New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5743378 = | 73 (0.980) | 11 (0.160) | 8/236 | NT | 13.3% | intergenic (‑155/+92) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
? | NC_002947 | 5743460 = | 76 (1.100) | intergenic (‑237/+10) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
GAACGGATTGGGGGGATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGA > NC_002947/5743234‑5743526 | gggtcgaggatctgtggcacacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTcgcg > 1:452466‑M1/145‑150 (MQ=255) gggtcgaggatctgtggcacacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTcgcg > 2:1103734‑M1/145‑150 (MQ=255) ggtcgaggatctgtggcacacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggaactccacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCgg > 1:1860183‑M1/144‑150 (MQ=255) aaCGGATTGGGGGGATTAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCgg < 1:898975/150‑1 (MQ=255) aCGGATTGGGGGGATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCggg > 1:981365/1‑150 (MQ=255) tcgaggatctgtggcacacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCGGgc < 1:559318‑M1/9‑1 (MQ=255) cGGATTGGGGGGATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGgc < 1:899953/150‑1 (MQ=255) ttGGGGGGATGAAAAACCCACGCGGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGgcgcgc > 2:1613525/1‑150 (MQ=255) ggggggATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTGGCTTGAAACTGCTTGGACGGAGCCGTCGCCTGCTCGTGTCTCCATTCGCGGGCGcgctc < 1:239605/150‑1 (MQ=255) ggggggATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGcgctc < 1:1757560/150‑1 (MQ=255) gggggATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGCATACCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGcgcccg > 2:259120/1‑150 (MQ=255) gATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTcc > 2:1783094/1‑150 (MQ=255) gATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTcc > 2:163818/1‑150 (MQ=255) tGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCca < 1:306479/150‑1 (MQ=255) tGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCca < 1:617174/150‑1 (MQ=255) gcacacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCGGgcgtgcccgcgaa < 2:931279‑M1/20‑4 (MQ=255) acacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccaTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCcaca < 1:803566‑M1/24‑1 (MQ=255) cgcagtagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCggg > 1:1436093‑M1/121‑128 (MQ=255) cgcagtagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCggg < 2:1436093‑M1/8‑1 (MQ=255) aCGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGCCTGGTTGTGTGTCCATCCCCGGGCGCGCTCGCCCCCACAGG‑TAcctc > 2:1778620/1‑147 (MQ=255) cAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCa < 2:591999/150‑1 (MQ=255) tttACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGc < 1:1853134/150‑1 (MQ=255) aCAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCtt > 1:456403/1‑150 (MQ=255) agTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTg < 1:1478388/150‑1 (MQ=255) 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tgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgtaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGacac > 2:1527882‑M1/94‑150 (MQ=255) gCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGacac < 2:351456/150‑1 (MQ=255) gCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCtgt > 2:452270/1‑150 (MQ=255) cGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCtgtg < 1:452270/150‑1 (MQ=255) acggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCtgtg > 2:1621300‑M1/89‑150 (MQ=255) 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ccACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGATGTGATTGTTATATCATT‑GTTGGTGCTAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcg > 1:1170230/1‑150 (MQ=255) cACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTAGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc > 1:977459/1‑150 (MQ=255) aCGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 2:563505/1‑150 (MQ=255) ctctCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTAGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACg > 2:981365‑M2/1‑149 (MQ=255) tctcAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTcgcg < 2:324161/71‑1 (MQ=255) tctcAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTcgcg > 1:324161/1‑71 (MQ=255) 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ttCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCgg > 1:898740/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGt < 2:1726717/150‑1 (MQ=255) cGCCAGGCCGGTGGCCTGGTTCTCCGACCGTTCGCCGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TCCAGCGCAACAAAAAAGGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTg < 1:34312/150‑1 (MQ=25) tggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCt > 1:423879‑M1/29‑87 (MQ=255) tggaaggcattggattgaggtgaggccgTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCt < 2:423879‑M1/59‑1 (MQ=255) cGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTc > 2:1694932/1‑150 (MQ=255) gtggtCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTcgc < 2:224483/150‑1 (MQ=255) gtggtCTGGTTGTCTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGGAGCTTGTGAGGCCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTcgc < 1:698315/150‑1 (MQ=38) gtCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGaa < 2:302736/150‑1 (MQ=255) gtCTGGTTGTGGGTCCCTTCGCGGGCGCCCTCGCTGCCACAGG‑TACAGCGGAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGaa < 2:310025/150‑1 (MQ=39) tCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAAt < 2:898740/150‑1 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGc < 2:399089/87‑1 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGc > 1:399089/1‑87 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTg > 2:1212504/1‑150 (MQ=255) ttGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGc < 2:1170230/150‑1 (MQ=255) tgtgtgTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCg < 1:1281197/150‑1 (MQ=255) tgtgtCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGt < 1:1212504/150‑1 (MQ=255) tgtCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTcc > 1:412110/1‑150 (MQ=255) tCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcga > 2:1085124/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGTGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTTCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCCAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGATTGGTGCGGTCcgacga < 2:977459/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACCGGCTTCCG‑GCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgacga > 1:49731/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCgg < 1:371547/119‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCgg > 2:371547/1‑119 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgacga > 1:877497/1‑150 (MQ=255) | GAACGGATTGGGGGGATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGG‑TACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGA > NC_002947/5743234‑5743526 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |