| New junction evidence | |||||||||||
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AACTGCTGAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAGCCCGCACATCGA > NC_002947/4544169‑4544460 | aaCTGCTGAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGG > 1:893217‑M1/1‑150 (MQ=255) ctgctgAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGGTc < 2:893217/150‑1 (MQ=255) ctgctgAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGGTc < 2:1065250/150‑1 (MQ=255) ctgctgAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGAAGGTGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGGTc < 1:152056/150‑1 (MQ=255) ctgAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGGTCGaa < 2:1121595/150‑1 (MQ=255) ctgAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGGTCGaa < 1:1525364/150‑1 (MQ=255) tgAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAACCAGAACTTCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGGTCGAAc > 1:1671515/1‑150 (MQ=255) ggCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGG > 2:1448783‑M1/1‑139 (MQ=255) 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cACCTTCACCCAGGCGGTGGTCGAACGCACTGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAg > 1:177605/1‑150 (MQ=255) cACCTTCACCCAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAg > 2:1837631/1‑150 (MQ=255) aCCTTCACCCAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAGc < 2:345237/150‑1 (MQ=255) cTTCACCCAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCAttt < 2:1800709/114‑1 (MQ=255) cTTCACCCAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCAttt > 1:1800709/1‑114 (MQ=255) ttCACCCAGGCGGTGGtcgaacgcaccgggggcacgttcggccaccgcctgggtgaaggtggcttcgtgcaccagtacatccgcacccctggcgacggctgccagcagttctggcttgtcgttgtccccgcacacgatcacccgccgggg > 2:1266168‑M1/1‑16 (MQ=255) tCACCCAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAGCCCGc < 2:1063703/150‑1 (MQ=255) cccAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGAcc > 2:655322/1‑132 (MQ=255) cccAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGAcc < 1:655322/132‑1 (MQ=255) cccAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAGCCCGcaca > 1:247877/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAGCCCGCACATc > 2:1481060/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAGCCCGCACATCGa < 2:209969/150‑1 (MQ=255) ggtCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGccaccgcctgggtgaaggtggcttcgtgcaccagtacatccgcacccctggcgacggctgccagcagttctgg > 1:303346‑M2/1‑27 (MQ=255) ggtCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGccaccgcctgggtgaaggtggcttcgtgcaccagtacatccgcacccctggcgacggctgccagcagttctgg < 2:303346‑M2/100‑74 (MQ=255) | AACTGCTGAACGGCAACGACTACCTGCGCCCTTCGCGTCCGCCCCGGCGGGTGATCGTGTGCGGGGACAACGACAAGCCAGAACTGCTGGCAGCCGTCGCCAGGGGTGCGGATGTACTGGTGCACGAAGCCACCTTCACCCAGGCGGTGGTCGAACGCACCGGGGGCACGTTCGGCCACAGCACCGCCGCTGAGGTGGCACGCTTTGCCGAGGCCGCTGGCGTGCGCAACCTGGTACTGACGCATTTCAGCGCCCGCTACCAGAACGACCCACGGCGCAGCCCGCACATCGA > NC_002947/4544169‑4544460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |