| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5208619 | 80 (1.070) | 4 (0.060) | 4/240 | NT | 5.0% | coding (138/933 nt) | PP_4589 | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
| ? | NC_002947 | = 5208647 | 76 (1.080) | coding (110/933 nt) | PP_4589 | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein | |||||
AGGCGGTAATCACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGG > NC_002947/5208500‑5208794 | aGGCGGTAATCACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCgg < 1:1746782‑M2/150‑3 (MQ=255) ggCGGTAATCACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCGTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCCGGCACTGCGGGGCCTGGCggg < 2:841288‑M2/150‑4 (MQ=255) gCGGTAATCACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCgggc > 2:625729‑M2/1‑146 (MQ=255) gTAATCACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCgggccag < 1:140088‑M2/150‑8 (MQ=255) tAATCACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGt > 2:1405132/1‑150 (MQ=255) tCACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGTCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCg > 1:132497/1‑150 (MQ=255) cACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCgg < 2:1746782/150‑1 (MQ=255) cACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCgg < 1:1829877/150‑1 (MQ=255) cgcgGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCa < 1:678947/150‑1 (MQ=255) cgcgGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGACACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCa > 2:677929/1‑150 (MQ=255) gcgGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGGCGACTGGATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCag > 1:337886/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGGTGGTTAAACCACACCTGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTcgc > 2:528374/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGTCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTcgc > 1:332776/1‑150 (MQ=255) ccGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTcgccg > 2:1687654/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTcgccgc > 1:214249/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTcgccgc > 1:938627/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCt < 1:1523818/150‑1 (MQ=255) aGCNACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTGCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGc > 2:1186541/1‑150 (MQ=255) aGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGCACGATGTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGc < 1:528374/150‑1 (MQ=255) tGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGtt > 1:724467/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGgc > 1:623256/1‑150 (MQ=255) cGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTcg < 1:676425/122‑1 (MQ=255) cGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTcg > 2:676425/1‑122 (MQ=255) gCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGcgcg > 1:801332/1‑150 (MQ=255) ccATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCgg > 1:90909‑M2/1‑98 (MQ=255) ccATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCgg < 2:90909‑M2/100‑3 (MQ=255) tCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGgcgc > 2:1679950/1‑150 (MQ=255) tCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGgcgc < 2:765792/150‑1 (MQ=255) tCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGgcgc > 2:1574861/1‑150 (MQ=255) tCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTACCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGgcgc < 1:1739857/150‑1 (MQ=255) gACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGgcgcgc > 1:644179/1‑150 (MQ=255) aCTNTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCa > 2:1199728/1‑150 (MQ=255) cTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCaa > 1:1769354/1‑150 (MQ=255) tGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCaaa > 2:45214/1‑150 (MQ=255) tATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCt > 2:1802503/1‑130 (MQ=255) tATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCt < 1:1802503/130‑1 (MQ=255) tATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAg > 2:272299/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCCGGCgg < 1:1309066‑M2/86‑3 (MQ=255) tCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCCGGCgg > 2:1309066‑M2/1‑84 (MQ=255) ccagtcagGCTTGTGGCCTTGGCGCTGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAgcgc < 2:949273/150‑1 (MQ=255) ccagccagGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAgcgc < 1:272299/150‑1 (MQ=255) gccagGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCgcggc < 2:623256/150‑1 (MQ=255) cagGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGt > 1:1396350/1‑150 (MQ=255) cagGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGt > 1:245186/1‑150 (MQ=255) agGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTa > 1:1842782/1‑150 (MQ=255) agGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTa < 1:1785053/150‑1 (MQ=255) agGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTGCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTa > 1:1842673/1‑150 (MQ=255) gCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATc < 2:337886/150‑1 (MQ=255) gCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATc < 1:1199728/150‑1 (MQ=255) cTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGgcgc < 2:826550/131‑1 (MQ=255) cTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGgcgc > 1:826550/1‑131 (MQ=255) ttGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGa < 2:938627/150‑1 (MQ=255) tgGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCa < 1:1659970/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCAt < 2:916544/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATg < 2:595635/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTACGATGCCTTCC‑‑CCCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTc > 2:528247/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTgg < 1:57323/111‑1 (MQ=255) ttGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTgg > 2:57323/1‑111 (MQ=255) ttGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTc < 2:1736525/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCAt < 1:677929/150‑1 (MQ=255) agcagACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCa < 2:1874256/150‑1 (MQ=255) gACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCgcgg > 2:1043029/1‑105 (MQ=255) gACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCgcgg < 1:1043029/105‑1 (MQ=255) gACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGa < 1:1834055/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCTCGACTTCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCa > 1:1552092/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCa < 1:202963/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCa < 2:1660947/150‑1 (MQ=255) cAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTAc > 2:1798985/1‑150 (MQ=255) gCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTAcgc > 2:486296/1‑150 (MQ=255) tCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCgggccagccggacttgctggccagtctgctgcgccaaggccacaagcctggctggatacagtcgacatgggccggtatcac > 2:230969‑M2/1‑40 (MQ=255) tCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCgggccagccggacttgctggccagtctgctgcgccaaggccacaagcctggctggatacagtcgacatgggccggtatcac < 1:230969‑M2/121‑82 (MQ=255) cGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGAATATCCAGGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGt < 1:528247/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCGTGGCGGGCGAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATGAGTAGGCGCATGGTCa > 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2:1396350/150‑1 (MQ=255) gCCACACCGGGTACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTTGT‑C‑AGCACTTCCAGtt > 1:693564/1‑69 (MQ=255) gCCACACCGGGTACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTTGT‑C‑AGCACTTCCAGtt < 2:693564/69‑1 (MQ=255) acacCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGtt < 1:1679950/150‑1 (MQ=255) ccGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCCCTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGGGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTgcg < 2:1033257/150‑1 (MQ=255) ggCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTgcggcg < 2:1770025/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGcagcag < 2:332776/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGAACAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGcagcag < 1:1186541/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCCTGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCagcggc > 2:1180517/1‑150 (MQ=255) gTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCCGctc > 2:79894/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGcgcg > 2:125071/1‑56 (MQ=255) ccTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGcgcg < 1:125071/56‑1 (MQ=255) ccTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCCGACGGGGTCGTTGCGGTGCAGCAGCTCTTc < 2:644179/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTc < 2:774357/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGAAGGAGAACTTCCTGCGCAGCATCGCTTctgt < 2:1860355/150‑4 (MQ=255) | AGGCGGTAATCACGCGGCAGGCCGTCGGCCAGCAACGGCGTGATACCGGCCCATGTCGACTGTATCCAGCCAGGCTTGTGGCCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGT‑C‑AGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGG > NC_002947/5208500‑5208794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |