New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2063227 | 22 (0.290) | 7 (0.120) | 7/204 | NT | 25.6% | intergenic (+41/‑166) | PP_1838/PP_1839 | membrane protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2063271 | 23 (0.380) | intergenic (+85/‑122) | PP_1838/PP_1839 | membrane protein/hypothetical protein |
CAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATGAAAGAGTGGGAAGTCATTTTTGCC > NC_002947/2063124‑2063419 | tcaacgaacaccaggtgtgtgatgcctgaataactgaccttggggcggggataatgttcagtccgggaaaattgtgcggGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGa > 1:1006222‑M1/80‑150 (MQ=255) cAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCga < 1:792710‑M2/150‑3 (MQ=255) aacgaacaccaggtgtgtgatgcctgaataactgaccttggggcggggataatgttcagtccgggaaaattgtgcggGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGc > 1:1193436‑M1/78‑150 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgg > 1:385733‑M2/1‑144 (MQ=255) acaccaggtgtgtgatgcctgaataactgaccttggggcggggataatgttcagtccgggaaaattgtgcggGGCCCATTTGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCa < 2:431859‑M1/78‑1 (MQ=255) gACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaa > 2:200099‑M2/1‑140 (MQ=255) tgatgcctgaataactgaccttggggcggggataatgttcagtccgggaaaattgtgcggGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAg < 2:1614478‑M1/72‑1 (MQ=255) tgatgcctgaataactgaccttggggcggggataatgttcagtccgggaaaattgtgcggGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAg > 1:1614478‑M1/61‑132 (MQ=255) tgGATACCACCCCCGCCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGCCCGCCTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggc > 1:109021‑M2/1‑126 (MQ=255) cacCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTAGCCCGGTCCCACGCGCATTGCACAGGGGTCGGGCCCTGTGCAGGACCTGTGCGCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCCGcac > 2:1003292/1‑150 (MQ=255) cGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCTCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATccc > 2:474734/1‑150 (MQ=255) GGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGc > 1:474734‑M1/1‑150 (MQ=255) CATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGtcatca > 2:1553634‑M1/1‑150 (MQ=255) CATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATca < 1:1249199‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTgg > 2:792710‑M1/1‑150 (MQ=255) CCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTc < 2:1761137‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTc > 2:1249199‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggccgcaacgcggccccggtttacttcggtgtgccgtgcaccacgccggcggtgttatccagcaggctcttggtcgcgg < 2:1713433‑M2/150‑101 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGAc < 2:720808‑M1/94‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGAc > 1:720808‑M1/1‑94 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg < 2:955516‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg < 1:1262508‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTCCCAGAGGTGAACAGTATCCCCGCCCCAACGCCAGTTATTCAGGCATCACACACctcgtgtccg < 2:258340‑M1/150‑4 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACATTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCGCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGCTGTTCg < 2:636088‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGt < 1:585115‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGt < 1:1339231‑M1/150‑1 (MQ=255) ccACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGaat > 1:788728/1‑148 (MQ=255) cacaGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCa > 2:1464115/1‑121 (MQ=255) cacaGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCa < 1:1464115/121‑1 (MQ=255) acaGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTga > 2:1817223/1‑150 (MQ=255) caGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACAtt > 1:549258/1‑93 (MQ=255) caGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACAtt < 2:549258/93‑1 (MQ=255) aGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggccgcaacgcggccccggtttacttcggtgtgccgtgcaccacgccggcggtgttatccaacaggctcttggtcgcggtctggatata < 2:1235523‑M2/150‑111 (MQ=255) gCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggccgcaacgcggccccggtttacttcggtgtgccgtgcaccacgccggcggtgttatccagcaggctcttggtcgcggtctggatatacg < 2:501025‑M2/150‑113 (MQ=255) gCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAgg > 2:297526/1‑150 (MQ=255) gCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGAGCAAGCCCGCGAATGTGCCCCGCACAGCTTTCCCGGATTCCTTATTTTCCCCGCTCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAgg > 1:1875432/1‑150 (MQ=255) aTTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGGGTTCGTTGACTGAGAGGGt > 1:843617/1‑150 (MQ=255) tGCACAGGGTTCCGTCCGTGTGCAGGTCCTGTCCGCGCGGGCAGGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTcc < 2:372473/150‑1 (MQ=255) acaGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggccgcaacgcggccccggtttacttcggtgtgccgtgcaccacgccggcggtgttatccagcaggctcttggtcncgg > 2:1199795‑M2/1‑31 (MQ=255) acaGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggccgcaacgcggccccggtttacttcggtgtgccgtgcaccacgccggcggtgttatccagcaggctcttggtcgcgg < 1:1199795‑M2/131‑101 (MQ=255) ggTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGGATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAAt < 2:1262508/150‑1 (MQ=255) gTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATg > 2:1597663/1‑150 (MQ=255) ttCGGACCTCGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGt > 2:468045/1‑126 (MQ=255) ttCGGACCTCGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGt < 1:468045/126‑1 (MQ=255) gACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCACCGCACAACTGTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATGAAaga > 2:266242/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggc > 2:1579638‑M2/1‑19 (MQ=255) ccTTGTGCAGGTCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggc < 1:1579638‑M2/43‑25 (MQ=255) ccTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCt > 2:1837587/1‑111 (MQ=255) ccTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCt < 1:1837587/111‑1 (MQ=255) cTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATGAAAGAGTg < 2:585115/150‑1 (MQ=255) gCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATGAAAGAGTGGGAAg > 2:86094/1‑150 (MQ=255) tggTTCTGTGCGCGCGGGTGTGCCCGCGAGTGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGACCAGCATGCCGGCCCCACTGTTAGGTATTCAGGCATCTCACACCTGGTGTTCGTTTACTGAGAGGGTCCGTTCACGGAGAGCGTGGGAAGTc > 2:866804/2‑150 (MQ=255) aGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATGAAAGAGTGGGAAGTc > 1:1380180/1‑150 (MQ=255) tCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggccgcaacgcggccccggtttacttcggtgtgccgtgcaccacgccggcggtgttatccagcaggctc > 2:624851‑M2/1‑8 (MQ=255) tCCTGTGCgagcgggcaagcccgcgaatgggccgcaacgcggccccggtttacttcggtgtgccgtgcaccacgccggcggtgttatccagcaggctc < 1:624851‑M2/98‑91 (MQ=255) tgCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATGAAAGAGTGGGAAGTCATTTTTGc > 1:635662/1‑150 (MQ=255) gCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATGAAAGAGTGGGAAGTCATTTTTGcc < 1:1817223/150‑1 (MQ=255) | CAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAATGAAAGAGTGGGAAGTCATTTTTGCC > NC_002947/2063124‑2063419 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |