| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,977 | C→T | 6.1% | intergenic (‑596/+35) | trmF ← / ← trmE | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein/GTPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,977 | 0 | C | T | 6.1% | 241.8 / 4.5 | 82 | intergenic (‑596/+35) | trmF/trmE | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein/GTPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/42); new base T (2/3); total (37/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
TCGAGCCCGCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAG > NC_002947/4832‑5125 | tCGAGCCCGCGAAAGGGTGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAg > 1:47926/1‑150 (MQ=255)tCGAGCCCGCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAg < 2:1869580/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGAAAGGGTGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAgc < 2:47926/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGAAAGGATGGGTACACCCACAGAGTGCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGACTGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGGATTCTTGCTAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAgc < 1:990884/150‑1 (MQ=255) cccGCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAgcg < 2:767841/150‑1 (MQ=255) gcgAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAgcggcg > 2:352480/1‑150 (MQ=255) cgAAAGCACGCGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCTTAGGGAgcggctt < 1:557801/150‑3 (MQ=255) gAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCt > 1:824606/1‑150 (MQ=255) aaGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTg < 1:488300/150‑1 (MQ=255) ggATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGc < 1:1514031/150‑1 (MQ=255) aTGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCt < 1:1659714/150‑1 (MQ=255) tACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGt > 2:752408/1‑150 (MQ=255) aTCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGc > 2:188042/1‑150 (MQ=255) tCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCt > 2:747124/1‑150 (MQ=255) cacaGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTGCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCtgt > 2:1037795/1‑150 (MQ=255) acaGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTg < 1:980458/134‑1 (MQ=255) acaGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTg > 2:980458/1‑134 (MQ=255) acaGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCtgtg > 1:487450/1‑150 (MQ=255) acaGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCtgtg > 1:681485/1‑150 (MQ=255) acaGAGAGCTGGTGTGTGGAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTAAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCtgtg < 2:48379/150‑1 (MQ=255) agagATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGa < 2:1881607/150‑1 (MQ=255) agagATCCGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGa > 2:1917333/1‑150 (MQ=255) tCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAAATAAAAAAAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACt < 2:1663315/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAAGTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGCCGCGTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTg > 1:8533/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGc < 2:254389/150‑1 (MQ=255) gCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGa > 1:549367/1‑150 (MQ=255) cTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCtt > 2:21564/1‑119 (MQ=255) cTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCtt < 1:21564/119‑1 (MQ=255) tAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAg > 1:1196829/1‑150 (MQ=255) ttCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTgg < 2:824606/150‑1 (MQ=255) ttCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTgg > 2:1408475/1‑150 (MQ=255) taaCGGGACCCCCAGCTCCAACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCGGCTTCCTTAGGAGAGACGCGGGGTCGGG‑CGTGGCACTGGAGGACCTGCCTATTCAGCAGGTGGAGaa > 2:117324/3‑150 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCtt > 1:758661/1‑102 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCtt < 2:758661/102‑1 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTg > 1:1761002/1‑103 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTg < 2:1761002/103‑1 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaaa > 2:1430917/1‑150 (MQ=255) cGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAAt < 2:197808/150‑1 (MQ=255) gggTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATc < 2:1683729/150‑1 (MQ=255) gTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCGGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCg > 1:67556/1‑150 (MQ=255) tCCAACCGCTCCCACAGGTGCATGCGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAACCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTTGAGAAAATCCGc < 2:962237/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCg > 2:354999/1‑146 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCg < 1:354999/146‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCa > 1:378667/1‑150 (MQ=255) cTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAg < 2:1143612/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAgg < 1:1917333/150‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCTTGGGTCCGCAGACTGCCTGATTCTTCTTCAACTAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTc < 2:681485/150‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑c < 2:1227156/94‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑c > 1:1227156/1‑94 (MQ=255) ccACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAg > 2:459370/1‑124 (MQ=255) ccACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAg < 1:459370/124‑1 (MQ=255) acaGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGga < 2:236872/127‑1 (MQ=255) acaGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGga > 1:236872/1‑127 (MQ=255) gggTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGACTGTGGATTACTTGCCGATCCATAAGCTGGAGTAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGaa < 1:291934/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGACGCACGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGc > 1:496753/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCt < 2:487450/150‑1 (MQ=255) gCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCtgt < 1:1172009/150‑1 (MQ=255) ccTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCtgtg < 1:1064336/150‑1 (MQ=255) gCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCt < 1:656418/75‑1 (MQ=255) gCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCt > 2:656418/1‑75 (MQ=255) gCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGAtc < 1:1037795/150‑1 (MQ=255) cagcttcgGCAACGAATTTCGGGCAAAACGCAGGCGCGGCCTTTGGGGCGTGGCTTGGCGTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTcccc < 2:496753/147‑1 (MQ=255) cttctGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGANCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAg > 1:1229826/1‑150 (MQ=255) tGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCa < 1:752408/150‑1 (MQ=255) aaCGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTc > 2:1826004/1‑110 (MQ=255) aaCGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTc < 1:1826004/110‑1 (MQ=255) tCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTg < 1:352480/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTCAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCCGTTATTGTAG‑TTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCGCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTg < 1:117324/149‑1 (MQ=255) aGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCCGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGc < 2:1213604/150‑1 (MQ=255) aGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTGG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGc > 1:1679443/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGt > 1:1149430/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGt > 2:1254304/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGc > 1:859372/1‑111 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGc < 2:859372/111‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCGCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTaa < 2:1288189/150‑1 (MQ=255) aacaaaaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAg < 1:655772/147‑1 (MQ=255) acaaaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTc < 1:1613662/148‑1 (MQ=255) agcgCCGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaa < 2:12089/71‑1 (MQ=38) agcgCCGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaa > 1:12089/4‑74 (MQ=38) gCCGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTc < 1:956642/105‑1 (MQ=255) gCCGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTc > 2:956642/1‑105 (MQ=255) cTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAg > 1:388579/1‑150 (MQ=255) cccTAAGGAGCGGCGCTTGGCGTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGaa < 2:8533/150‑1 (MQ=255) cccTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGaa < 1:747124/150‑1 (MQ=255) ccTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAg > 1:1175573/1‑150 (MQ=255) | TCGAGCCCGCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAG > NC_002947/4832‑5125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |