| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,821,953 | T→A | 6.1% | L173Q (CTG→CAG) | metW → | methionine biosynthesis protein MetW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,821,953 | 0 | T | A | 6.1% | 249.4 / 6.6 | 84 | L173Q (CTG→CAG) | metW | methionine biosynthesis protein MetW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/33); new base A (3/2); total (48/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.39e-01 | |||||||||||
GTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGC > NC_002947/5821813‑5822093 | gTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa < 1:698864/150‑1 (MQ=255) tGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACt > 2:1175619/1‑150 (MQ=255) tGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACt > 1:454806/1‑150 (MQ=255) tGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACt > 1:454650/1‑150 (MQ=255) ggCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACtt < 2:982379/150‑1 (MQ=255) ggCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCAACTTCGCCGTATAAGAAGAACCTTGT‑‑CCCGAACTCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACtt < 1:515426/150‑1 (MQ=255) gCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTg > 2:652012/1‑150 (MQ=255) gACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACATCACTCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCa > 1:1079417/1‑150 (MQ=255) ccAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCAcc > 2:179950/1‑150 (MQ=255) cAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATTCCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCg > 1:1094974/1‑150 (MQ=255) ccGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgg > 1:378993/1‑150 (MQ=255) cGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCgg < 2:1050022/127‑1 (MQ=255) cGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCAAAGGTACTCGACCGCCTGGCgg > 1:1050022/1‑127 (MQ=255) cATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggtg > 2:1487283/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggtggg < 1:652012/150‑1 (MQ=255) ggTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGggtggggtgg > 1:1228260/1‑150 (MQ=255) ggTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGggtggggtgg < 2:454806/150‑1 (MQ=255) ggTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGggtggggtgg < 2:454650/150‑1 (MQ=255) aTCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCg > 1:624056/1‑150 (MQ=255) ggACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGGCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCt > 1:550068/1‑150 (MQ=255) gACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTa > 1:1314633/1‑150 (MQ=255) aCTTCATGCCGTATGCCTTGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTAGCAAACGCAGAA‑AG‑TATGTGGCACACACCCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGAGGTCGCCCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTAt < 1:1572243/150‑1 (MQ=255) tCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACACCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGc < 2:1094974/150‑1 (MQ=255) cATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGGCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGcc < 2:550068/150‑1 (MQ=255) ccGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGc > 2:815663/1‑101 (MQ=255) ccGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGc < 1:815663/101‑1 (MQ=255) gTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAAtct > 1:173600/1‑150 (MQ=255) gTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAAtct > 1:1184552/1‑150 (MQ=255) tataCCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGTCTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCTCGCACGCCGGGCCAAGGTACTCGCCCGCCCGGCGGTCGACCCCTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAAtctt < 2:1023392/150‑1 (MQ=255) cTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAgg > 1:311765/1‑150 (MQ=255) cTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAgg > 1:1793446/1‑150 (MQ=255) tGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt < 2:1489346/150‑1 (MQ=255) ggTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTg > 1:1236286/1‑150 (MQ=255) tACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTgag > 2:1691377/1‑150 (MQ=255) cacGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCgg < 2:1236286/150‑1 (MQ=255) gCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCg < 1:718587/86‑1 (MQ=255) gCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCg > 2:718587/1‑86 (MQ=255) ccGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATc > 2:793103/1‑150 (MQ=255) ccGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATc > 1:1745968/1‑150 (MQ=255) aTCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCAACTATGGCCTAATCTGCTAGGTGAGATCGGCATCTACcgc > 1:422748/1‑150 (MQ=255) tCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGc < 2:534604/140‑1 (MQ=255) tCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGc > 1:534604/1‑140 (MQ=255) ccACTTCGGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAG‑CTGGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCAGTCGGCCGCGTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGt < 2:1314633/150‑1 (MQ=255) aCTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTca < 2:378993/150‑1 (MQ=255) aCTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGAACACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTca > 1:125014/1‑150 (MQ=255) ttCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCAcc < 2:752386/85‑1 (MQ=255) ttCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCAcc > 1:752386/1‑85 (MQ=255) tCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGTTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTcagca > 2:1094149/1‑150 (MQ=255) tCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTcagca < 1:1733577/150‑1 (MQ=255) ccTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCgg < 1:179950/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACGGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGc < 1:1859963/150‑1 (MQ=255) cGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCa < 2:125014/150‑1 (MQ=255) ttCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCGCTTGCCCCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTAGGGCCTAATCTTGTAGGTGAGATGGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAagag > 1:678730/1‑150 (MQ=255) gaagaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTc < 2:1711375/51‑1 (MQ=255) gaagaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTc > 1:1711375/1‑51 (MQ=255) gaagaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCTGGCCTGCAAGAGCAt < 1:22441/150‑1 (MQ=255) gaagaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCAt > 1:307152/1‑150 (MQ=255) aagaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAgg > 2:458293/1‑103 (MQ=255) aagaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAgg < 1:458293/103‑1 (MQ=255) aagaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATc > 1:286754/1‑150 (MQ=255) aagaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATc > 2:1897050/1‑150 (MQ=255) agaa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCa > 2:576615/1‑150 (MQ=255) aa‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGc < 2:1106141/150‑1 (MQ=255) ttGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTcg > 2:388495/1‑150 (MQ=255) 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aGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCgg < 2:1715297/132‑1 (MQ=255) aGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCgg > 1:1715297/1‑132 (MQ=255) ggTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACg < 1:58887/138‑1 (MQ=255) ggTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACg > 2:58887/1‑138 (MQ=255) ggTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCggagga < 1:945705/150‑1 (MQ=255) ggTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCggagga > 2:1685339/1‑150 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gACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTc > 2:669558/1‑97 (MQ=255) gACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTc < 1:669558/97‑1 (MQ=255) | GTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAA‑CTTGT‑GCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGC > NC_002947/5821813‑5822093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |