| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,201,488 | G→C | 5.5% | F25L (TTC→TTG) | PP_4582 ← | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,201,488 | 0 | G | C | 5.5% | 225.9 / 4.5 | 73 | F25L (TTC→TTG) | PP_4582 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/35); new base C (2/2); total (36/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.42e-01 | |||||||||||
CTTGAAAGCGACATCCAGCGCAGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTG > NC_002947/5201341‑5201635 | cttgggaGCGGCATCCCGCGCAGTGATGCCGATTGCAGGAGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCCGGAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGaa < 2:398443/144‑1 (MQ=255)cTTGAAAGCGACATCCAGCGCAGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCTGGGTTAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGaa < 1:39232/150‑1 (MQ=255)cTTGAAAGCGACATCCAGCGCAGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTTAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGaa < 1:39854/150‑1 (MQ=255)cTTGAAAGCGACATCCAGCGCAGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGaa > 1:91888/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCAGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGccc > 1:1346345/1‑141 (MQ=255) tCCAGCGCAGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGccc < 2:1346345/141‑1 (MQ=255) gtgcAGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCGGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCGACATCCAGCCGGTGAGCTAGACGCCCAGCAGCAGGCAcc > 2:485574/3‑150 (MQ=255) aGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGTCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑aa > 2:58187/1‑150 (MQ=255) tGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGTCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAggcgg < 1:58187/150‑1 (MQ=255) tGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCGTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTACGCGCAGCCAGCGCCACATCCATCCGGTGAGCTTGAAGTCCGCCAGCAGGCACCCT‑AAggcgg > 2:962195/1‑150 (MQ=255) ggCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAggcggc < 1:1603303/150‑1 (MQ=255) tGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGc < 2:120897/150‑1 (MQ=255) cAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGt > 2:1651146/1‑150 (MQ=255) aGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTa > 1:1197877/1‑150 (MQ=255) gAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGcc > 1:190022/1‑150 (MQ=255) tCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGCCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGCAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCg > 2:996877/1‑150 (MQ=255) tCCTTGACCGGGTCGACGATGGACATTTTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCg > 1:1697538/1‑150 (MQ=255) ttGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAg > 1:1863043/1‑150 (MQ=255) 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tCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACTAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCg > 2:16744/1‑150 (MQ=255) gacgaTGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAg < 1:1479346/88‑1 (MQ=255) gacgaTGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAg > 2:1479346/1‑88 (MQ=255) agggTCGGGGTCAACAGAAGCGCGGCCAGCACAACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACACCCAGACGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCg < 2:903661/148‑1 (MQ=255) gTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAACACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTc > 1:1403733/1‑150 (MQ=255) ggggTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATg < 1:1523127/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGgtgt < 2:190022/150‑1 (MQ=255) agcagcagcACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCAcc > 1:1904929/1‑88 (MQ=255) agcagcagcACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCAcc < 2:1904929/88‑1 (MQ=255) gcagcagcaCCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCATCCTGGGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCg < 1:962195/150‑1 (MQ=255) gcagcaCCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGc > 2:724280/1‑150 (MQ=255) agcaCCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCaa < 2:1697538/150‑1 (MQ=255) gcaCCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAg > 2:456686/1‑150 (MQ=255) gcaCCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAg > 1:407266/1‑150 (MQ=255) caCCGCCAGCACCGCGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑GAGGCGGCTACTGCGTACACGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGc < 2:313308/150‑1 (MQ=255) caCCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑ACGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGc < 2:307349/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAg > 2:1182617/1‑106 (MQ=255) cGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAg < 1:1182617/106‑1 (MQ=255) gCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAACCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCCgg > 1:689086/1‑150 (MQ=255) accacGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCGGCGCCAAATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCGAGAGAAGGCACCATCAAATACCCTTCGG‑AACCCATCACCTGTCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAaga > 1:1876856/1‑150 (MQ=255) cacGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACcagca > 2:1128173/1‑62 (MQ=255) cacGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACcagca < 1:1128173/62‑1 (MQ=255) acGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGAt < 1:456686/150‑1 (MQ=255) acGCGTAGCGGTTAGCACATCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGAt > 2:557271/1‑150 (MQ=255) aGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTAt < 1:420739/150‑1 (MQ=255) cGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGa < 2:1403733/150‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATa < 2:91888/150‑1 (MQ=255) tCGCGCAGCCATCGCCACATCCAGCCGGTGGGCTAGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGCCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATaaa < 1:485574/150‑1 (MQ=255) cagcGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTcc < 1:1167755/150‑1 (MQ=255) gcgcCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCgg > 2:1874901/1‑150 (MQ=255) ccACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGgcg > 1:1202394/1‑150 (MQ=255) cacaTCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGgcgc > 1:541962/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACtt > 1:1031422/1‑137 (MQ=255) aTCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACtt < 2:1031422/137‑1 (MQ=255) aTCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGNAGa < 2:1197877/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGa > 1:1233680/1‑150 (MQ=255) ctgctggTGGGCTTCAAGCTCACCGGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTcc < 1:516265/133‑1 (MQ=255) ctgctggTGGGCTTCAAGCTCACCGGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTcc > 2:516265/6‑138 (MQ=255) ctgctggTGGGCTTCAAGCTCACCGGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAg > 2:858328/6‑150 (MQ=255) aGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAgt > 2:1487773/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAgtg < 2:1548626/150‑1 (MQ=255) gTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTG > 2:1697043‑M1/1‑150 (MQ=255) tGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGC < 1:1697043‑M1/150‑1 (MQ=255) ggcTTCAAGCTCACCGGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCT < 1:858328‑M1/149‑1 (MQ=255) aGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCT < 1:1487773‑M1/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGc > 2:240311/1‑89 (MQ=255) cTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGc < 1:240311/89‑1 (MQ=255) ttGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTG > 1:377123‑M1/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTG > 1:1914881‑M1/1‑150 (MQ=255) | CTTGAAAGCGACATCCAGCGCAGTGATGGCGATTGCAGGGGCGAAGCTGTCCTTGACCGGGTCGACGATGGTCGGGGTCAGCAGCAGCACCGCCAGCACCACGCGTAGCGGTTCGCGCAGCCAGCGCCACATCCAGCCGGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCT‑AAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTG > NC_002947/5201341‑5201635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |