Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,472,205 | T→A | 6.7% | K95* (AAG→TAG) ‡ | rlmH ← | 23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,472,205 | 0 | T | A | 6.7% | 278.4 / 9.1 | 90 | K95* (AAG→TAG) ‡ | rlmH | 23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/46); new base A (3/3); total (41/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.65e-01 |
AGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTCGGCG > NC_002947/5472060‑5472353 | aGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCa > 1:582355/1‑150 (MQ=255) gcggcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCAt < 2:674641/150‑1 (MQ=255) cggcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCGCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCAAGCCATg < 2:1176671/150‑1 (MQ=255) gcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGTCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGa < 2:1697247/150‑1 (MQ=255) aCAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGACCGCAAGCCTCAGGCGCCAGGCCCGCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCt > 2:1163503/1‑150 (MQ=255) aGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCg > 2:1222783/1‑150 (MQ=255) gCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGa < 1:884837/150‑1 (MQ=255) gACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAgg < 2:675365/150‑1 (MQ=255) gACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAgg < 2:1761564/150‑1 (MQ=255) aaCGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGa < 1:1547173/150‑1 (MQ=255) aaCGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGCTTTAACGCCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGa < 2:1296632/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCCAT‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGc < 2:298929/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGc < 1:1312028/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGt > 1:1813962/1‑150 (MQ=255) gccgcgcgcgcAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCTGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTc < 2:937133/148‑1 (MQ=255) gcgcgcgcgcAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTcc > 1:112728/1‑150 (MQ=255) gcgcgcAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAg < 2:462198/150‑1 (MQ=255) cgcAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTTCATTAAGTG‑GCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCt > 1:1788611/1‑150 (MQ=255) cAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGc < 1:1222783/150‑1 (MQ=255) aaCCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCAc > 1:763982/1‑150 (MQ=255) ccTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCACAGGCTGCACtt > 1:1290447/1‑150 (MQ=255) cccAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCGCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACttt > 2:1763413/3‑150 (MQ=255) cTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACttt > 2:189456/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTg > 2:59423/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTg < 2:582355/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTg < 2:841188/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCAAGCCATGGa < 2:73663/112‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCAAGCCATGGa > 1:73663/1‑112 (MQ=255) cAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGc < 2:1126523/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCt < 2:1876945/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCa > 1:1756567/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCa < 2:80376/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCAt < 1:436486/150‑1 (MQ=255) ccTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCtt > 2:1311287/1‑150 (MQ=255) cTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTc < 1:1786335/150‑1 (MQ=255) cTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGAGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCCCGGTCGCCAGACGGTCGGTACTCCATGGCTTGCCATCGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTc < 1:601724/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCAt > 1:586570/1‑94 (MQ=255) tCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCAt < 2:586570/94‑1 (MQ=255) ccGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGc < 2:753365/150‑1 (MQ=255) gccgccCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCcctc < 1:1543068/150‑1 (MQ=255) caccaTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACg < 1:826933/150‑1 (MQ=255) caccaTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACg < 1:1163503/150‑1 (MQ=255) caccaTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACg < 2:1874685/150‑1 (MQ=255) ccaTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGa > 2:425485/1‑150 (MQ=255) caTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCTTGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGAt > 2:684644/1‑150 (MQ=255) caTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTc < 1:1021230/87‑1 (MQ=255) caTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAg < 1:1076728/90‑1 (MQ=255) caTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAg > 2:1076728/1‑90 (MQ=255) caTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCGGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTc > 2:1021230/1‑87 (MQ=255) aTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATc > 2:382741/1‑150 (MQ=255) aTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCGCCTGatccgtc < 1:1510672/150‑7 (MQ=255) aTCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCATCCTGACGGagc > 2:1847587/1‑148 (MQ=255) 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2:478815/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACg > 2:1166872/1‑150 (MQ=255) cAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGCGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACGTTGCTCAGCATCGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACgg < 2:203196/150‑1 (MQ=255) aGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACggg > 2:386080/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAggcggg > 1:1112239/1‑122 (MQ=255) gTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAggcggg < 2:1112239/122‑1 (MQ=255) cAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAg > 2:437799/1‑150 (MQ=255) cTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCgg > 2:1466321/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGAttt > 2:1775529/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGAttt > 2:1397477/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTcca < 1:1763413/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCAGGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGTCGGGCGACGTCGTCATTCTTGCCACGGTGATGCAGCGGGAtctcac > 2:1349735/1‑148 (MQ=255) cAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGccc > 2:469949/1‑88 (MQ=255) cAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGccc < 1:469949/88‑1 (MQ=255) cAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTccac < 1:189456/150‑1 (MQ=255) cAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTccac > 1:1458550/1‑150 (MQ=255) ctgctCGGTACTCCATAGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTGAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCTGCGGGATTACCACCAg > 2:975248/1‑150 (MQ=255) gTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGc < 2:1756567/150‑1 (MQ=255) gtCCATGGCAAGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCg > 1:1303231/2‑127 (MQ=255) gtCCATGGCAAGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCg < 2:1303231/126‑1 (MQ=255) gtCCATGGCAAGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCAACCAGCTCCAGCGAc > 1:1219007/2‑150 (MQ=255) cATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGc < 1:288943/150‑1 (MQ=255) cTTGCCATGGACCTCGAGGGCGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCATCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCATGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTcggc < 1:1249765/150‑1 (MQ=255) ttGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGGTTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTcggcg > 1:678839/1‑150 (MQ=255) | AGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAA‑TTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTCGGCG > NC_002947/5472060‑5472353 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |