| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5492594 = | 73 (0.980) | 5 (0.070) | 4/246 | NT | 6.7% | coding (1470/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
| ? | NC_002947 | 5492617 = | 68 (0.940) | coding (1447/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase | |||||
ATCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGC > NC_002947/5492446‑5492741 | gcccaggcaggtgcaccgctggggcatgacttctgcgtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccagg > 2:1280689‑M1/149‑150 (MQ=255)gcccaggcaggtgcaccgctggggcatgacttctgcgtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccagg > 2:1919518‑M1/149‑150 (MQ=255) tCCAACCAGCACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGc < 2:324489/150‑1 (MQ=255) ccaggcaggtgcaccgctggggcatgacttctgcgtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccaggcc > 1:1488285‑M1/147‑150 (MQ=255) tgcaccgctggggcatgacttctgcgtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccaGGCCGCACCGAGc > 2:481462‑M1/138‑150 (MQ=255) ccATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCt > 2:1875662/1‑150 (MQ=255) ccATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCt > 1:1558435/1‑150 (MQ=255) gTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGc > 1:1334374/1‑150 (MQ=255) cgcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCggc < 2:1684729/150‑1 (MQ=255) tGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCggcctgg > 2:432954/1‑150 (MQ=255) cGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCggcctggcct < 2:194281/150‑1 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTGCTCGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCtt > 1:1861385/1‑150 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑g > 2:146916/1‑135 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑g < 1:146916/135‑1 (MQ=255) aCCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGGTGTCGGCGCACAACCTCCAGGGGCACACCGAGCT‑GGTGCggcctggcactg > 1:676378/1‑146 (MQ=255) aCCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAgg > 1:983039/1‑120 (MQ=255) aCCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAgg < 2:983039/120‑1 (MQ=255) cATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGTCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGga > 2:1402649/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCgg > 2:30984/1‑150 (MQ=255) ggCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCggg < 1:30984/150‑1 (MQ=255) gcagcaGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGt < 2:801911/150‑1 (MQ=255) cagTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTa < 2:1558435/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGaa < 1:502953/150‑1 (MQ=255) tGACTACCCTCAGCGCTGGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGAGTATCGGCACCCCGATGTCGGCCAACAACCTCCCGGGCCAAAAAGCGCT‑GGTTTGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCa < 1:1875662/150‑1 (MQ=255) gACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAg > 1:373283/1‑150 (MQ=255) tACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTc > 2:217130/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGcc > 2:336854/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCCTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGcc > 1:1921671/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCggg > 2:1392302/1‑121 (MQ=255) cAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCggg < 1:1392302/121‑1 (MQ=255) aGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTgg < 1:357002/150‑1 (MQ=255) gCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGGT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTggg > 1:313134/1‑150 (MQ=255) gTCTGCCCCGGCCTACCGCTGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCa < 1:1133253/150‑1 (MQ=255) gTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCa < 2:1334374/150‑1 (MQ=255) gTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCCTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCa < 2:1921671/150‑1 (MQ=255) tCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTTTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAg > 1:101997/1‑150 (MQ=255) ccccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCACGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAg < 2:397193/150‑1 (MQ=255) cccGGCCTGCCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCt < 2:1580244/139‑1 (MQ=255) cccGGCCTGCCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCt > 1:1580244/1‑139 (MQ=255) cccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAg > 2:1022138/1‑120 (MQ=255) cccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAg < 1:1022138/120‑1 (MQ=255) cccGGCCTACCAACGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAgg < 1:390302/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt > 2:812642/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt < 2:664382/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt < 1:1402649/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt > 1:811974/1‑150 (MQ=255) 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aGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGAc > 1:1192648/1‑150 (MQ=255) aGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGAc < 2:130313/150‑1 (MQ=255) ggACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGCTc > 1:1183500/1‑146 (MQ=255) ggACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATc < 2:1183500/146‑1 (MQ=255) tACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCCCAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGAcagatc > 1:980702/1‑145 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |