New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5791892 = | 89 (1.190) | 3 (0.050) | 3/226 | NT | 3.9% | intergenic (‑119/+76) | hemE/gltD | uroporphyrinogen decarboxylase/glutamate synthase subunit beta |
? | NC_002947 | 5791957 = | 68 (1.020) | intergenic (‑184/+11) | hemE/gltD | uroporphyrinogen decarboxylase/glutamate synthase subunit beta | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GACACCAGCGCAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCTTGAACTTGCCC > NC_002947/5791810‑5792106 | gACACCAGCGCAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAg < 2:1580039/150‑1 (MQ=255) cacCAGCGCAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGt < 1:864012/150‑1 (MQ=255) aGCGCAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGaa < 2:278255/150‑1 (MQ=255) aGCGCAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGaa > 1:726166/1‑150 (MQ=255) gcgcAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGTAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAg < 1:1411895/150‑1 (MQ=255) gcgcAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAg > 2:1340497/1‑150 (MQ=255) cAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTc < 2:997605/150‑1 (MQ=255) cAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTc < 1:1201269/150‑1 (MQ=255) aaaaGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCa < 2:1869555/150‑1 (MQ=255) aaaaGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCa > 2:1268117/1‑150 (MQ=255) aaGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATAAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGa > 1:1686423/1‑150 (MQ=255) cGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGa < 1:1637761/150‑1 (MQ=255) ggccatggccatGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAg < 1:1346129/150‑1 (MQ=255) ggccatggccatGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAg < 1:262782/150‑1 (MQ=255) ggccatggccatGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAg < 2:244237/150‑1 (MQ=255) catggccatgTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTa < 2:280695/150‑1 (MQ=255) catggccatgTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTa < 1:1728390/150‑1 (MQ=255) ccatgTGTTTTGTCTAGTGGATGCCATAGATCAAGCATTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGTGTTCTGCGCTTACCCCTGCGGGAGCGGGCATGCCTGCTAACTGGTTGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCa < 1:719158/150‑1 (MQ=255) 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cacaGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAg > 1:893041/1‑118 (MQ=255) cacaGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAg < 2:893041/118‑1 (MQ=255) cacaGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGcc > 2:24379/1‑150 (MQ=255) acaGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGccc > 2:1585087/1‑150 (MQ=255) aGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCtt < 2:1129406/150‑1 (MQ=255) aGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCtt < 1:1630315/150‑1 (MQ=255) aTCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCg > 2:241078/1‑150 (MQ=255) cAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGaa < 1:241078/150‑1 (MQ=255) cAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGaa < 1:1216783/150‑1 (MQ=255) cGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGCCTGCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATc < 1:900690/150‑1 (MQ=255) cGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATc < 2:1363047/150‑1 (MQ=255) cGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATc < 1:1268117/150‑1 (MQ=255) gTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTca > 2:462783/1‑150 (MQ=255) taCAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTcacca < 2:1784555/150‑1 (MQ=255) aataaaaGATTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTcacca < 2:301505/147‑1 (MQ=255) aCAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTcaccac < 2:751905/150‑1 (MQ=255) cAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCa < 1:486837/86‑1 (MQ=255) cAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCa > 2:486837/1‑86 (MQ=255) cAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGa > 1:741903/1‑136 (MQ=255) cAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGa < 2:741903/136‑1 (MQ=255) aaaaGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGTCAGCCGTACGCACTTCGAAGATCCGACTcaccccga > 2:405259/1‑146 (MQ=255) aaaaGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCAccacca > 1:1197214/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCAccacca > 1:163181/1‑150 (MQ=255) 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ccANGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGcc > 2:1196939/1‑150 (MQ=255) ccACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACa < 1:307035/48‑1 (MQ=255) ccACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACa > 2:307035/1‑48 (MQ=255) ccACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATTGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGcc > 1:782140/1‑150 (MQ=255) ccACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGcc > 1:1329451/1‑150 (MQ=255) ccACGGGTTCTGCGCATAACCCTGCGCGACCGGCCACGCCCGCGAACAGGTCGAAGCCCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCTGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCCGTCACCACCAGGTCCGAAGCGCGCACCAGGTTGcc > 2:321763/1‑150 (MQ=255) 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gCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGctggtct < 2:1686423/150‑1 (MQ=255) ggcatgcccgcgaaCAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACACCAGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGctggtctggt > 2:464433‑M2/15‑150 (MQ=255) tgcccgcgaaCAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCtt < 2:69512‑M2/140‑1 (MQ=255) tgcccgcgaaCAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCtt < 1:518900‑M2/140‑1 (MQ=255) ccgcgaaCAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTTGTCTGGTGCTTGaa > 2:1694705‑M2/8‑150 (MQ=255) cgcgaaCAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCTTGAAc < 1:946920‑M2/144‑1 (MQ=255) cgcgaaCAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCTTGAAc < 1:1340497‑M2/144‑1 (MQ=255) cgcgaaCAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCTTGAAc < 1:1585087‑M2/144‑1 (MQ=255) gaaCAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCTTGAACTTg > 1:1682123‑M2/4‑150 (MQ=255) cAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCTTGAACTTGccc < 1:1196939/150‑1 (MQ=255) | GACACCAGCGCAAAAGGCACGGCCATGGCCATGTGTTTTGTCTATTGGATGCCACAGATCAAGCGTTTTTGTATACAAAAGCTTCGCGGGCATGCCTGCCCCCACGGGTTCTGCGCTTAACCCTGCGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGTCGAAGCTCAGACTTCGAGGTAGTCCAGGATACCCTCGGCAGCCGTACGCCCTTCGAAGATCGCAGTCACCACCAGGTCCGAACCGCGCACCATGTCGCCACCGGCAAACACTTTCGGGTTGCTGGTCTGGTGCTTGAACTTGCCC > NC_002947/5791810‑5792106 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |