| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 378,094 | T→A | 5.7% | intergenic (+34/+31) | PP_0314 → / ← gbcA | hypothetical protein/glycine‑betaine dioxygenase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 378,094 | 0 | T | A | 5.7% | 208.1 / 4.2 | 70 | intergenic (+34/+31) | PP_0314/gbcA | hypothetical protein/glycine‑betaine dioxygenase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/35); new base A (2/2); total (33/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.42e-01 | |||||||||||
ACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACG > NC_002947/377953‑378243 | acaGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGa > 2:423541/1‑150 (MQ=255) tttGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCAt < 1:101560/150‑1 (MQ=255) ttGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAACATg < 1:102612/150‑1 (MQ=255) tGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACATCGTCTGTAG‑CCGGCTGCTGTCTCATACAGCCGGTGGCTCCTGACGTACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATgg < 1:1375457/150‑1 (MQ=255) gTCAGCTTATGAGCTTTACGGTTCGGTGCGGCGGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGc < 1:478649/150‑1 (MQ=255) aGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCggg > 2:1231215/1‑150 (MQ=255) aTGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGt < 1:693880/146‑1 (MQ=255) aTGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGt > 2:693880/1‑146 (MQ=255) gCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGt > 1:548664/1‑150 (MQ=255) aCGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTGTGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTtacta < 2:348084/150‑1 (MQ=255) aCGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTtacta < 1:1412380/150‑1 (MQ=255) ggATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATCCAGCCGGTGGCTAATGGGATACGTACGGGATTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGTGCTGCTG‑CCGAACCATGTCGGGTGCACCGGTTactcct > 1:561322/1‑150 (MQ=255) gATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTg < 1:852104/150‑1 (MQ=255) ggCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGcc < 2:1586479/150‑1 (MQ=255) gCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTgc > 1:1340614/1‑146 (MQ=255) gCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTgc < 2:1340614/146‑1 (MQ=255) cAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTg > 1:523947/1‑150 (MQ=255) cgtcgtCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCAc < 2:122165/150‑1 (MQ=255) tcgtcTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCCGCActt > 2:51397/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAACATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCa < 2:137388/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAg < 1:1431166/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCCGCACTTCTTTCAg < 1:51397/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAACGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAg > 2:358557/1‑150 (MQ=255) cGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAgg > 2:582485/1‑150 (MQ=255) cGAGCGGC‑GCTACCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCt < 2:1741171/136‑1 (MQ=255) cGAGCGGC‑GCTACCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCt > 1:1741171/1‑136 (MQ=255) gAGCGGC‑CCTATCCCATACAGCAGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGt < 1:297225/150‑1 (MQ=255) gcggc‑gCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTAt < 1:1683347/150‑1 (MQ=255) gcggc‑gCTATCCCATAAAGCCGGAGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTATGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTAt < 1:1861172/150‑1 (MQ=255) tATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCg < 1:1682774/150‑1 (MQ=255) tATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCg < 1:1682702/150‑1 (MQ=255) tCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGc > 2:1472529/1‑150 (MQ=255) ccATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGctc > 2:1673183/1‑150 (MQ=255) ccATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGctc < 2:1093537/150‑1 (MQ=255) cATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGctct > 2:1780312/1‑150 (MQ=255) cATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGctct < 1:1673183/150‑1 (MQ=255) cATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGG‑CAGCAGACCGAAGCATGGCgct > 2:1331092/1‑97 (MQ=25) cATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGG‑CAGCAGACCGAAGCATGGCgct > 2:1331058/1‑97 (MQ=25) cATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGG‑CAGCAGACCGAAGCATGGCgct < 1:1331058/99‑3 (MQ=25) cATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGG‑CAGCAGACCGAAGCATGGCgct < 1:1331092/99‑3 (MQ=25) aTACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCg < 1:1358384/96‑1 (MQ=255) aTACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCg > 2:1358384/1‑96 (MQ=255) aCAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGcc < 2:269585/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCg > 1:312775/1‑91 (MQ=255) gCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCg < 2:312775/91‑1 (MQ=255) ccGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCa < 2:1224369/150‑1 (MQ=255) gTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGgt > 1:406014/1‑150 (MQ=255) ttATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGc < 1:1420902/76‑1 (MQ=255) ttATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGc > 2:1420902/1‑76 (MQ=255) ttATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTc > 1:1798102/1‑150 (MQ=255) tacgGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGt > 2:1469305/1‑81 (MQ=255) gggAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCgg < 1:616272/116‑1 (MQ=255) gggAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCgg > 2:616272/1‑116 (MQ=255) ggAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCAcgc < 1:350684/141‑1 (MQ=255) ggAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCAcgc > 2:350684/1‑141 (MQ=255) gAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTc > 2:1445424/1‑100 (MQ=255) gAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTc < 1:1445424/100‑1 (MQ=255) gAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTa < 1:1892077/150‑1 (MQ=255) tACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCa < 1:1780312/150‑1 (MQ=255) 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gtggtgTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCGGTCAATGAAGTTcacca > 1:1726699/1‑150 (MQ=255) tgAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCaa > 2:1777550/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAAc > 2:388617/1‑150 (MQ=255) gcCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTa > 2:330423/1‑150 (MQ=255) ccATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTaa > 1:1540246/1‑150 (MQ=255) tCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCg > 2:242283/1‑150 (MQ=255) tgctg‑cCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCActtct < 1:1336295/50‑1 (MQ=255) tgctg‑cCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCActtct > 2:1336295/1‑50 (MQ=255) tgctg‑cCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACg > 1:654218/1‑150 (MQ=255) tgctg‑cCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACg > 2:798526/1‑150 (MQ=255) | ACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGC‑GCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACG > NC_002947/377953‑378243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |