New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2327708 = | 62 (0.830) | 4 (0.060) | 4/240 | NT | 5.8% | coding (664/924 nt) | PP_2046 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2327746 = | 72 (1.020) | coding (626/924 nt) | PP_2046 | LysR family transcriptional regulator |
GCGCCAGTTGCCGCGGCAGCACCACACACATGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCGGCACCTCGTCGAA > NC_002947/2327600‑2327894 | gcgcCAGTTGCCGCGGCAGCACCACACACATGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGt > 2:1098219/1‑150 (MQ=255) gcCAGTTGCCGCGGCAGCACCACACACATGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGc > 1:1804262/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCCGCGGCAGCACCACACACATGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCAc < 1:584960/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCGGCAGCACCACACACATGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCCATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCa < 1:1223281/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGCAGCACCACACACATGTCGGTTGCTGTGGCGAGGTGTGCGGCCTGCAGGTAGTTGGCCGCCTTCCATGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGa < 1:1278157/150‑1 (MQ=255) gcgGCAGCACCACACACATGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGAtgt < 1:1254702/150‑1 (MQ=255) ccacACACATGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGc > 1:1837357/1‑150 (MQ=255) cacacacaTGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGcc > 2:593997/1‑150 (MQ=255) acaTGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGa > 2:1799896/1‑150 (MQ=255) acaTGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGa > 1:1426078/1‑150 (MQ=255) caTGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGaa < 2:1837357/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCGTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTACAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGc < 1:361513/150‑1 (MQ=255) tCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCg > 2:1556328/1‑150 (MQ=255) ggTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCACCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTc < 1:1215833/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAg < 2:1496340/150‑1 (MQ=255) gCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGt < 1:1144631/150‑1 (MQ=255) aGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGcc > 1:1404168/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTg < 1:1305242/150‑1 (MQ=255) ggcggcCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGcc > 1:362944/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCTGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGgcgc > 1:526929/1‑150 (MQ=255) cAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATCCGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATATGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAg < 2:1056115/150‑1 (MQ=255) gTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTg > 2:395814/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTc > 2:1347527/1‑122 (MQ=255) ttGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTc < 1:1347527/122‑1 (MQ=255) gggCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGtg > 2:1345444/1‑150 (MQ=255) cGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGtgctg < 1:1292422/150‑1 (MQ=255) gaggTAGAGGCGGTTTTCGGGGTCAGGCCGTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGtgctgc > 2:504400/3‑150 (MQ=255) tGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCgg < 2:198857/142‑1 (MQ=255) tGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCgg > 1:198857/1‑142 (MQ=255) tGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTgctgct < 2:1306399/150‑1 (MQ=255) gCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCAc > 2:655876/1‑71 (MQ=255) gCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCAc < 1:655876/71‑1 (MQ=255) gCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAgc > 2:122646/1‑150 (MQ=255) gCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAgc > 2:1909537/1‑150 (MQ=255) gCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGGCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAgc > 1:1385829/1‑150 (MQ=255) aTTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAg < 2:743417/89‑1 (MQ=255) aTTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAg > 1:743417/1‑89 (MQ=255) ttGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGAt < 1:745057/150‑1 (MQ=255) gggTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGTCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCa < 2:725017/150‑1 (MQ=255) gggTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCa < 2:908188/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAg < 1:1098219/150‑1 (MQ=255) taagaacTTGCTCGCCCAATGTCTGGTGGCGCAGGCCCCGTTTTTGGCCTTCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGTTCAGGAAGGCGTCGAGGGGCAGTGCCTGGGCCGGTGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGGCCAGCGCGATCTGCAggg < 2:875160/144‑1 (MQ=255) cAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGt < 2:1735202/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTc > 2:716714/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGcc < 2:1688023/70‑1 (MQ=255) cTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGcc > 1:1688023/1‑70 (MQ=255) cTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGATCTGGCCGCCGTCCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGCTGCGGGTGCCGCTGGCGCAGCGCGCTCTTCCGGGTTTCAc > 2:676010/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGgc > 2:337898/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCgg < 2:1832715/110‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCgg > 1:1832715/1‑110 (MQ=255) tCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGgcgc < 1:337898/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGgcgc > 1:465721/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCAAAAAGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGgcgc > 1:1482283/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCACTGATCGACCATGCCCCGGGTCTGTCCGCCGTGCACCCAGATCTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGACGTCCAGTGCCTGGCCCCGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCCGCGCGCTCCGCAGAGTTTCACCgccc > 2:436523/1‑148 (MQ=255) cggccagacccggggcatggtcgaccagtggctggccgCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGtgc < 1:1424335‑M2/75‑1 (MQ=255) cggccagacccggggcatggtcgaccagtggctggccgCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGtgc > 2:1424335‑M2/39‑113 (MQ=255) GGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCa < 1:789749‑M1/101‑1 (MQ=255) GGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCa > 2:789749‑M1/1‑101 (MQ=255) GGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGAACACCCACATGTGCCGCCACCCGGGGAATGCGTCGAGGGCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCa > 2:1653358‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCCAGCCACTGGTCGAATAGTCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCa < 1:152850‑M1/150‑1 (MQ=255) cagacccggggcatggtcgaccagtggctggccgCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTg < 2:1010946‑M2/53‑1 (MQ=255) cagacccggggcatggtcgaccagtggctggccgCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTg > 1:1010946‑M2/35‑87 (MQ=255) CAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAggg > 2:1404168‑M1/1‑150 (MQ=255) GCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCaggggg < 2:1689319‑M1/150‑2 (MQ=255) aCTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGc > 1:1110966/1‑150 (MQ=255) aCTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGc > 1:1787519/1‑150 (MQ=255) tGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCgg < 1:1574820/150‑1 (MQ=255) tGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCgg < 2:465721/150‑1 (MQ=255) gTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCgggg > 2:91462/1‑149 (MQ=255) gTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCgg < 1:401169/148‑1 (MQ=255) gTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCgg > 2:401169/1‑148 (MQ=255) tCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTg > 1:1628675/1‑150 (MQ=255) gACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGaa > 1:1828055/1‑150 (MQ=255) gACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGaa < 1:1909537/150‑1 (MQ=255) aCCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAg > 1:963692/1‑119 (MQ=255) aCCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAg > 1:1049807/1‑150 (MQ=255) aCCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGCTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAg < 2:963692/119‑1 (MQ=255) ccATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAgc > 2:1108947/1‑150 (MQ=255) cATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAgcg > 1:1236678/1‑150 (MQ=255) cATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGGCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAgcg > 1:391371/1‑150 (MQ=255) cccGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTGTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCg > 1:951177/1‑150 (MQ=255) ccagggTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGGGAAGCgcggcg > 1:553219/4‑150 (MQ=255) ccGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCgg > 2:1784852/1‑150 (MQ=255) ccGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCgg > 1:1428185/1‑150 (MQ=255) ggTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCGGCAc < 1:122646/150‑1 (MQ=255) ggccgCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCGGCACCtcgt < 2:1385829‑M2/145‑1 (MQ=255) gccgCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCGGCACCtcgtc > 2:837224‑M2/5‑150 (MQ=255) gCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCGGCACCTCGTCGaa > 1:1583777‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCGCCAGTTGCCGCGGCAGCACCACACACATGTCGGTGGCTGCGGCCAGATGGGCGGCCTGCAGGTAGTTGGGCGTGGTATAGGCGATTTGCCGGGTCAGGCCTTGCTCGGCCAGCCACTGGTCGACCATGCCCCGGGTCTGGCCGCCGTGCACCCAGATGTGCCGCAAGCCCAGGAATGCGTCGAGGTCCAGTGCCTGGCCCGGCGCCAGGTGCGGGTGCTGCTGGCGCAGCGCGATCTGCAGGGTTTCACGGCGCCAGGGGTGGCGGGTGAAGCGCGCCGGCACCTCGTCGAA > NC_002947/2327600‑2327894 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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