| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,492,598 | A→G | 6.0% | V489A (GTG→GCG) | cobJ ← | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,492,598 | 0 | A | G | 6.0% | 240.1 / 3.7 | 83 | V489A (GTG→GCG) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/40); new base G (3/2); total (41/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 | |||||||||||
ACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAG > NC_002947/5492457‑5492746 | tgcaccgctggggcatgacttctgcgtgatgtcgctgtcggacaacctcaagccctggtcgatcattgaaaagcgcctggacctggctgcccaggccgacctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccaGGCCGCACCGAGc > 2:481462‑M1/138‑150 (MQ=255) ccATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCt > 2:1875662/1‑150 (MQ=255) ccATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCt > 1:1558435/1‑150 (MQ=255) gTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGc > 1:1334374/1‑150 (MQ=255) cgcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCggc < 2:1684729/150‑1 (MQ=255) tGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCggcctgg > 2:432954/1‑150 (MQ=255) cGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCggcctggcct < 2:194281/150‑1 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTGCTCGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCtt > 1:1861385/1‑150 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑g > 2:146916/1‑135 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑g < 1:146916/135‑1 (MQ=255) aCCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGGTGTCGGCGCACAACCTCCAGGGGCACACCGAGCT‑GGTGCggcctggcactg > 1:676378/1‑146 (MQ=255) cATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGTCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGga > 2:1402649/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCgg > 2:30984/1‑150 (MQ=255) ggCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCggg < 1:30984/150‑1 (MQ=255) gcagcaGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGt < 2:801911/150‑1 (MQ=255) cagTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTa < 2:1558435/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGaa < 1:502953/150‑1 (MQ=255) tGACTACCCTCAGCGCTGGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGAGTATCGGCACCCCGATGTCGGCCAACAACCTCCCGGGCCAAAAAGCGCT‑GGTTTGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCa < 1:1875662/150‑1 (MQ=255) gACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAg > 1:373283/1‑150 (MQ=255) tACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTc > 2:217130/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGcc > 2:336854/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCCTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGcc > 1:1921671/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCggg < 1:1392302/121‑1 (MQ=255) cAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCggg > 2:1392302/1‑121 (MQ=255) aGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTgg < 1:357002/150‑1 (MQ=255) gCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGGT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTggg > 1:313134/1‑150 (MQ=255) gTCTGCCCCGGCCTACCGCTGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCa < 1:1133253/150‑1 (MQ=255) gTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCa < 2:1334374/150‑1 (MQ=255) gTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCCTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCa < 2:1921671/150‑1 (MQ=255) tCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTTTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAg > 1:101997/1‑150 (MQ=255) ccccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCACGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAg < 2:397193/150‑1 (MQ=255) cccGGCCTGCCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCt > 1:1580244/1‑139 (MQ=255) cccGGCCTGCCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCt < 2:1580244/139‑1 (MQ=255) cccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAg > 2:1022138/1‑120 (MQ=255) cccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAg < 1:1022138/120‑1 (MQ=255) cccGGCCTACCAACGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAgg < 1:390302/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt > 1:811974/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt > 2:812642/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt < 2:664382/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt < 1:1402649/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCATGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGt > 1:151341/1‑150 (MQ=255) ggCCTACCGAGGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTCCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGCGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGCTCGGCCTAGACAGCCAGGTcc < 2:1861385/150‑1 (MQ=255) ccTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAg < 1:851015/150‑1 (MQ=255) cGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCt > 1:837427/1‑150 (MQ=255) cGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCt > 1:111115/1‑150 (MQ=255) gATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCg < 1:121600/98‑1 (MQ=255) gATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCg > 2:121600/1‑98 (MQ=255) gATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCtt > 2:353945/1‑150 (MQ=255) aTGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCttt < 1:336854/150‑1 (MQ=255) aTGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCttt < 1:217130/150‑1 (MQ=255) ccAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATc < 2:837427/150‑1 (MQ=255) cAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCg > 2:1433197/1‑150 (MQ=255) gatctcTACAGGCGTGTCCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGCACCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGTGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGa < 2:980702/145‑1 (MQ=255) aaGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGa > 1:130313/1‑150 (MQ=255) aGGACTACAGGCGTTTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGAc < 2:101997/150‑1 (MQ=255) aGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGAc < 2:130313/150‑1 (MQ=255) aGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGAc > 1:1192648/1‑150 (MQ=255) ggACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGCTc > 1:1183500/1‑146 (MQ=255) ggACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATc < 2:1183500/146‑1 (MQ=255) tACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCCCAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGAcagatc > 1:980702/1‑145 (MQ=255) tACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAggg > 1:813440/1‑150 (MQ=255) aGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCtt > 2:957483/1‑150 (MQ=255) gCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCaa > 2:1700541/1‑132 (MQ=255) gCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCaa < 1:1700541/132‑1 (MQ=255) cGTGTCCCCGTCACGATGTCGGCGCCCAACCTCCAGGGCCACACCCAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGGAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCAAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTAAg < 1:1715979/150‑1 (MQ=255) tgtTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGt < 2:811974/150‑1 (MQ=255) gtTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCAAGGAACACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGtt < 2:151341/150‑1 (MQ=255) ttCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATGGACCAGGGCTTGAGGTTg > 2:1786803/1‑150 (MQ=255) ttCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTg > 2:1515123/1‑150 (MQ=255) ttCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGATCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTg > 2:1308063/1‑150 (MQ=255) ccGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTcc < 1:1433197/150‑1 (MQ=255) ggCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGt < 1:1061396/60‑1 (MQ=255) ggCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGt > 2:1061396/1‑60 (MQ=255) acaACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAg < 1:957483/150‑1 (MQ=255) caaggccaGGCCGCACC‑AGCTCGGTGTGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCt < 2:548795‑M1/68‑1 (MQ=255) caaggccaGGCCGCACC‑AGCTCGGTGTGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCt > 1:548795‑M1/9‑76 (MQ=255) aggccaGGCCGCACC‑AGCTCGGTGTGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAg > 2:553947‑M1/7‑66 (MQ=255) aggccaGGCCGCACC‑AGCTCGGTGTGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAg < 1:553947‑M1/60‑1 (MQ=255) tCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGCAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCa > 1:96901/1‑150 (MQ=255) aGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGc < 1:353945/150‑1 (MQ=255) aGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGc < 2:813440/150‑1 (MQ=255) GCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGACAAAGTCATGcccc < 1:1239917‑M1/150‑1 (MQ=255) CACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCGGCGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAg < 1:797668‑M1/150‑1 (MQ=255) | ACCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCT‑GGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAG > NC_002947/5492457‑5492746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |