| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,417,431 | C→T | 9.3% | G101S (GGT→AGT) | gudD ← | bifunctional D‑glucarate dehydratase/L‑idarate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,417,431 | 0 | C | T | 9.3% | 237.8 / 11.2 | 86 | G101S (GGT→AGT) | gudD | bifunctional D‑glucarate dehydratase/L‑idarate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/41); new base T (4/4); total (41/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01 | |||||||||||
TCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGTATTGC > NC_002947/5417284‑5417580 | tCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACccg > 1:831814/1‑150 (MQ=255) tCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACccgccc > 2:170232/1‑149 (MQ=255) ccGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGt > 1:1428384/1‑150 (MQ=255) cgcgTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACTCGGCGGGTCGCggc < 2:602066/150‑2 (MQ=255) cgcgTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGt < 2:89310/150‑1 (MQ=255) cgcgTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGt < 2:831814/150‑1 (MQ=255) gcgGTGCGGGCCTTCGCCGAGCAATGCTGCCATCGGCACATTGAGGTGCGGGCCGGGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCGGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGGCCCGCCGAGTCGCGGtt < 2:484864/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTgg < 1:677379/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCACCGCCGCCTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGTCCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGaa < 2:474536/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATGCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGaa < 2:1337475/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAg < 2:1540459/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCt < 2:420130/150‑1 (MQ=255) ccAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCa > 2:1100360/1‑150 (MQ=255) aGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATg < 2:1221424/150‑1 (MQ=255) aaTGCTGCCATCGGCACATTGAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCa < 2:904139/150‑1 (MQ=255) tgctgcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCAtt < 1:618163/150‑1 (MQ=255) tgctgcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCAtt < 1:1872436/150‑1 (MQ=255) ctgcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGa < 2:475860/150‑1 (MQ=255) tgcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCGGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAg > 2:831998/1‑150 (MQ=255) gcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGc < 1:161533/150‑1 (MQ=255) gcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGc > 1:1063773/1‑150 (MQ=255) ggCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACgcgc > 2:767340/1‑150 (MQ=255) gCACAGTCAGTTGCTGGCCACGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCt > 2:1507926/1‑150 (MQ=255) cacaTTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTg < 2:1308212/150‑1 (MQ=255) acaTTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTgg > 2:999465/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAAt < 2:634364/150‑1 (MQ=255) tCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAAt < 2:1428384/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATgg < 1:1802072/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGc > 1:1759708/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTCGAGGAACTCCGACTGGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTg > 2:318763/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTg < 2:1063773/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGcc < 1:110101/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGt < 2:142585/99‑1 (MQ=255) gTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGt > 1:142585/1‑99 (MQ=255) gTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCAtt < 1:277309/114‑1 (MQ=255) gTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCAtt > 2:277309/1‑114 (MQ=255) gTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGAGCAGGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGac > 1:1454208/1‑150 (MQ=255) gAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATgg < 1:226842/130‑1 (MQ=255) gAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATgg > 2:226842/1‑130 (MQ=255) aCGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAAta < 2:251004/124‑2 (MQ=255) aCGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAAta > 1:251004/1‑123 (MQ=255) aCGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGc > 2:84174/1‑150 (MQ=255) aCGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGc > 1:375510/1‑150 (MQ=255) aCGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGACGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATTGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGc > 1:234295/1‑150 (MQ=255) tCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGGGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGc < 1:862182/130‑1 (MQ=255) tCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGGGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGc > 2:862182/1‑130 (MQ=255) tCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCg > 1:1847109/1‑150 (MQ=255) gATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGtc > 1:87887/1‑150 (MQ=255) ccGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCa < 2:1502759/150‑1 (MQ=255) ccGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCa > 2:794242/1‑150 (MQ=255) gTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAgg < 1:1695654/150‑1 (MQ=255) tACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGt < 2:1847109/150‑1 (MQ=255) aCCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTc < 1:84174/150‑1 (MQ=255) ccGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCAtt > 2:1433150/1‑85 (MQ=255) ccGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCAtt < 1:1433150/85‑1 (MQ=255) ccGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCt > 1:71676/1‑150 (MQ=255) gCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTgg > 2:432225/1‑150 (MQ=255) gCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTgg > 1:250072/1‑150 (MQ=255) cATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGc < 1:1628813/150‑1 (MQ=255) gTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATgg < 2:846748/98‑1 (MQ=255) gTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGGAATgg > 1:846748/1‑98 (MQ=255) tACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAAt > 1:2013/1‑150 (MQ=255) tACGGAAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAAt < 1:170232/150‑1 (MQ=255) ggTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAAtctt > 1:1685219/1‑150 (MQ=255) tAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAAtcttct > 1:569914/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTcgc > 1:971362/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTgg < 2:1747084/130‑1 (MQ=255) gTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTgg > 1:1747084/1‑130 (MQ=255) ccagacccTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCa > 2:1140691/8‑150 (MQ=255) aaGGGCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACt > 2:789353/1‑150 (MQ=255) aGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACtt > 2:962090/1‑150 (MQ=255) aGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACtt > 2:675528/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATTGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCTTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCa < 2:234295/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCa < 2:1350896/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCa < 2:1126151/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGtc > 1:1022327/1‑105 (MQ=255) cAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGtc < 2:1022327/105‑1 (MQ=255) ggCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGc < 2:87887/150‑1 (MQ=255) aaccGCGACTCGGCGGGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGaccac > 1:39948/3‑88 (MQ=38) aaccGCGACTCGGCGGGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGaccac < 2:39948/86‑1 (MQ=38) accGCGACTCGGCGGGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGcc > 1:727452/2‑150 (MQ=255) ccGCGACTCGGCGGGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCg > 2:571777/1‑150 (MQ=255) ccGCGACTCGGCGGGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCg < 1:571777/150‑1 (MQ=255) cgcgACTCGGCGGGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCa < 2:397966/44‑1 (MQ=18) cgcgACTCGGCGGGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCa > 1:397966/1‑44 (MQ=21) cgcgACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCgg > 2:563015/1‑150 (MQ=255) gcgACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGt < 1:999465/150‑1 (MQ=255) aCCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGTAtt < 2:1759708/150‑1 (MQ=255) ccgccgAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGTATTGc > 1:247884/1‑150 (MQ=255) | TCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGTATTGC > NC_002947/5417284‑5417580 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |