New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2533886 = | 70 (0.940) | 7 (0.100) | 7/244 | NT | 9.7% | coding (264/489 nt) | mrpE | K(+)/H(+) antiporter subunit E |
? | NC_002947 | 2533925 = | 63 (0.880) | coding (225/489 nt) | mrpE | K(+)/H(+) antiporter subunit E |
AGTTCGGACCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCGGGGCT > NC_002947/2533776‑2534074 | aGTTCGGACCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAgg > 2:1099602/1‑150 (MQ=255) gTTCGGACCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGt < 1:1099602/150‑1 (MQ=255) gTTCGGACCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGt < 2:1140985/150‑1 (MQ=255) ggACCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGACTACAGACCGGGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGa < 2:1500379/150‑1 (MQ=255) gACCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAg < 1:748848/150‑1 (MQ=255) gACCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAg < 1:215020/150‑1 (MQ=255) aCCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAgg < 2:1693429/150‑1 (MQ=255) ccAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGt < 2:1300700/150‑1 (MQ=255) cAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTg > 2:1732522/1‑150 (MQ=255) cAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTg > 1:1834264/1‑150 (MQ=255) aCTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATc < 2:1689267/150‑1 (MQ=255) aCTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATc > 1:1298549/1‑150 (MQ=255) aGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGAt < 1:590351/150‑1 (MQ=255) gCACCACGGTGGTGATCATCGGCGTCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTACGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCACCAGGGTTGATGTGATCACATCGATGc < 2:961560/150‑1 (MQ=255) gCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCCATAGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGc < 1:782941/150‑1 (MQ=255) ccacGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGa < 1:724463/150‑1 (MQ=255) cacGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGAc > 1:1576449/1‑150 (MQ=255) acGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGAcc < 1:1609569/150‑1 (MQ=255) tgATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGa < 2:780665/150‑1 (MQ=255) atcatcGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATg < 1:830714/150‑1 (MQ=255) atcGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGCgg < 1:577800/150‑1 (MQ=255) atcGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAgg > 2:1892254/1‑150 (MQ=255) atcGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAgg > 2:743242/1‑150 (MQ=255) gACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAggcgg > 1:239826/1‑150 (MQ=255) aCAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAggcggg > 2:1801801/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCAGATTGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGa < 2:239826/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAgg < 1:743242/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATgg < 1:1908003/144‑1 (MQ=255) ggCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATgg > 2:1908003/1‑144 (MQ=255) gCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAgggg < 1:214341/150‑1 (MQ=255) cGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGgc > 1:172050/1‑150 (MQ=255) gTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGgcg > 1:84504/1‑150 (MQ=255) cGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACgtgt < 1:357256/150‑1 (MQ=255) cAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGAt > 2:1595675/1‑93 (MQ=255) cAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGAt < 1:1595675/93‑1 (MQ=255) cAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCAtgctg > 2:580197/1‑150 (MQ=255) cAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCAtgctg > 2:1063587/1‑150 (MQ=255) aaTGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGAGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCAtgctgc > 1:232655/1‑150 (MQ=255) tGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCgg < 1:1801801/150‑1 (MQ=255) tGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCgg < 1:178754/150‑1 (MQ=255) tgAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAgg < 2:1476187/150‑1 (MQ=255) tgAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAgg < 1:1732522/150‑1 (MQ=255) acgaacgCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGgc < 1:375186/150‑1 (MQ=255) cgCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCAt < 2:1834264/150‑1 (MQ=255) gCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGTCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATc > 2:1157914/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATc > 1:7774/1‑150 (MQ=255) agagCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATg > 1:497077/1‑100 (MQ=255) agagCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACgtgt < 1:84770/121‑1 (MQ=255) agagCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACgtgt > 2:84770/1‑121 (MQ=255) agagCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCaa < 2:172050/150‑1 (MQ=255) agagCGTGGCGGCTGCTTGGCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATg < 2:497077/100‑1 (MQ=255) ctgctggtggcccgtggtgtgctgcgggccgacaagcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAg > 1:1106050‑M2/40‑150 (MQ=255) CTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGCGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATAAACAGTGGCGCCAg < 2:487453‑M1/150‑1 (MQ=255) tgctggtggcccgtggtgtgctgcgggccgacaagcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGt > 2:799263‑M2/39‑150 (MQ=255) GCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTa < 1:1046129‑M1/150‑1 (MQ=255) ctggtggcccgtggtgtgctgcgggccgacaagcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAg < 1:1430322‑M2/54‑1 (MQ=255) ctggtggcccgtggtgtgctgcgggccgacaagcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAg > 2:1430322‑M2/37‑90 (MQ=255) CTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGTGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTAt < 2:1242518‑M1/150‑1 (MQ=255) CTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTAt > 2:1298549‑M1/1‑150 (MQ=255) TTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGTTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATg < 1:1452028‑M1/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGcc < 2:232655/150‑1 (MQ=255) tggcccgtggtgtgctgcgggccaccagcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCaa > 1:983161‑M2/32‑150 (MQ=255) tggCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAAAAGTCGCGCCGGAGTGCCaa > 2:1572734/2‑150 (MQ=255) ggCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAg < 1:1892254/150‑1 (MQ=255) gcccgtggtgtgctgcgggccaccagcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGAACCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATAAAAAGTGGCGACAGTATGCCAAGt > 2:798768‑M2/30‑150 (MQ=255) gCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGt < 1:1012334/150‑1 (MQ=255) gcagcaCACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAg < 1:1244018/136‑1 (MQ=255) gcagcaCACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAg > 2:1244018/1‑136 (MQ=255) tggtgtgctgcgggccaccagcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCGGTATGCCAAGTgcggc > 2:612897‑M2/25‑150 (MQ=255) caccacGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCca > 1:54887/1‑150 (MQ=255) caccacGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGAAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCca < 1:1859324/150‑1 (MQ=255) ccacGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCATGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCcagc > 2:393254/1‑150 (MQ=255) ccacGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCcagc > 1:306407/1‑150 (MQ=255) cacGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACgtgt < 1:1498112/86‑1 (MQ=255) cacGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACgtgt > 2:1498112/1‑86 (MQ=255) gggCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCcagcagca > 2:696497/1‑150 (MQ=255) ggCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTCCGAGTGCATGCTGCGGATCAATTAATGTTAACAACATTTTCTCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCcagcagcag < 1:798768/150‑1 (MQ=255) gCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGTCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAgg < 1:1157914/150‑1 (MQ=255) accaGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTg > 2:1588988/1‑150 (MQ=255) accaGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCACCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTg > 1:209002/1‑150 (MQ=255) ccaGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGc > 1:1144591/1‑150 (MQ=255) gcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCGGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCgg < 1:612897‑M2/146‑1 (MQ=255) gcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCgg > 1:281031‑M2/5‑150 (MQ=255) gcagGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCgg < 2:1046129‑M2/146‑1 (MQ=255) agGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCgggg < 1:580197‑M2/148‑1 (MQ=255) gGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATTTTTCGGGCGCATGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCGGGGc < 1:229833‑M2/149‑1 (MQ=255) gGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCGGGGc < 2:1576449‑M2/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGGTGACCACATCGATGCCGACCCGGCAGCTGATGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCCAGGGCGGCGCCCAGCAGCAGGGTGCCAGGGCt > 2:861109/1‑150 (MQ=255) gTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCGGGGCt > 1:759118/1‑150 (MQ=255) gTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCGGGGCt < 2:983161/150‑1 (MQ=255) | AGTTCGGACCAGACTGTGCCAGGCACCACGGTGGTGATCATCGACAGCGCTGCCAGGCCGTGGGGGTCACGCAATGCCAATGGTATGTGAACGAACGCAGAGCGTGGCGGCTGCTTGTCGGCCCGCAGCACACCACGGGCCACCAGCAGGTTGGAGGTGATCACATCGATGCCGACCCGGCAGATGAGGCGGGCGATGGCGAGGGGGCGCCGTACGTGTGCATGCTGCGGGCGCAGGGGCGCCATCAACAGTGGCGCCAGTATGCCAAGTGCGGCGCCCAGCAGCAGGTTGCCGGGGCT > NC_002947/2533776‑2534074 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |