New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4768688 = | 77 (1.030) | 4 (0.060) | 4/240 | NT | 5.2% | coding (169/957 nt) | PP_4218 | lipase/esterase family protein |
? | NC_002947 | 4768730 = | 73 (1.040) | coding (127/957 nt) | PP_4218 | lipase/esterase family protein |
CATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGTTCGATTCTCCAGAGGGGC > NC_002947/4768583‑4768877 | cATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCTGCCAGTGCAGGGTGGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATTGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCg > 1:1780437/1‑150 (MQ=255) aTGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGTTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGa < 2:985423/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGa < 2:532739/150‑1 (MQ=255) cAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGTAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCgtgaa < 1:1499770/150‑5 (MQ=255) aGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGACGTCAATCAGCGCCGAGGAc < 1:152791/150‑1 (MQ=255) gTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGCctc > 2:1259780/1‑150 (MQ=255) gTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGActc > 2:33373/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCtt < 2:428527/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCtt < 2:411383/150‑1 (MQ=255) cagcagCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTc < 1:60108/150‑1 (MQ=255) cagcGCCGCGCGGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTACGGCCCGTCGGTCTTGCCCGCAATCAGCGCCTAGGTCTCTTCGaa < 2:885188/150‑1 (MQ=255) gcgccgcgccGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACt < 1:1259780/150‑1 (MQ=255) gcgccgcgccGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACt > 1:323100/1‑150 (MQ=255) ccgcgccgGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTggc > 1:335095/1‑150 (MQ=255) ccgcgccgGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGAACCGGCAAGGTATGGCCTTCGTGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTggc < 1:974047/150‑1 (MQ=255) cAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCGATCCAGGGTTGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTc > 2:1905423/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGt > 1:1051761/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTccg > 2:746070/1‑150 (MQ=255) 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gcggcgGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGgcat > 2:831061/1‑150 (MQ=255) cgggcggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGgcatgcat < 1:1596814/150‑1 (MQ=255) ggcggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATgg < 1:376333/150‑1 (MQ=255) atgcatgccctggcggcggacgaggcgcgccgccagttcgaagagtcctcggCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGa > 1:1916843‑M1/53‑98 (MQ=255) atgcatgccctggcggcggacgaggcgcgccgccagttcgaagagtcctcggCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGa < 2:1916843‑M1/46‑1 (MQ=255) ggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGgca < 1:1309924/150‑1 (MQ=255) 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ccATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCg > 2:233708/1‑135 (MQ=255) ccATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGcc < 2:541597/150‑1 (MQ=255) aTCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGcc > 1:272353/1‑94 (MQ=255) aTCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGcc < 2:272353/94‑1 (MQ=255) aTCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTc > 2:1880117/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTcc < 1:1360250/150‑1 (MQ=255) 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tcggcgctgattgcgggcaaggccgacgagccggactgcatcagcgCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGgcatgcat > 1:1916843‑M2/47‑98 (MQ=255) aGGTCGCGGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCTGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCTGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGgcc < 2:201617/150‑1 (MQ=255) gctgattgcgggcaaggccgacgagccggactgcatcagcgCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAg > 2:1117553‑M2/42‑150 (MQ=255) TGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGt < 2:1742651‑M1/150‑1 (MQ=255) ATGCAGTCCGGCTCGTAGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCTGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCa > 2:971815‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAg > 2:335095‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAg > 1:1821790‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAg < 1:664016‑M1/150‑1 (MQ=255) tgcgggcaaggccgacgagccggactgcatcagcgCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAgg < 1:1117553‑M2/115‑1 (MQ=255) gCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAgg < 1:1319063/150‑1 (MQ=255) aGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCCCAGGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGt > 1:1640/1‑150 (MQ=255) 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ggCTCGTCGGCCTTGCTCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGACAGGTCAGAGTTCAgg > 2:974346/1‑150 (MQ=255) ggCTCGTCGGCCTTGCGCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAgg < 2:844375/150‑1 (MQ=255) ggCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAgg < 1:1905423/150‑1 (MQ=255) cTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGa < 2:486905/150‑1 (MQ=255) tcgtcgGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGAc > 1:1651533/1‑150 (MQ=255) cgtcgGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACa < 2:815765/150‑1 (MQ=255) tcgGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTggc < 1:1205028/43‑1 (MQ=255) tcgGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTggc > 2:1205028/1‑43 (MQ=255) gCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGtt > 2:1280969/1‑150 (MQ=255) gCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGtt < 2:1553395/150‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTg < 1:732323/112‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTg > 2:732323/1‑112 (MQ=255) ccTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGTTc > 2:280096/1‑150 (MQ=255) cccGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCg < 1:659601/93‑1 (MQ=255) cccGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCg > 2:659601/1‑93 (MQ=255) cGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGTTCGATtctc > 1:908261/1‑150 (MQ=255) atcagcgCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGTTCGATTCTCCaga < 1:1280969‑M2/143‑1 (MQ=255) agcgCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCCGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGTTCGATTCTCCAGAggg > 1:541678‑M2/5‑150 (MQ=255) gcgCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGTTCGATTCTCCAGAgggg > 2:100785‑M2/4‑150 (MQ=255) cgCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGTTCGATTCTCCAGAGGGGc < 2:1582382‑M2/148‑1 (MQ=255) | CATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACCTTGCCGGCGCTGCGTCCGGCCTCCACCAGTTGCAGGTAGGCCGCCAGGTCAGGGTTCAGGGACATCGTTCGATTCTCCAGAGGGGC > NC_002947/4768583‑4768877 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |