| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,962,586 | G→C | 5.2% | V69V (GTG→GTC) | dapF → | diaminopimelate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,962,586 | 0 | G | C | 5.2% | 303.6 / 6.8 | 97 | V69V (GTG→GTC) | dapF | diaminopimelate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/39); new base C (2/3); total (55/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.17e-01 | |||||||||||
TGGGCTGGGCAACGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGCATCATCGTGCT > NC_002947/5962439‑5962735 | tgggctgggcAACGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGa > 1:474889/1‑150 (MQ=255) ggctgggcAACGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACt > 1:713848/1‑150 (MQ=255) ctgggcAACGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTGTACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTc > 1:1056622/1‑150 (MQ=255) tgggcAACGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGACAGCACTCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTcc < 1:1534104/150‑1 (MQ=255) ggcAACGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGCGGCGCCTAACCACCCGGAAGTGCACTTACGc < 2:72313/150‑1 (MQ=255) gcAACGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTCCACTTCCggg < 1:1219045/150‑3 (MQ=255) cGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGCTCGTCAACATGCAGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTAccc > 2:16923/1‑149 (MQ=255) gACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGc > 2:1175107/1‑150 (MQ=255) ttCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGa > 1:706380/1‑134 (MQ=255) ttCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGa < 2:706380/134‑1 (MQ=255) ttCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATc > 2:1702646/1‑150 (MQ=255) ttCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATc < 2:564104/150‑1 (MQ=255) ttCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTCCACTTCCggg > 2:1791434/1‑140 (MQ=255) ttCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTCCACTTCCggg < 1:1791434/142‑3 (MQ=255) ttCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCAACCAAGCGGCAGATTCGACCAGTTGCTGATCGTCGACGCGACGAACAACCCGGAAGTTGACTTCCGCTACCGCATc > 1:329443/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAAc > 2:1796888/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGAACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAAc > 2:1263437/1‑150 (MQ=255) tCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGGATGGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACg > 2:548551/1‑150 (MQ=255) tCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACg > 1:1139017/1‑150 (MQ=255) cTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGcc > 2:861646/1‑150 (MQ=255) cTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCAAATCCCGAAGCAAAACCCATTGTTATAA‑GATGACGACCATACCGTCTTCGACATCGCTAAGTTTCCTATCGTCGATGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGCCTTCCGATACCGCATCATCAACGcc > 1:1382661/1‑150 (MQ=255) tGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCACTGGATGTG‑CGGCCGTACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCg > 2:168270/1‑150 (MQ=255) gcccTTGTCAGCCAGACCGCGCACCTCCAGTCCTATCACGCCAAGCTATGT‑GGTGACTGCCATACCGGTGGCGGCTTCCACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGAc < 2:663906/148‑1 (MQ=255) aCCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGGAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACg > 2:1159219/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTc > 1:1521944/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTc > 1:1241268/1‑150 (MQ=255) gTCNGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACGTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTcc > 2:1193036/1‑150 (MQ=255) cagccagcACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGa < 2:478252/150‑1 (MQ=255) gccagcACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAgg < 2:1007744/150‑1 (MQ=255) ccagcACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCACGCTAGGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGt > 1:1095917/1‑150 (MQ=255) ccagcACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTCCCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAggg > 2:423733/1‑149 (MQ=255) ccagcACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGt > 2:237970/1‑150 (MQ=255) cagcACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTc < 1:1097632/150‑1 (MQ=255) cagcACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTc < 2:1581557/150‑1 (MQ=255) gcACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGa > 2:520093/1‑150 (MQ=255) acacgcACGTCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGc > 2:1324523/4‑150 (MQ=255) aCGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATc > 2:758600/1‑122 (MQ=255) aCGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATc < 1:758600/122‑1 (MQ=255) aCGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGc < 2:1758606/150‑1 (MQ=255) gcgcACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCaa > 1:647769/1‑150 (MQ=255) gcgcACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCaa > 1:671443/1‑150 (MQ=255) ccAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTg > 2:1255872/1‑150 (MQ=255) ccAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCCCTACCGCATCTTCAAc > 1:1083635/1‑113 (MQ=255) ccAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCCCTACCGCATCTTCAAc < 2:1083635/113‑1 (MQ=255) cAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAGCGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTgc > 1:781698/1‑150 (MQ=255) aGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTAGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTgcgc < 1:16923/150‑1 (MQ=255) cACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTgcgcgc < 1:1796888/150‑1 (MQ=255) cACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCAATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTgcgcgc > 2:1288235/1‑150 (MQ=255) aCGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCgct > 1:947735/1‑150 (MQ=255) aaGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCttt < 2:647769/150‑1 (MQ=255) aaTGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGccc > 2:1668694/1‑150 (MQ=255) 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tCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGa < 1:861646/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGGcc > 1:1615668/1‑150 (MQ=255) gCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCTGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCCATGCGGCAACGGTGCGCGCTTCTCTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACcg < 2:83359/150‑1 (MQ=255) gCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGATGTGGAATTCCGCTACCACATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACcg > 1:976971/1‑150 (MQ=255) gCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGATGGACAAGCGCCTGACcg > 2:1340789/1‑150 (MQ=255) 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cgtcgAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGt < 2:1521944/150‑1 (MQ=255) tcgAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACTCCTACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAgc < 2:536525/138‑1 (MQ=255) tcgAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACTCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAgc > 1:536525/1‑138 (MQ=255) tcgAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTgg > 1:636444/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGaa > 1:538283/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGaa > 1:751883/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAAc < 1:584826/150‑1 (MQ=255) gcCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCaa > 2:683561/1‑150 (MQ=255) gAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAagag < 2:1241268/150‑1 (MQ=255) aacaacCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGt > 2:827712/1‑137 (MQ=255) aacaacCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGt < 1:827712/137‑1 (MQ=255) aacaacCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGc < 1:309828/150‑1 (MQ=255) acaacCCGGAAGGGGACTTCCGCTACCGCATCTTCGACGCCGACGGCTCCGATGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGGCAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGATCg < 2:858152/150‑1 (MQ=255) aacCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAATGGCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGc < 1:1442855/150‑1 (MQ=255) aacCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGc < 1:548551/150‑1 (MQ=255) cccGGAAGTGGACTTCCGCTACCACATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGcat > 1:378295/1‑150 (MQ=255) agcGGAAGTCCACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGt > 1:1600069/3‑132 (MQ=255) agcGGAAGTCCACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGt < 2:1600069/130‑1 (MQ=255) ggAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGcatcat > 2:734208/1‑150 (MQ=255) gAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGCatcatc < 2:538283/150‑1 (MQ=255) aGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGCATCATCGt < 1:683561/150‑1 (MQ=255) ggACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGCATCATCGTGCt < 1:560158/150‑1 (MQ=255) ggACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGCATCATCGTGCt < 1:237970/150‑1 (MQ=255) | TGGGCTGGGCAACGACTTCATGGTCCTGGACCTGGTCAGCCAGCACGCGCACATCCAGCCCAAGCACGCCAAGCAATGG‑GGTGACCGCCATACCGGTGTCGGCTTCGACCAGTTGCTGATCGTCGAGGCGCCGAACAACCCGGAAGTGGACTTCCGCTACCGCATCTTCAACGCCGACGGCTCCGAGGTCGAGCAATGCGGCAACGGTGCGCGCTGCTTTGCCCGCTTCGTGCTGGACAAGCGCCTGACCGCGAAAAAGCGCATCCGCGTGGAAACCAAGAGCGGCATCATCGTGCT > NC_002947/5962439‑5962735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |