150‑24 (MQ=255) ccAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGcagcag > 2:1828078/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCCGCAGGgcc > 1:1113108‑M2/1‑147 (MQ=255) gCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTTACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccgg < 1:759740‑M1/150‑30 (MQ=255) gCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccgg < 1:1012464‑M2/150‑6 (MQ=255) cAGGCCG‑CCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggca < 1:1543381‑M1/150‑32 (MQ=255) aGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGcagcag < 1:707017/142‑1 (MQ=255) aGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGcagcag > 2:707017/1‑142 (MQ=255) aGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGcagcag < 1:707094/142‑1 (MQ=255) aGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGcagcag > 2:707094/1‑142 (MQ=255) gccgccCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGc > 1:1010738/1‑150 (MQ=255) gccCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCttt < 1:767480/150‑1 (MQ=255) cccTGCCGGTGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCttttt > 2:803307/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTtgt > 1:753448/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTtgtg < 1:1828078/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGc < 1:1920523/150‑1 (MQ=255) ccGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTCTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCCCTGCTGCAGTCGGTCTGCAGCCTGccggcacttcaaggttgg > 2:1336416‑M2/1‑132 (MQ=255) 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tGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGat > 1:783939/1‑146 (MQ=255) tGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGc > 2:1021101/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATATTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCgg < 1:804710/150‑1 (MQ=255) cgcccgccTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCCGGGGCGCCAGCTGTTTGTGCAATACACCTGGCAGAAGGCCTGGCTTTGCGGTCAATTCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGa < 2:390035/144‑1 (MQ=255) ccAACCTTGAAGTGCCGGaggctgcagaccgactgcagcagggccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccagaaaccggttggccagccaccctggcacatccccgg > 2:1336416‑M1/1‑19 (MQ=255) cAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAgg < 2:31296/105‑1 (MQ=255) cAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAgg > 1:31296/1‑105 (MQ=255) cAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTTGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCg > 2:255571/1‑150 (MQ=255) ccTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGc > 1:1922051/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCcgc < 2:827057/85‑1 (MQ=255) cTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCcgc > 1:827057/1‑85 (MQ=255) cTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCg > 2:1821289/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCgg > 1:483786/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCgg > 2:891402/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGAGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTATCGATATGCGGGATCGAGCgg > 1:353170/1‑150 (MQ=255) tGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGa < 1:894157/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGc > 1:289402/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcagggcggcctg < 1:1543381‑M2/150‑120 (MQ=255) tGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCg > 2:380416/1‑150 (MQ=255) ccGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcctgc < 1:1012464‑M1/150‑146 (MQ=255) ggCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagcctccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatc < 2:333798‑M2/93‑67 (MQ=255) ggCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagcctccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatc > 1:333798‑M2/1‑27 (MQ=255) ggCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGt > 1:1248331/1‑91 (MQ=255) | CCGGGTGACCGAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCAG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCGTTCA > NC_002947/4003248‑4003542 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |