New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2294436 | 90 (1.210) | 6 (0.080) | 6/242 | NT | 6.6% | coding (69/1131 nt) | ppgL | L‑alpha‑hydroxyglutaric acid gamma‑lactonase |
? | NC_002947 | = 2294448 | 83 (1.170) | coding (81/1131 nt) | ppgL | L‑alpha‑hydroxyglutaric acid gamma‑lactonase |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TCGACGATGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGCCGACCAGCGTCAGCTGTTC > NC_002947/2294299‑2294595 | tCGACGATGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCtggtg < 1:311299/150‑1 (MQ=255) tCGACGATGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCtggtg < 1:1321971/150‑1 (MQ=255) tCGACGATGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCtggtg < 1:1230869/150‑1 (MQ=255) tCGACGATGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAACCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCtggtg < 1:1399802/150‑1 (MQ=255) gacgaTGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGgg > 1:986407‑M2/1‑148 (MQ=255) gaTGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGggcag < 2:1299866‑M2/150‑6 (MQ=255) gaTGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGggcag > 2:589817‑M2/1‑145 (MQ=255) aTGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGggcagc > 1:154316‑M2/1‑144 (MQ=255) ccAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTac > 2:1175712/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTacac < 1:1344179/150‑1 (MQ=255) aCGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACAcc < 1:1299866/150‑1 (MQ=255) cgcgcATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATg < 1:579727/150‑1 (MQ=255) gcgcATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATgg > 2:1513422/1‑150 (MQ=255) tCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGGTAATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCgcca < 1:577356/150‑1 (MQ=255) tAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGccagccag > 2:241026/1‑150 (MQ=255) tGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGCTGGCGCCAGCCAGGGTAt > 1:506951/1‑150 (MQ=255) tATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCt > 1:400330/1‑150 (MQ=255) tGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTAc < 1:241026/150‑1 (MQ=255) 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cccGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTcgacg > 1:1208273/1‑150 (MQ=255) ccGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTcgacga > 1:1505599/1‑150 (MQ=255) ccGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTcgacga > 1:945393/1‑150 (MQ=255) gatgatGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACaa > 1:1263539/1‑150 (MQ=255) gatgatGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACaa > 1:1886331/1‑150 (MQ=255) gatgaCCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTTCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAggc > 2:637600/1‑150 (MQ=255) aCCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTTCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAggccggc < 1:637600/150‑1 (MQ=255) aCCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAggccggc > 2:1906786/1‑150 (MQ=255) cAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAggccggc < 1:1665083/148‑1 (MQ=255) cAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAggccggc > 2:1665083/1‑148 (MQ=255) cAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCa > 2:1167096/1‑150 (MQ=255) cAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCa > 1:1004272/1‑150 (MQ=255) cAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCa > 2:562879/1‑150 (MQ=255) aGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCaaa < 1:868153/150‑1 (MQ=255) gATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAgg < 1:1404498/110‑1 (MQ=255) gATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAgg > 2:1404498/1‑110 (MQ=255) 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tctGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATc > 2:175014/1‑96 (MQ=255) tctGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATc < 1:175014/96‑1 (MQ=255) tctGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTg > 2:1525083/1‑140 (MQ=255) tctGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTg < 1:1525083/140‑1 (MQ=255) tGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTACCTCGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTc < 1:601509/150‑1 (MQ=255) cccACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTg < 2:888223/140‑1 (MQ=255) ccACGCTGCCACCTTGCTGGTGggcagcgtgggcagagattgtcaggctcatcaggctagcggtcagcaggctcgtccaggtccggttcatcttggtcatcatccgg > 2:1501229‑M2/1‑22 (MQ=255) ccACGCTGCCACCTTGCTGGTGggcagcgtgggcagagattgtcaggctcatcaggctagcggtcagcaggctcgtccaggtccggttcatcttggtcatcatccgg < 1:1501229‑M2/107‑86 (MQ=255) ccACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGc > 1:53220/1‑150 (MQ=255) ccACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGc > 2:642299/1‑150 (MQ=255) ccACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGc > 2:181271/1‑150 (MQ=255) ccACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCAAAAATCTGAAGAAGTTGAAGATCTTCATCCCTGCTTGTCTTGTGCTGTCGGc > 2:496078/1‑150 (MQ=255) aCGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACACGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGCCg > 2:224870/1‑150 (MQ=255) tGCCACCTTGCTGGTGggcagcgtgggcagagattgtcaggctcatcaggctagcggtcagcaggctcgtccaggtccggttcatcttggtcatcatc > 1:839137‑M2/1‑16 (MQ=255) tGCCACCTTGCTGGTGggcagcgtgggcagagattgtcaggctcatcaggctagcggtcagcaggctcgtccaggtccggttcatcttggtcatcatc < 2:839137‑M2/98‑83 (MQ=255) tGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGa > 1:1853831/1‑110 (MQ=255) tGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGa < 2:1853831/110‑1 (MQ=255) ccACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGCCGACCAGc > 1:1712699/1‑150 (MQ=255) cACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGCCGACCAGCg > 2:390031/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGCCGACCAGCGTCAg < 2:1886331/150‑1 (MQ=255) tggtggGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGCCGACCAGCGTCAGCTGt > 1:363799/1‑150 (MQ=255) gtggGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGCCGACCAGCGTCAGCTGTTc > 2:454298/1‑150 (MQ=255) | TCGACGATGCCAACGGCGCGCATCGGCTAGTCTGTATGAGTGCCTTTCGCGCCCCGGATGATGACCAAGATGAACCGGACCTGGACGAGCCTGCTGACCGCTAGCCTGATGAGCCTGACAATCTCTGCCCACGCTGCCACCTTGCTGGTGGGCAGCTACACCGATGGCGCCAGCCAGGGTATCTACCGCTACCATTTCGACGACAAGGCCGGCCAAATCGGCCCCACACCTCTGCAGGTGGTGAAAAGCGTCAGCCCTTCGTGGCTGGTGCTGTCGGCCGACCAGCGTCAGCTGTTC > NC_002947/2294299‑2294595 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |